枝霉MD2的转录组测序及两个紫杉醇合成相关候选基因的过表达分析

发布时间：2021-06-24 01:47

　　紫杉醇（Taxol）是临床应用的高效、低毒的抗癌药物。产紫杉醇内生真菌是获取紫杉醇的重要药源途径之一。目前,已有55个属200多株内生真菌被报道可产紫杉醇,但是真菌中紫杉醇产量低且不稳定,尚无一株可应用于产业化生产。基于真菌紫杉醇代谢途径的定向遗传改造,构建稳定高产的基因工程菌株是实现其产业化应用的主要途径之一。筛选真菌中紫杉醇生物合成相关基因,并验证其功能,是阐明真菌紫杉醇合成的分子机制以及构建高产工程菌株的关键。本研究分析了枝状枝孢霉（Cladosporium cladosporioides;简称:枝霉）MD2的转录组信息,初步推测了枝霉MD2的紫杉醇合成途径,获得49个与其紫杉醇合成相关的unigenes;克隆了两个候选基因A05868和A02976,分别对其进行了生物信息学分析,构建其过表达载体及转基因菌株,并分析了过表达这两个候选基因对枝霉MD2紫杉烷类合成的影响。主要研究成果如下:1)采用Illumina Hiseq?2500高通量测序技术对枝菌MD2的转录组进行测序并进行系统的生物信息学分析。Trinity de novo组装得到16603个unigenes,分别在NR、... 

【文章来源】：中南民族大学湖北省

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

枝霉MD2unigenes的GO功能分类Fig.2.1GOClassifcationoftheC.cladosporioidesMD2unigenes

枝霉MD2unigenes的KOG功能分类Fig.2.2KOGclassifcationoftheC.cladosporioidesMD2unigenes

枝霉MD2unigenes的KEGG功能分类Fig.2.3KEGGclassifcationoftheC.cladosporioidesMD2unigenes(A)细胞过程;(B)环境信息处理;(C)遗传信息处理;(D)新陈代谢;(E)有机系统.每列上的数字表示该途径中的unigenes的个数

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]产紫杉醇内生真菌的遗传转化及紫杉醇合成途径相关基因的克隆[D]. 汪业春.上海交通大学 2007

硕士论文
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[3]邳半夏内生细菌多样性及其对邳半夏次生代谢产物积累的影响[D]. 张盼盼.江苏师范大学 2017
[4]党参、披针叶黄华、花锚内生真菌的分离纯化及发酵产物活性的研究[D]. 周小凯.兰州理工大学 2016
[5]产黄酮银杏内生菌的分离、鉴定与发酵条件优化研究[D]. 张海龙.南京农业大学 2014
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本文编号：3246103