根癌农杆菌趋化操纵子中甲基受体趋化蛋白编码基因atu0514的功能鉴定
发布时间：2021-04-13 16:18
根癌农杆菌属于革兰氏阴性菌,能够将自身Ti质粒上的一段T-DNA序列转移并整合到植物基因组中,从而引起多数双子叶植物产生冠瘿瘤。在自然环境中,根癌农杆菌通常位于植物的根际周围,趋化是其与宿主相互作用的重要的第一个过程。只有根癌农杆菌对宿主释放的化学信号进行趋化响应,才能与植物宿主细胞发生接触,侵染和致瘤的过程。趋化是能动细菌的一种重要的适应性行为,它能促使细菌向引诱物方向运动或远离排斥物。这些化学效应物主要被甲基受体趋化蛋白（MCP）所感知。根癌农杆菌C58的基因组中有20个编码MCP同源蛋白的基因。只有atu0514基因位于编码根癌农杆菌趋化系统的操纵子内部。与大多数细菌中的MCP不同,atu0514编码的MCP没有胞外结构域,并且由配体结构域protoglobin、HAMP和胞质信号域MA组成。因此,需要研究atu0514基因编码蛋白的功能和定位。本实验以野生型的根癌农杆菌C58为实验材料,通过无标记反向筛选的方法,获得atu0514基因缺失株,并通过质粒回补,得到回补菌株。通过对野生型菌株、atu0514突变株和回补株的生长曲线测定,发现缺失atu0514基因不影响根癌农杆菌的生...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１大肠杆菌的趋化信号通路（Ｇｕｏ?ｅｔａｌ．，?２０１７）??Ｆｉｇ?１－１?Ｃｈｅｍｏｔａｃｔｉｃ?ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ｉｎ?Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ?ｃｏｌｉ?（Ｇｕｏ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１７）??３??
??［?１－８?ＴＭ?！?Ｉ?１＞８ＴＭ?］??Ｔ?Ｔ?ｎ?（ＩＩＩ?ＩＩＩＩ??■?§?ｉ?■?Ｉ?１１?（Ｉ?ｉ?ｉ?ｉ?Ｉ??—？「Ａ…逢邏??Ｊ—Ｌ？ｇａｎ＜３?ｂｉｎｄｉｎｇ?ｄｏｍａｉｎ?＾?—?Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｄｏｍａｉｎ??Ｉ??Ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?（ＴＭ）?ｈｅｌｉｘ?｜?ＨＡＭＰ?ｒｅｇｉｏｎ?＾??Ｂａｃｔｅｒｉａ?（％）?丨￣＾?４?ＪＰ—?５?８??Ａｒｃｈａｃａ?（％）?３８?２?〇?１７?２９?＼?１４?］??图１－３基于膜拓扑结构和ＬＢＤ的甲基受体趋化蛋白的分类（Ｓａｌａｈ?ａｎｄ?Ｒｏｕｊｅｉｎｉｋｏｖａ，２０１７）??Ｆｉｇ?１－３?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍｅｔｈｙｌ?ａｃｃｅｐｔｉｎｇ?ｃｈｅｍｏｔａｃｔｉｃ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｍｅｍｂｒａｎｅ?ｔｏｐｏｌｏｇｙ??ａｎｄ?ＬＢＤ?（Ｓａｌａｈ?ａｎｄ?Ｒｏｕｊｅｉｎｉｋｏｖａ，?２０１７）??１．３．２可溶性甲基受体趋化蛋白的研宄??按照配体结合结构域（ＬＢＤ）所在的位置，可以将甲基受体趋化蛋白分为两种，??分别是跨膜受体和可溶性胞内受体。根据ＳＭＡＲＴ数据库完整基因组中的８３８４个由??ＭＡ结构域来定义的化学受体进行分析，其中，１４％的化学受体位于细胞质中并缺乏跨??膜结构域，被称为可溶性化学受体。而在古细菌中，细胞质化学感受器更为丰富，约??４３％的化学受体位于细胞质中（Ｓｃｈｕｌｔｚ?ｅｔ?ａｌ．，１９９８）。之前，细胞质化学受体被称为是??ＩＶ类化学感受器（Ｚｈｕｌｉｎ，?２００１），随后根据Ｎ端ＭＡ结构域多肽链的长度进一步分为??两类（Ｌａｃａｌｅｔａ
