忍冬AsA-GSH途径相关基因鉴定分析及对低温的响应

发布时间：2021-04-06 21:25

　　谷胱甘肽-抗坏血酸（ascorbate-glutathione, AsA-GSH）途径在植物抗氧化过程中具有重要作用。本研究基于忍冬转录组数据,利用生物信息学的方法对AsA-GSH途径中的LAPX、RRM、G6PD、NRT和PGD调控基因进行相关分析。结果表明:LjLAPX、LjG6PD和LjNRT为不稳定的疏水蛋白, LjRRM和LjPGD为稳定的疏水蛋白。二级结构均为混合型结构,α-螺旋作为多肽链中的大量结构元件分布于整个多肽链中。利用同源建模法分析了蛋白质的三维结构。跨膜结构预测显示LjRRM、LjG6PD和LjPGD无跨膜区, LjLAPX和LjNRT分别有2个和11个跨膜区域。KEGG分析了AsA-GSH途径的代谢调控网络。基因表达分析发现,整个低温过程中LjLAPX、LjRRM、LjG6PD、LjNRT和LjPGD基因均差异表达,共同调控GSH和AsA的水平,提高植物的抗性。RT-qPCR试验进一步证明了转录组数据的可靠性。 

【文章来源】：植物生理学报. 2020,56(11)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

蛋白质的预测二级结构

跨膜结构域(trans-membrane domain,TMD)是由跨膜蛋白的效应区域所展现,其跨膜部分为β-转角或α-螺旋。对5个蛋白进行跨膜结构预测分析,结果表明,Lj RRM、Lj G6PD和Lj PGD无跨膜区,Lj LAPX和Lj NRT分别有2个和11个跨膜区域。由此可以推测Lj LAPX和Lj NRT在胞质中需要经过跨膜转运,才能催化下一步反应。图3 蛋白质的结构域分析

蛋白质的结构域分析

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3122173