茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析
发布时间：2021-06-26 05:43
基于课题组前期对茶树冷驯化系统的转录组测序分析结果,从中挑选出6条与中性/碱性转化酶基因高度相似的EST序列,电子拼接和RT-PCR验证后获得一条全长为2101 bp的核酸序列。该基因包含1923 bp的ORF,编码640个氨基酸,蛋白分子量为71.8 kD,理论等电点为5.69。根据BlastX同源性比对显示,该基因与荔枝LcNI相似性最高（80%）,为G100家族成员,属于中性/碱性转化酶基因,将其命名为CsINV10（GenBank登录号为KT359348）。对CsINV10氨基酸序列的系统进化树分析显示,其与木薯MeNINV8亲缘关系最近。进一步分析显示,CsINV10的氨基酸序列无N端信号肽,无跨膜结构域,属于亲水性蛋白,并定位在叶绿体上。荧光定量PCR分析表明,CSINV10具有组织表达特异性,在茶树叶和花中的表达量最高,根系中最低。分析发现,低温（4℃）、干旱和盐胁迫分别处理茶树1 d后,成熟叶片中CsINV10的表达呈逐渐上升趋势;而在ABA条件处理下,该基因呈先升高后降低趋势,在处理5 d后基本不表达,表明该基因可能参与茶树对多种逆境胁迫的响应,这为后续进一步研究转化...
【文章来源】：作物学报. 2016,42(03)北大核心CSCD
【文章页数】：13 页
【部分图文】：
茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10RT-PCR电泳结果Fig.1Electrophoresisresultofneutral/alkalineinvertasegeneCsINV10inteaplant
第3期钱文俊等:茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析383图5CsINV10亲水性/疏水性分析Fig.5Hydrophobicity/hydrophilicityanalysisofCsINV10图6CsINV10蛋白跨膜结构域预测Fig.6PredictionmodelfortransmenbranedomainofCsARF1protein图7CsINV10磷酸化位点预测Fig.7PhosphorylationsitespredictionofCsINV10protein图8CsINV10糖基化位点预测Fig.8GlycosylationsitespredictionofCsINV10protein2.6CsINV10基因的表达模式分析2.6.1组织表达差异性图10表明,CsINV10基因在成熟叶片和花中的表达要明显高于根系中的表达,茎干中的表达量较成熟叶片和花都要低,但也比根系中高,说明该基因在茶树中具有组织表达特异性。2.6.2不同非生物胁迫下的表达模式NaCl处理下,茶树成熟叶片中CsINV10基因表达量随着处理时间的延长呈逐渐升高趋势(图11),在处理5d后,其表达量为未处理前的13倍,差异达到显著水平。PEG条件下,叶片中该基因的表达量在处理后3h达到最大值,是处理前的5.3倍,随后又逐渐降低并在处理后1d达到最小值,而后随着处理时间的延长,表达又逐渐升高,在处理5d后其表达量又基本恢复到处理3h的水平。ABA处理下,该基因表达量在处理后3h达到最大值,随后随着处理时间的延长呈现逐步降低的趋势。低温条件下,CsINV10基因在茶树成熟叶中的表达随着处理时间的延长呈现
第3期钱文俊等:茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析383图5CsINV10亲水性/疏水性分析Fig.5Hydrophobicity/hydrophilicityanalysisofCsINV10图6CsINV10蛋白跨膜结构域预测Fig.6PredictionmodelfortransmenbranedomainofCsARF1protein图7CsINV10磷酸化位点预测Fig.7PhosphorylationsitespredictionofCsINV10protein图8CsINV10糖基化位点预测Fig.8GlycosylationsitespredictionofCsINV10protein2.6CsINV10基因的表达模式分析2.6.1组织表达差异性图10表明,CsINV10基因在成熟叶片和花中的表达要明显高于根系中的表达,茎干中的表达量较成熟叶片和花都要低,但也比根系中高,说明该基因在茶树中具有组织表达特异性。2.6.2不同非生物胁迫下的表达模式NaCl处理下,茶树成熟叶片中CsINV10基因表达量随着处理时间的延长呈逐渐升高趋势(图11),在处理5d后,其表达量为未处理前的13倍,差异达到显著水平。PEG条件下,叶片中该基因的表达量在处理后3h达到最大值,是处理前的5.3倍,随后又逐渐降低并在处理后1d达到最小值,而后随着处理时间的延长,表达又逐渐升高,在处理5d后其表达量又基本恢复到处理3h的水平。ABA处理下,该基因表达量在处理后3h达到最大值,随后随着处理时间的延长呈现逐步降低的趋势。低温条件下,CsINV10基因在茶树成熟叶中的表达随着处理时间的延长呈现
【参考文献】：
期刊论文
[1]茶树谷胱甘肽还原酶基因CsGRs的克隆与表达分析[J]. 岳川,曹红利,周艳华,王璐,郝心愿,王新超,杨亚军. 中国农业科学. 2014(16)
