组蛋白甲基转移酶KMT2D调控心肌细胞中HIF-1α下游基因转录的研究
发布时间:2021-07-09 06:05
背景:组蛋白甲基转移酶Histone-lysine N-methyltransferase 2D(KMT2D)是主要的组蛋白3第4位赖氨酸(Histone 3 lysine4,H3K4)甲基转移酶,在组织中广泛表达,并且在调控胚胎发育、分化和代谢过程中发挥关键作用。H3K4的甲基化(methylation)作为组蛋白修饰的一种类型,通过结合在基因的增强子与启动子区域激活基因转录。前期研究报道在小鼠胚胎期敲除Kmt2d基因会导致小鼠心脏发育不全而死亡。我们团队的研究发现,在成年小鼠心脏中特异性敲除Kmt2d,进行心梗手术后梗死面积与对照组相比明显增加,血管再生能力下降。低氧诱导因子-1α(Hypoxia-inducible factor 1,HIF-1α)是调控细胞应对低氧状态的关键转录因子,在心肌缺血缺氧条件下,HIF-1α表达上调,从而调节下游相关基因的表达,以减少心肌受损。此外,HIF-1α调控其下游基因表达存在一定的选择性,即在不同生理病理条件下对基因有不同程度的调控。有研究表明,表观遗传修饰在基因的转录调控过程中发挥重要作用,包括组蛋白甲基化、乙酰化等对HIF-1α的稳定性和转...
【文章来源】:南京中医药大学江苏省
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1心肌缺血24?h后,mllW组和mll4-cKO组小鼠心肌组织染色??
?第二部分实验结果???平,并且观察蛋白表达水平与低氧时间点的关系。因这些蛋白都表达在细胞核内,提取核??蛋白,取10?|!g进行Western?blotting检测。KMT2D蛋白分子量较大,经过探索采取浓度??为6%的分离胶进行电泳,KMT2D抗体目前市面上未销售,有戈凯教授实验室赠送。首先??对其抗体特异性进行检测,结果(图1-3)显示,KMT2D抗体可用于后续实验。结果如(图??1-4)所示:组蛋白HistoneH3作为细胞核内参蛋白,在不同时间点表达量一致;与常氧组??(Oh)相比,HIF-la在低氧处理后蛋白量积累,低氧4h时蛋白积累量升高,8h后蛋白积??累量达到最多,16h蛋白水平积累下降(图1-4A);?P300作为HIF-1转录辅助激活剂,我??们观察到P300的蛋白水平在4?h和8?h表达明显升高(图1-4B)。低氧处理后KMT2D的??蛋白水平随着低氧时间的增加,表达量明显上调(图1-4C);其催化的H3K4mel的蛋白水??平在低氧16?h明显增加(图1-4D)。??Hypoxia?0?4?8?16?24?(h)??——460KD??图1-3?KMT2D抗体特异性检测??Western?blotting检测KMT2D抗体特异性,整张膜孵ft抗体,观察足否有丨丨;特性结介。H??的蛋白分子量约为593KD,大分子量蛋白marker(LC5699)最上端条带460KD作为指示标志。??22??
?第二部分实验结果???录水平。??2.1总RNA的完整性鉴定??提取细胞的总RNA,对其进行完整性检测,同一批提取的6个样本,通过1.5%琼脂??糖凝胶电泳观察到28s条带的亮度约为18s的2倍,5s条带最弱(图2-1?),证明提取的RNA??质控合格,可继续下一步实验。??Hypoxia?0?4?8?16?24?24?(h)??kh?,/?一、二,??■■■■??^H5s??图2-1?RNA的完整性检测结果??2.2实时荧光定量PCR检测Fegf和5?/>3的mRNA表达水平??检测HIF-loc下游基因的转录活性,本实验采用qRT-PCR技术检测HIF-la的下游基因??的mRNA表达水平。因为在低氧应激状态下,机体能调动一系列与血管生成、糖代谢、细??胞凋亡等生理病理过程相关基因表达,本实验对心肌梗死损伤修复过程中,促进血管生成??过程发挥重要作用的血管内皮生长因子VEGF以及细胞凋亡过程中的关键因子BNIP3进??行检测。结果如图2-2所示,低氧处理不同时间后,设#的mRNA表达水平在低氧4?h后??显著上调且随着低氧时间的延长有逐步上升的趋势(图2-2A);?的mRNA水平在低??氧处理后有明显升高,且在16h表达量最高(图2-2B)。??24??
