象山港黄墩支港菲律宾蛤仔种群COI和ITS1基因序列特征及遗传多样性分析

发布时间：2021-05-10 22:12

　　为了解象山港黄墩支港菲律宾蛤仔种质资源的遗传多样性现状,采用COI和ITS1分子标记对该种群进行了基因序列特征和遗传多样性分析.结果表明:在该种群30个个体中扩增得到的COI基因序列长度均为709 bp,ITS1序列长度范围在693～729 bp（共有746个位点）.COI基因序列的位点中有670个保守位点（占94.50%）、39个变异位点（占5.50%）; ITS1序列的位点中有保守位点671个（占89.95%）、变异位点62个（占8.31%）和缺失/插入位点13个（占1.74%）.COI基因序列的保守性高于ITS1序列.在COI基因序列中碱基（A+T）的占比（65.84%）高于（C+G）,而ITS1序列中则是碱基（A+T）占比（37.59%）低于（C+G）.COI和ITS1序列的遗传距离分析均显示群体内遗传分化不明显.基于COI基因序列和ITS1序列构建的遗传进化树显示:各科贝类分别相聚,象山港菲律宾蛤仔位于帘蛤科的分支中,其COI序列与杂色蛤进化关系最近.遗传进化树中各种贝类的聚类关系与传统分类学结果相一致,可作为分类的参考. COI和ITS1序列的平均核苷酸差异数分别为5.49... 

【文章来源】：宁波大学学报(理工版). 2020,33(06)

【文章页数】：6 页

【参考文献】：
期刊论文
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[7]基于转录组平台的蛤仔微卫星标记筛选[J]. 闫路路,秦艳杰,闫喜武,王琳楠,毕成隆,张津源.  生态学报. 2015(05)
[8]菲律宾蛤仔EST-SSRs标记开发及不同地理群体遗传多样性[J]. 闫喜武,虞志飞,秦艳杰,杨霏,王金海,张跃环,杨凤,张国范.  生态学报. 2011(15)
[9]毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析[J]. 孙桂金,潘杰,刘可春,王雪,彭维兵,何秋霞,王思锋.  生物技术通报. 2011(07)
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硕士论文
[1]黑帽悬猴（Cebus apella）线粒体基因组全序列分析和菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）群体遗传学研究[D]. 毕晓欣.鲁东大学 2012



本文编号：3180153