男性不育患者精液来源的金黄色葡萄球菌精子制动相关基因研究
发布时间：2021-04-16 15:37
目的:分析分离自男性不育症患者精液的精子制动阳性金黄色葡萄球菌的全基因组信息,发掘可能编码导致精子制动的蛋白和基因。方法:收集分离男性不育症患者精液中的金黄色葡萄球菌（共22株）,并根据其对精子的制动能力分为精子制动阳性组与制动阴性组,随后选出各组最具有代表性的菌株MJ015（制动阳性株）与MJ163（制动阴性株）,分别提取其DNA进行全基因组测序,对获得的测序结果进行全基因组序列拼接并提交NCBI进行注释,MJ015的NCBI登录号为CP038183,MJ163的NCBI登录号为CP038229,同时使用BRIG软件进行BLAST比对并制作圈图,使用Artemis软件套装对MJ015与MJ163进行详细比对以寻找目标基因。结果:MJ015的染色体全基因组序列总长为2 784 836 bp,含有2个质粒,MJ163的染色体全基因组序列总长为2 746 673 bp,包括1个质粒,MJ015和MJ163的GC含量分别为32.13%、32.08%,MJ015和MJ163分别注释有2 921个和2 844个基因,且经过比对发现MJ015与MJ163的全基因组序列有约130 kb的序列未能比对...
【文章来源】：中华男科学杂志. 2020,26(07)北大核心CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
菌株ATCC29213、MJ015、MJ163培养物与精子相互作用后的结果
表3 MJ015全基因组溶原性噬菌体预测结果Table 3. Lysogenic phages predicted in the whole genome sequence of the MJ015 strain Region-locus Length (bp) Completeness CDS (n) Possible LP 1052044-1116531 64 400 Complete 62 PHAGE_Staphy_phiMR11_NC_010147 1854961-1886020 31 000 Incomplete 20 PHAGE_Staphy_80_NC_030652 2008364-2054815 46 400 Complete 64 PHAGE_Staphy_phiNM3_NC_008617 CDS:coding DNA sequence;LP:lysogenic phage.2.5 比对圈图绘制
ACT绘制的MJ015和MJ163基因组详细比对图(MJ163序列在上,MJ015序列在下),在2 006～2 053 kb区间的差异序列经放大后见图4,sak所在位置由红色箭头标示。图4 MJ015与MJ163的部分差异序列详细比对图
【参考文献】：
期刊论文
[1]男性不育患者精液中金黄色葡萄球菌对其精子活动力的影响[J]. 余亮亮. 中国计划生育学杂志. 2016(09)
[2]男性不育患者精液中金黄色葡萄球菌及其毒力基因对精子制动活性研究[J]. 李斌,杨旭,叶建中,陈华乐,侯渊博,杜佳,周铁丽. 中华男科学杂志. 2015(10)
[3]Do Ureaplasma urealyticum infections in the genital tract affect semen quality?[J]. Yan Wang~(1.2) Cui-Ling Liang~(2.3) Jun-Qing Wu~2 Chen Xu~4 Shi-Xiao Qin~4 Er-Sheng Gao~21 Shanghai Institute of Planned Parenthood Research,Fudan University,Shanghai 200032,China2 Department of Epidemiology,Shanghai Institute of Planned Parenthood Research,Shanghai 200032,China3 Institute of Population Studies,East China Normal University,Shanghai 200062,China4 Department of Histology and Embryology,School of Medicine,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200025,China. Asian Journal of Andrology. 2006(05)
本文编号：3141703
【文章来源】：中华男科学杂志. 2020,26(07)北大核心CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
菌株ATCC29213、MJ015、MJ163培养物与精子相互作用后的结果
表3 MJ015全基因组溶原性噬菌体预测结果Table 3. Lysogenic phages predicted in the whole genome sequence of the MJ015 strain Region-locus Length (bp) Completeness CDS (n) Possible LP 1052044-1116531 64 400 Complete 62 PHAGE_Staphy_phiMR11_NC_010147 1854961-1886020 31 000 Incomplete 20 PHAGE_Staphy_80_NC_030652 2008364-2054815 46 400 Complete 64 PHAGE_Staphy_phiNM3_NC_008617 CDS:coding DNA sequence;LP:lysogenic phage.2.5 比对圈图绘制
ACT绘制的MJ015和MJ163基因组详细比对图(MJ163序列在上,MJ015序列在下),在2 006～2 053 kb区间的差异序列经放大后见图4,sak所在位置由红色箭头标示。图4 MJ015与MJ163的部分差异序列详细比对图
【参考文献】：
期刊论文
[1]男性不育患者精液中金黄色葡萄球菌对其精子活动力的影响[J]. 余亮亮. 中国计划生育学杂志. 2016(09)
[2]男性不育患者精液中金黄色葡萄球菌及其毒力基因对精子制动活性研究[J]. 李斌,杨旭,叶建中,陈华乐,侯渊博,杜佳,周铁丽. 中华男科学杂志. 2015(10)
[3]Do Ureaplasma urealyticum infections in the genital tract affect semen quality?[J]. Yan Wang~(1.2) Cui-Ling Liang~(2.3) Jun-Qing Wu~2 Chen Xu~4 Shi-Xiao Qin~4 Er-Sheng Gao~21 Shanghai Institute of Planned Parenthood Research,Fudan University,Shanghai 200032,China2 Department of Epidemiology,Shanghai Institute of Planned Parenthood Research,Shanghai 200032,China3 Institute of Population Studies,East China Normal University,Shanghai 200062,China4 Department of Histology and Embryology,School of Medicine,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200025,China. Asian Journal of Andrology. 2006(05)
本文编号：3141703
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3141703.html
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