[2]甘蔗中性/碱性转化酶基因SoNIN1的克隆和表达分析[J]. 牛俊奇,王爱勤,黄静丽,杨丽涛,李杨瑞. 作物学报. 2014(02)
[3]茶树胆碱单加氧酶CsCMO的克隆及甜菜碱合成关键基因的表达分析[J]. 曹红利,岳川,郝心愿,王新超,杨亚军. 中国农业科学. 2013(15)
硕士论文
[1]枳中性转化酶基因PtrNINV克隆及其功能分析[D]. 王菲.华中农业大学 2013
本文编号：3250744
【文章来源】：作物学报. 2016,42(03)北大核心CSCD
【文章页数】：13 页
【部分图文】：
茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10RT-PCR电泳结果Fig.1Electrophoresisresultofneutral/alkalineinvertasegeneCsINV10inteaplant
第3期钱文俊等:茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析383图5CsINV10亲水性/疏水性分析Fig.5Hydrophobicity/hydrophilicityanalysisofCsINV10图6CsINV10蛋白跨膜结构域预测Fig.6PredictionmodelfortransmenbranedomainofCsARF1protein图7CsINV10磷酸化位点预测Fig.7PhosphorylationsitespredictionofCsINV10protein图8CsINV10糖基化位点预测Fig.8GlycosylationsitespredictionofCsINV10protein2.6CsINV10基因的表达模式分析2.6.1组织表达差异性图10表明,CsINV10基因在成熟叶片和花中的表达要明显高于根系中的表达,茎干中的表达量较成熟叶片和花都要低,但也比根系中高,说明该基因在茶树中具有组织表达特异性。2.6.2不同非生物胁迫下的表达模式NaCl处理下,茶树成熟叶片中CsINV10基因表达量随着处理时间的延长呈逐渐升高趋势(图11),在处理5d后,其表达量为未处理前的13倍,差异达到显著水平。PEG条件下,叶片中该基因的表达量在处理后3h达到最大值,是处理前的5.3倍,随后又逐渐降低并在处理后1d达到最小值,而后随着处理时间的延长,表达又逐渐升高,在处理5d后其表达量又基本恢复到处理3h的水平。ABA处理下,该基因表达量在处理后3h达到最大值,随后随着处理时间的延长呈现逐步降低的趋势。低温条件下,CsINV10基因在茶树成熟叶中的表达随着处理时间的延长呈现
第3期钱文俊等:茶树中性/碱性转化酶基因CsINV10的克隆与表达分析383图5CsINV10亲水性/疏水性分析Fig.5Hydrophobicity/hydrophilicityanalysisofCsINV10图6CsINV10蛋白跨膜结构域预测Fig.6PredictionmodelfortransmenbranedomainofCsARF1protein图7CsINV10磷酸化位点预测Fig.7PhosphorylationsitespredictionofCsINV10protein图8CsINV10糖基化位点预测Fig.8GlycosylationsitespredictionofCsINV10protein2.6CsINV10基因的表达模式分析2.6.1组织表达差异性图10表明,CsINV10基因在成熟叶片和花中的表达要明显高于根系中的表达,茎干中的表达量较成熟叶片和花都要低,但也比根系中高,说明该基因在茶树中具有组织表达特异性。2.6.2不同非生物胁迫下的表达模式NaCl处理下,茶树成熟叶片中CsINV10基因表达量随着处理时间的延长呈逐渐升高趋势(图11),在处理5d后,其表达量为未处理前的13倍,差异达到显著水平。PEG条件下,叶片中该基因的表达量在处理后3h达到最大值,是处理前的5.3倍,随后又逐渐降低并在处理后1d达到最小值,而后随着处理时间的延长,表达又逐渐升高,在处理5d后其表达量又基本恢复到处理3h的水平。ABA处理下,该基因表达量在处理后3h达到最大值,随后随着处理时间的延长呈现逐步降低的趋势。低温条件下,CsINV10基因在茶树成熟叶中的表达随着处理时间的延长呈现
【参考文献】：
期刊论文
[1]茶树谷胱甘肽还原酶基因CsGRs的克隆与表达分析[J]. 岳川,曹红利,周艳华,王璐,郝心愿,王新超,杨亚军. 中国农业科学. 2014(16)
[2]甘蔗中性/碱性转化酶基因SoNIN1的克隆和表达分析[J]. 牛俊奇,王爱勤,黄静丽,杨丽涛,李杨瑞. 作物学报. 2014(02)
[3]茶树胆碱单加氧酶CsCMO的克隆及甜菜碱合成关键基因的表达分析[J]. 曹红利,岳川,郝心愿,王新超,杨亚军. 中国农业科学. 2013(15)
硕士论文
[1]枳中性转化酶基因PtrNINV克隆及其功能分析[D]. 王菲.华中农业大学 2013
本文编号：3250744
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3250744.html
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