?第１章综述???酶活性，并且能够与染色体ＤＮＡ相互作用，从而固定受体簇的定位。??如图１－４Ｇ所示，一些胞质化学感受器具有动态定位。如黄色粘杆菌（Ａ（ｖｘｏｃｏｃｃｗ＾??ｘａｎｆ／ｍｓ）中的可溶性受体ＦｒｚＣＤ，ＦｒｚＣＤ控制细菌聚集和饥饿状态下子实体的形成??（Ｚｕｓｍａｎｅｔａｌ．，２００７）。ＦｒｚＣＤ对细胞间的相互作用非常敏感，并且横跨细胞长度以螺??旋状的细丝排列，显示了一种动态定位。■有两种形式的滑行运动，二者均依??赖于细胞的翻转而非鞭毛的运动。荧光定位显示ＦｒｚＣＤ定位于覆盖细胞长度的螺旋丝??中，并且ＦｒｚＣＤ在这些结构中是动态的，不断改变它的位置、数量和强度（Ｍｏｉｎｅｅｔａｌ．，??２０１４）。??Ｐｒｉｍａｒｉｌｙ?Ｐｏｌａｒ??Ａ．?ＨｅｍＡＴ?Ｂ?．?ＹｆｍＳ?Ｃ?．?ＩｃｐＡ、”?Ｄ．Ｍｃｐ、??Ｄｉｓｔｉｎｃｔ?ｆｒｏｍ??Ｄｉｆｆｕｓｅ?ａｎｄ?Ｐｏｌａｒ?ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?Ｄｙｎａｍｉｃ??Ｅ．ＡｅｒＣ．ａ?Ｆ．ＴＩｐＣ＾?Ｇ．?ＦｒｚＣＤ??■■■■??Ｏｘｙｇｅｎ?Ｎｉｔｒｏｇｅｎ?ｆｉｘａｔｉｏｎ??图１－４可溶性化学受体的细胞定位（Ｃｏｌｌｉｎｓ?ｅｔａｌ．，?２０１４）??Ｆｉｇ?１－４?Ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｓｏｌｕｂｌｅ?ｃｈｅｍｉｃａｌ?ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ?（Ｃｏｌｌｉｎｓ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１４）??１．４研宄目的及意义??自然环境中，根癌农杆菌通常位于植物根际附近，趋化是其与受伤的植物宿主相??互作用的第一个过程，这一过程非常重要。只有根癌农杆菌响应并趋向于植物宿主释??放的化学信号，才能与植物宿主细胞发
【参考文献】：
期刊论文
[1]农杆菌T4SS的结构及其底物转运机理的最新进展[J]. 徐丽萍,孙盼,郭敏亮. 生命科学. 2016(03)
[2]农杆菌T-复合物的形成与转运研究进展[J]. 郭敏亮,高佃坤,金英善. 生物化学与生物物理进展. 2009(11)
[3]产生无标记农杆菌突变体方法的建立及优化(英文)[J]. 郭敏亮,诸庆,高佃坤. 生物化学与生物物理进展. 2009(05)
本文编号：3135623
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１大肠杆菌的趋化信号通路（Ｇｕｏ?ｅｔａｌ．，?２０１７）??Ｆｉｇ?１－１?Ｃｈｅｍｏｔａｃｔｉｃ?ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ｉｎ?Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ?ｃｏｌｉ?（Ｇｕｏ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１７）??３??
