一株猪流行性腹泻病毒的分离培养及其ORF3、sM和N基因的序列分析

发布时间：2021-07-04 12:10

　　研究旨在克隆猪流行性腹泻病毒（PEDV）HuN-HY1902毒株N、sM、ORF3基因并进行序列分析,为PEDV的临床防控提供依据。采用Vero细胞进行病毒分离培养,免疫过氧化酶单层细胞染色法进行病毒鉴定;RT-PCR扩增PEDV HuN1902毒株N、S、sM、ORF3基因,经纯化后进行序列测定,利用DNAStar、Mega等生物信息学软件进行序列分析。R T-PCR扩增得到PEDV ORF3、N、sM片段大小依次为744 bp、1400 bp、和1100 bp。该毒株ORF3基因核苷酸序列与PEDV/USA/Missouri130/2015毒株相似性最高,为99.7%;sM基因核苷酸序列与CH/SCMY/2018和BJ-2011-1相似性最高毒株,为96.3%;N基因核苷酸序列与CH/SCMY/2018毒株相似性最高,为98.6%;ORF3、N和sM基因核苷酸序列与疫苗毒株CV777依次为96%、95.1%和93.9%。进化分析显示,该毒株的ORF3、sM和N基因的核苷酸序列与2018年流行毒株CH/SCMY/2018处于同一分支,而与经典毒株CV777、SM98的亲缘关系较远。所... 

【文章来源】：湖南畜牧兽医. 2020,(05)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

PEDV Hu N12感染Vero细胞IPMA

PCR扩增产物经1.2%的琼脂糖电泳检测，结果在约744 bp、1100 bp和1400 bp处得到了特异性的扩增条带（图2），与预期片段长度相符。PCR产物2.3 PEDV Hu N-HY1902毒株的O R F3、s M和N基因序列分析

进化分析表明，PEDV Hu N-HY1902毒株与2018年的流行毒株如CH-SCMY-2018、PEDV-MEX-QRO、处于同一分支，均属于基因Ⅰ群。与经典疫苗株CV777、SM98、DR13不在同一分支，亲缘关系较远（图5）。3 讨论

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3264763