用宏基因组学方法研究绿肥对水稻根际微生物磷循环功能基因的影响

发布时间：2021-04-29 21:43

　　【目的】绿肥对土壤微生物磷循环的影响受到研究者们的广泛关注,但绿肥影响土壤磷循环的微生物机理尚不明确。利用宏基因组学方法剖析长期绿肥还田对土壤磷循环功能微生物的影响,旨在阐明绿肥对土壤磷循环影响的微生物机理,为绿肥的科学利用提供依据。【方法】以中国湖南祁阳绿肥及稻草还田定位试验的水稻根际土为材料,利用宏基因组学方法,对土壤微生物DNA进行PE150 （双端读长150 bp）宏基因组测序,使用MetaWRAP软件中的read_qc模块进行质控,用assembly模块megahit方法进行组装;基于组装的较长序列（> 1000 bp）使用Diamond软件的BLASTX和UniProtKB/SWISS-PROT数据库进行序列比对,根据磷活化（磷酸酯矿化、膦酸酯矿化、无机磷溶解）、磷吸收（膦酸酯运输、磷酸酯运输和无机磷酸盐运输）和缺磷诱导响应调控三大类主要磷循环功能相关基因（重点关注的64个磷循环功能基因）进行筛选;再利用R语言进一步分析水稻根际土壤中磷循环功能基因相对丰度及其与土壤理化指标之间的关系,阐述绿肥对土壤磷循环功能微生物的影响。【结果】土壤pH等9个常规... 

【文章来源】：植物营养与肥料学报. 2020,26(09)北大核心CSCD

【文章页数】：13 页

【参考文献】：
期刊论文
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[3]生物质炭对酸性菜地土壤N2O排放及相关功能基因丰度的影响[J]. 李双双,陈晨,段鹏鹏,许欣,熊正琴.  植物营养与肥料学报. 2018(02)
[4]3种南方绿肥腐解特征及其对淹水土壤养分和酶活性的影响[J]. 高桂娟,李志丹,韩瑞宏,王俊梅.  热带作物学报. 2016(08)
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[7]连年翻压绿肥对植烟土壤微生物量及酶活性的影响[J]. 刘国顺,李正,敬海霞,叶协锋,史宏志,王永,杨超,常栋.  植物营养与肥料学报. 2010(06)
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硕士论文
[1]稻—稻—绿肥长期轮作对水稻土壤及根系细菌群落的影响[D]. 王秀呈.中国农业科学院 2015



本文编号：3168225