??［?１－８?ＴＭ?！?Ｉ?１＞８ＴＭ?］??Ｔ?Ｔ?ｎ?（ＩＩＩ?ＩＩＩＩ??■?§?ｉ?■?Ｉ?１１?（Ｉ?ｉ?ｉ?ｉ?Ｉ??—？「Ａ…逢邏??Ｊ—Ｌ？ｇａｎ＜３?ｂｉｎｄｉｎｇ?ｄｏｍａｉｎ?＾?—?Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｄｏｍａｉｎ??Ｉ??Ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?（ＴＭ）?ｈｅｌｉｘ?｜?ＨＡＭＰ?ｒｅｇｉｏｎ?＾??Ｂａｃｔｅｒｉａ?（％）?丨￣＾?４?ＪＰ—?５?８??Ａｒｃｈａｃａ?（％）?３８?２?〇?１７?２９?＼?１４?］??图１－３基于膜拓扑结构和ＬＢＤ的甲基受体趋化蛋白的分类（Ｓａｌａｈ?ａｎｄ?Ｒｏｕｊｅｉｎｉｋｏｖａ，２０１７）??Ｆｉｇ?１－３?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｍｅｔｈｙｌ?ａｃｃｅｐｔｉｎｇ?ｃｈｅｍｏｔａｃｔｉｃ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｍｅｍｂｒａｎｅ?ｔｏｐｏｌｏｇｙ??ａｎｄ?ＬＢＤ?（Ｓａｌａｈ?ａｎｄ?Ｒｏｕｊｅｉｎｉｋｏｖａ，?２０１７）??１．３．２可溶性甲基受体趋化蛋白的研宄??按照配体结合结构域（ＬＢＤ）所在的位置，可以将甲基受体趋化蛋白分为两种，??分别是跨膜受体和可溶性胞内受体。根据ＳＭＡＲＴ数据库完整基因组中的８３８４个由??ＭＡ结构域来定义的化学受体进行分析，其中，１４％的化学受体位于细胞质中并缺乏跨??膜结构域，被称为可溶性化学受体。而在古细菌中，细胞质化学感受器更为丰富，约??４３％的化学受体位于细胞质中（Ｓｃｈｕｌｔｚ?ｅｔ?ａｌ．，１９９８）。之前，细胞质化学受体被称为是??ＩＶ类化学感受器（Ｚｈｕｌｉｎ，?２００１），随后根据Ｎ端ＭＡ结构域多肽链的长度进一步分为??两类（Ｌａｃａｌｅｔａ
?第１章综述???酶活性，并且能够与染色体ＤＮＡ相互作用，从而固定受体簇的定位。??如图１－４Ｇ所示，一些胞质化学感受器具有动态定位。如黄色粘杆菌（Ａ（ｖｘｏｃｏｃｃｗ＾??ｘａｎｆ／ｍｓ）中的可溶性受体ＦｒｚＣＤ，ＦｒｚＣＤ控制细菌聚集和饥饿状态下子实体的形成??（Ｚｕｓｍａｎｅｔａｌ．，２００７）。ＦｒｚＣＤ对细胞间的相互作用非常敏感，并且横跨细胞长度以螺??旋状的细丝排列，显示了一种动态定位。■有两种形式的滑行运动，二者均依??赖于细胞的翻转而非鞭毛的运动。荧光定位显示ＦｒｚＣＤ定位于覆盖细胞长度的螺旋丝??中，并且ＦｒｚＣＤ在这些结构中是动态的，不断改变它的位置、数量和强度（Ｍｏｉｎｅｅｔａｌ．，??２０１４）。??Ｐｒｉｍａｒｉｌｙ?Ｐｏｌａｒ??Ａ．?ＨｅｍＡＴ?Ｂ?．?ＹｆｍＳ?Ｃ?．?ＩｃｐＡ、”?Ｄ．Ｍｃｐ、??Ｄｉｓｔｉｎｃｔ?ｆｒｏｍ??Ｄｉｆｆｕｓｅ?ａｎｄ?Ｐｏｌａｒ?ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?Ｄｙｎａｍｉｃ??Ｅ．ＡｅｒＣ．ａ?Ｆ．ＴＩｐＣ＾?Ｇ．?ＦｒｚＣＤ??■■■■??Ｏｘｙｇｅｎ?Ｎｉｔｒｏｇｅｎ?ｆｉｘａｔｉｏｎ??图１－４可溶性化学受体的细胞定位（Ｃｏｌｌｉｎｓ?ｅｔａｌ．，?２０１４）??Ｆｉｇ?１－４?Ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｓｏｌｕｂｌｅ?ｃｈｅｍｉｃａｌ?ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ?（Ｃｏｌｌｉｎｓ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１４）??１．４研宄目的及意义??自然环境中，根癌农杆菌通常位于植物根际附近，趋化是其与受伤的植物宿主相??互作用的第一个过程，这一过程非常重要。只有根癌农杆菌响应并趋向于植物宿主释??放的化学信号，才能与植物宿主细胞发
【参考文献】：
期刊论文
[1]农杆菌T4SS的结构及其底物转运机理的最新进展[J]. 徐丽萍,孙盼,郭敏亮. 生命科学. 2016(03)
[2]农杆菌T-复合物的形成与转运研究进展[J]. 郭敏亮,高佃坤,金英善. 生物化学与生物物理进展. 2009(11)
[3]产生无标记农杆菌突变体方法的建立及优化(英文)[J]. 郭敏亮,诸庆,高佃坤. 生物化学与生物物理进展. 2009(05)
本文编号：3135623
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3135623.html
最近更新
教材专著
