忽地笑LaSUVH1基因克隆与功能分析
发布时间:2021-04-24 10:07
为了深入探究忽地笑(Lycoris aurea)组蛋白赖氨酸甲基转移酶(histone lysine methyltransferase, HKMT)基因的功能,该研究根据前期转录组测序结果,采用RT-PCR方法克隆得到一个组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因LaSUVH1。序列分结果表明,LaSUVH1基因的编码区(coding sequences, CDs)序列长2 007 bp,编码668个氨基酸残基;LaSUVH1蛋白不具有信号肽结构,无跨膜结构,为亲水性蛋白,含有SET、YDG/SRA、Pre-SET和Post-SET结构域;序列比对和系统进化树分析发现,LaSUVH1与芦笋AoSUVH1-like蛋白亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析表明,LaSUVH1基因在忽地笑不同组织部位均有表达,且在叶中表达量最高。经潮霉素筛选成功获得3个反义过表达LaSUVH1的转基因拟南芥株系。进一步功能分析发现,反义过表达LaSUVH1促进了拟南芥幼苗侧根的发生,降低了拟南芥对NaCl的耐受性,增加了拟南芥种子萌发对脱落酸(ABA)的敏感性,表明LaSUVH1基因响应盐胁迫应答可能依赖ABA信号通路。
【文章来源】:西北植物学报. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 材料及处理
1.2 方 法
1.2.1 总RNA提取及cDNA第一链合成
1.2.2 LaSUVH1基因克隆
1.2.3 LaSUVH1基因的生物信息学分析
1.2.4 实时荧光定量PCR分析
1.2.5 LaSUVH1基因反义过表达载体构建及转基因拟南芥LaSUVH1转录水平与表型分析
1.3 数据处理
2 结果与分析
2.1 LaSUVH1基因克隆与序列分析
2.2 LaSUVH1基因编码蛋白的同源性及进化分析
2.3 LaSUVH1基因的组织表达分布
2.4 反义过表达LaSUVH1转基因拟南芥表型分析
2.5 反义过表达LaSUVH1基因降低拟南芥对NaCl的抗性并增加拟南芥对ABA的敏感性
3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物组蛋白赖氨酸甲基化建立过程及其遗传性研究进展[J]. 周伟,王宇,解莉楠. 生物技术通报. 2020(04)
[2]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[3]An update on histone lysine methylation in plants[J]. Yu Yu a, Zhongyuan Bu a, Wen-Hui Shen b, Aiwu Dong a,a State Key Laboratory of Genetic Engineering, Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, China b Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP), Laboratoire Propre du CNRS (UPR 2357) conventionné avec l’Université LouisPasteur Strasbourg, 67084 Strasbourg Cédex, France. Progress in Natural Science. 2009(04)
本文编号:3157173
【文章来源】:西北植物学报. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 材料及处理
1.2 方 法
1.2.1 总RNA提取及cDNA第一链合成
1.2.2 LaSUVH1基因克隆
1.2.3 LaSUVH1基因的生物信息学分析
1.2.4 实时荧光定量PCR分析
1.2.5 LaSUVH1基因反义过表达载体构建及转基因拟南芥LaSUVH1转录水平与表型分析
1.3 数据处理
2 结果与分析
2.1 LaSUVH1基因克隆与序列分析
2.2 LaSUVH1基因编码蛋白的同源性及进化分析
2.3 LaSUVH1基因的组织表达分布
2.4 反义过表达LaSUVH1转基因拟南芥表型分析
2.5 反义过表达LaSUVH1基因降低拟南芥对NaCl的抗性并增加拟南芥对ABA的敏感性
3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物组蛋白赖氨酸甲基化建立过程及其遗传性研究进展[J]. 周伟,王宇,解莉楠. 生物技术通报. 2020(04)
[2]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[3]An update on histone lysine methylation in plants[J]. Yu Yu a, Zhongyuan Bu a, Wen-Hui Shen b, Aiwu Dong a,a State Key Laboratory of Genetic Engineering, Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, China b Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP), Laboratoire Propre du CNRS (UPR 2357) conventionné avec l’Université LouisPasteur Strasbourg, 67084 Strasbourg Cédex, France. Progress in Natural Science. 2009(04)
本文编号:3157173
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3157173.html
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