玉米小斑病菌（Cochliobolus heterostrophus）转录因子ChhapX基因功能初步研究

发布时间：2021-06-16 15:17

　　异旋孢腔菌（Cochliobolus heterostrophus）引起的玉米小斑病是一种重要的玉米叶部病害。目前对玉米小斑病菌致病力的研究主要集中在T和O两个生理小种的基因组获得以及T小种毒素合成的分子机制。玉米小斑病菌在侵入寄主过程中需要应对多种自身或寄主产生的应激反应,同时生产毒素,维持致病力。此过程涉及多个转录因子的参与。转录因子HapX是铁稳态的主要调节剂,对多种病原真菌维持毒力至关重要。玉米小斑病菌中的ChhapX对铁稳态及致病力的影响,以及其是否通过已证实的保守铁调节系统来响应铁离子变化协调自身铁平衡,尚不明确。本研究以玉米小斑病菌ChhapX为研究对象,建立并优化农杆菌介导的玉米小斑病菌遗传转化体系,获得ChhapX敲除突变体,分析转录因子ChhapX对玉米小斑病菌铁稳态、生长发育及致病力的影响,为明确玉米小斑病菌致病机制奠定基础。其方法及结果如下:1.玉米小斑病菌转录因子ChhapX基因序列克隆及蛋白质理化性质分析。本文根据烟曲霉（Aspergillus fumigatus）的HapX基因序列,经NCBI比对获得玉米小斑病菌ChhapX基因全序列,并对其进行生物信息学... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：82 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

ChhapX系统进化分析

第二章玉米小斑病菌ChHapX基因生物信息学分析18外显子Type碱基数BaseNumber起始密码子Startcodon终止密码子Stopcodon氨基酸个数NumberofAAIntr12649313564222.2.4理化性质分析利用ExPaSyProtparam(http://web.Expasy.org/protparam/)分析ChhapX氨基酸组成及理化性质，结果表明ChhapX等电点（pI）值为6.28，不稳定系数大于40，属于不稳定性蛋白，脂肪系数为56.52，亲水性平均值为-0.786，是亲水性蛋白。（表2-3）。表2-3ChhapX的组成及理化性质Table2-3CompositionandphysicochemicalpropertyofChhapX基因Gene氨基酸残基数Numberofaminoacids分子量Molecularweight（Da）等电点TheoreticalpI不稳定指数Instabilityindex脂肪指数Aliphaticindex亲水性平均值GrandaverageofhydropathicityChhapX42246345.996.2855.2756.52-0.7862.2.5亚细胞定位预测利用亚细胞定位网站http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/分析，结果表明ChhapX定位在细胞核上（图2-2）。图2-2ChhapX亚细胞定位预测Figure2-2SubcellularlocalizationpredictionofChhapX2.2.6跨膜结构域分析利用CBS在线预测工具（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）进行ChhapX跨膜结构域分析。结果表明，ChhapX位于膜外，不存在跨膜区（图2-3）。图2-3ChhapX蛋白跨膜结构域预测Figure2-3TransmembranedomainspredictionofChhapXprotein

第二章玉米小斑病菌ChHapX基因生物信息学分析18外显子Type碱基数BaseNumber起始密码子Startcodon终止密码子Stopcodon氨基酸个数NumberofAAIntr12649313564222.2.4理化性质分析利用ExPaSyProtparam(http://web.Expasy.org/protparam/)分析ChhapX氨基酸组成及理化性质，结果表明ChhapX等电点（pI）值为6.28，不稳定系数大于40，属于不稳定性蛋白，脂肪系数为56.52，亲水性平均值为-0.786，是亲水性蛋白。（表2-3）。表2-3ChhapX的组成及理化性质Table2-3CompositionandphysicochemicalpropertyofChhapX基因Gene氨基酸残基数Numberofaminoacids分子量Molecularweight（Da）等电点TheoreticalpI不稳定指数Instabilityindex脂肪指数Aliphaticindex亲水性平均值GrandaverageofhydropathicityChhapX42246345.996.2855.2756.52-0.7862.2.5亚细胞定位预测利用亚细胞定位网站http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/分析，结果表明ChhapX定位在细胞核上（图2-2）。图2-2ChhapX亚细胞定位预测Figure2-2SubcellularlocalizationpredictionofChhapX2.2.6跨膜结构域分析利用CBS在线预测工具（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）进行ChhapX跨膜结构域分析。结果表明，ChhapX位于膜外，不存在跨膜区（图2-3）。图2-3ChhapX蛋白跨膜结构域预测Figure2-3TransmembranedomainspredictionofChhapXprotein

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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[3]基于土壤农杆菌转化法高效构建产黄青霉tps1、tps2敲除菌及其生理特性的研究[D]. 赵骏飞.华东理工大学 2017
[4]玉米小斑病菌和弯孢霉叶斑病菌生物学特性及有效药剂和生防菌株的筛选[D]. 刘群.山东农业大学 2015
[5]黄淮海地区玉米小斑病菌变异研究[D]. 冯为民.河北大学 2012
[6]影响玉米小斑病抗性鉴定的因子分析及病菌生物学特性研究[D]. 杨丽敏.安徽农业大学 2012



本文编号：3233309