【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传学研究进展[J]. 丁勇,许超,吴季辉,施蕴渝,臧建业,蔡刚. 中国科学:生命科学. 2017(01)
[2]组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1抑制剂的研究进展[J]. 吴丽明,邹芳霞,席佳越,周金培,查晓明. 药学进展. 2016(07)
[3]低氧诱导因子-1与缺血性心肌损伤保护的研究进展[J]. 丁然然,哈艳平,王振良,雷洪,申志华,郭峻莉,揭伟. 中国细胞生物学学报. 2015(10)
[4]表观遗传学及其与疾病相关性[J]. 李文,边育红,褚晓倩. 中国细胞生物学学报. 2013(02)
本文编号:3273186
【文章来源】:南京中医药大学江苏省
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1心肌缺血24?h后,mllW组和mll4-cKO组小鼠心肌组织染色??
?第二部分实验结果???平,并且观察蛋白表达水平与低氧时间点的关系。因这些蛋白都表达在细胞核内,提取核??蛋白,取10?|!g进行Western?blotting检测。KMT2D蛋白分子量较大,经过探索采取浓度??为6%的分离胶进行电泳,KMT2D抗体目前市面上未销售,有戈凯教授实验室赠送。首先??对其抗体特异性进行检测,结果(图1-3)显示,KMT2D抗体可用于后续实验。结果如(图??1-4)所示:组蛋白HistoneH3作为细胞核内参蛋白,在不同时间点表达量一致;与常氧组??(Oh)相比,HIF-la在低氧处理后蛋白量积累,低氧4h时蛋白积累量升高,8h后蛋白积??累量达到最多,16h蛋白水平积累下降(图1-4A);?P300作为HIF-1转录辅助激活剂,我??们观察到P300的蛋白水平在4?h和8?h表达明显升高(图1-4B)。低氧处理后KMT2D的??蛋白水平随着低氧时间的增加,表达量明显上调(图1-4C);其催化的H3K4mel的蛋白水??平在低氧16?h明显增加(图1-4D)。??Hypoxia?0?4?8?16?24?(h)??——460KD??图1-3?KMT2D抗体特异性检测??Western?blotting检测KMT2D抗体特异性,整张膜孵ft抗体,观察足否有丨丨;特性结介。H??的蛋白分子量约为593KD,大分子量蛋白marker(LC5699)最上端条带460KD作为指示标志。??22??
?第二部分实验结果???录水平。??2.1总RNA的完整性鉴定??提取细胞的总RNA,对其进行完整性检测,同一批提取的6个样本,通过1.5%琼脂??糖凝胶电泳观察到28s条带的亮度约为18s的2倍,5s条带最弱(图2-1?),证明提取的RNA??质控合格,可继续下一步实验。??Hypoxia?0?4?8?16?24?24?(h)??kh?,/?一、二,??■■■■??^H5s??图2-1?RNA的完整性检测结果??2.2实时荧光定量PCR检测Fegf和5?/>3的mRNA表达水平??检测HIF-loc下游基因的转录活性,本实验采用qRT-PCR技术检测HIF-la的下游基因??的mRNA表达水平。因为在低氧应激状态下,机体能调动一系列与血管生成、糖代谢、细??胞凋亡等生理病理过程相关基因表达,本实验对心肌梗死损伤修复过程中,促进血管生成??过程发挥重要作用的血管内皮生长因子VEGF以及细胞凋亡过程中的关键因子BNIP3进??行检测。结果如图2-2所示,低氧处理不同时间后,设#的mRNA表达水平在低氧4?h后??显著上调且随着低氧时间的延长有逐步上升的趋势(图2-2A);?的mRNA水平在低??氧处理后有明显升高,且在16h表达量最高(图2-2B)。??24??
【参考文献】:
期刊论文
[1]表观遗传学研究进展[J]. 丁勇,许超,吴季辉,施蕴渝,臧建业,蔡刚. 中国科学:生命科学. 2017(01)
[2]组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1抑制剂的研究进展[J]. 吴丽明,邹芳霞,席佳越,周金培,查晓明. 药学进展. 2016(07)
[3]低氧诱导因子-1与缺血性心肌损伤保护的研究进展[J]. 丁然然,哈艳平,王振良,雷洪,申志华,郭峻莉,揭伟. 中国细胞生物学学报. 2015(10)
[4]表观遗传学及其与疾病相关性[J]. 李文,边育红,褚晓倩. 中国细胞生物学学报. 2013(02)
本文编号:3273186
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