BSA·QTL-seq分离控制青稞蓝粒性状的可能性候选基因HvMYC1和HvMYB1
发布时间：2021-07-24 23:21
青稞又称裸大麦,属于禾本科大麦属。有色青稞含有高水平的营养成分,如花青素、酚类化合物、蛋白质和微量元素。蓝粒青稞作为有色青稞的一类,是由花青素大量沉积于青稞糊粉层所形成的。本研究主要实验结果如下:1.采用BSA·QTL-seq方法对青稞蓝粒基因组进行了高通量测序,确定两类共7452819个SNP以及其在7条染色体上的分布情况,得到一个明显的QTL区并在该区域内预测基因853个,其中MYB和bHLH相关基因各5个。QTL区域的4个MYB基因与拟南芥中的MYB基因构建系统发育树,发现其中只有一个候选基因HvMYB1与调控花青素合成的MYB基因聚为一类。同样发现在候选基因区段中只有一个MYC候选基因HvMYC1与MYC基因聚为一类。这暗示了它们可能为控制蓝粒性状的候选基因,经过比对与先前的转录组测序研究结果一致。而且候选基因HvMYC1与HvMYB1的QTL分析结果在与蓝粒小麦性状相关的QTL巅峰区域525.9-541.7Mb之内,更加说明这两个基因极有可能为控制蓝粒性状的主效基因。2.分别对候选基因HvMYC1与HvMYB1进行序列结构分析,发现HvMYC1基因全长1668bp,编码555...
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
花青素生物合成途径Figureure1-1biosyntheticpathwayofanthocyanins
Figureure 1-1 biosynthetic pathway of anthocyan合成受结构基因和转录因子的共同控制，其中结形成相应的合成途径；转录因子调控结构基因的素的合成。目前已知花青素合成涉及三种主要子，bHLH 转录因子和 WD40 转录因子，它们共基因的启动子来发挥作用。
A B图 3-1 实验材料蓝粒青稞‘肚里黄’(A)和白粒青稞‘昆仑 1-1 Experimental material blue highland barley ‘Yellow belly’ (A)barley ‘Kunlun10’ (B)要实验试剂及仪器表 3-1 主要实验试剂Table 3-1 Main experimental reagents供应商NAprep 纯植物试剂盒 Tiangen 公司idi Purification Kit 胶回收试剂盒 天根生化科技有First Strand cDNA Synthesis KitThermo Scientif
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蔗花青素转录因子基因ScRS克隆与基因枪转化研究[J]. 刘迪,施桂姣,肖乃衍,Khalil Farghama,许跃语,陈平华,张卓,王恒波,高三基,许莉萍,张华. 热带作物学报. 2017(07)
[2]茉莉酸诱导橡胶树体细胞胚花青素的累积[J]. 畅姣,陈涛,黄天带,黄华孙,华玉伟. 基因组学与应用生物学. 2016(11)
[3]苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析[J]. 姚攀锋,赵学荣,李茂菲,王安虎,吴琦. 基因组学与应用生物学. 2016(02)
[4]水稻种皮花青素和原花青素合成相关研究进展[J]. 廖金花,刘泽厚,朱建清. 种子. 2015(09)
[5]利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点[J]. 张云辉,张所兵,林静,汪迎节,方先文. 华北农学报. 2014(02)
[6]玉米R2R3型MYB转录因子家族生物学功能综述[J]. 戴毅,高莹莹,黄泽峰,陈云,高勇. 江苏农业科学. 2013(03)
[7]黑大麦与白大麦营养成分对比分析[J]. 申晓蓉,樊梦原,陈莉,李方敏,任丽,叶永丽,韦紫玉. 西北民族大学学报(自然科学版). 2012(01)
[8]ATMYB123和ATKOR1基因参与拟南芥根发育的调控[J]. 刘忠丽,丛悦玺,苟维超,王响,陈坤明. 西北植物学报. 2012(01)
[9]植物花青素生物代谢调控[J]. 郭凤丹,王效忠,刘学英,夏晗,王兴军. 生命科学. 2011(10)
[10]黑糯大麦的品种特性及营养品质分析[J]. 张想平,雷耀湖,何庆祥,毋玲玲. 种子. 2011(09)
博士论文
[1]甘蓝类蔬菜抗根肿病基因定位、克隆及抗感材料比较转录组分析[D]. 张小丽.中国农业科学院 2017
[2]转录因子AtMYB11和AtMYB12在茄科作物上调控多酚类物质合成的研究[D]. 李洋.山东农业大学 2016
[3]ABA介导的PacMYBA调控红肉甜樱桃果实花色苷合成的研究[D]. 沈欣杰.中国农业大学 2014
[4]基于高通量测序的瓜叶菊花青素苷合成途径研究[D]. 金雪花.北京林业大学 2013
[5]类黄酮调控基因AtMYB12的异源表达及其对植物抗病性的贡献[D]. 李明.山东农业大学 2012
硕士论文
[1]青稞蓝粒性状的遗传分析及主效基因分离[D]. 赵鑫.青海师范大学 2018
[2]玉米雄穗穗颈长QTL初步定位[D]. 李晓娜.沈阳农业大学 2016
[3]水稻苗期耐旱性基因位点的发掘[D]. 姜雪.华中农业大学 2015
[4]棉花bHLH蛋白基因的克隆、表达及生物信息学分析[D]. 刘厚生.西南大学 2014
[5]拟南芥干旱诱导型启动子的克隆及功能分析[D]. 吴宪.吉林大学 2013
本文编号：3301635
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
花青素生物合成途径Figureure1-1biosyntheticpathwayofanthocyanins
Figureure 1-1 biosynthetic pathway of anthocyan合成受结构基因和转录因子的共同控制，其中结形成相应的合成途径；转录因子调控结构基因的素的合成。目前已知花青素合成涉及三种主要子，bHLH 转录因子和 WD40 转录因子，它们共基因的启动子来发挥作用。
A B图 3-1 实验材料蓝粒青稞‘肚里黄’(A)和白粒青稞‘昆仑 1-1 Experimental material blue highland barley ‘Yellow belly’ (A)barley ‘Kunlun10’ (B)要实验试剂及仪器表 3-1 主要实验试剂Table 3-1 Main experimental reagents供应商NAprep 纯植物试剂盒 Tiangen 公司idi Purification Kit 胶回收试剂盒 天根生化科技有First Strand cDNA Synthesis KitThermo Scientif
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蔗花青素转录因子基因ScRS克隆与基因枪转化研究[J]. 刘迪,施桂姣,肖乃衍,Khalil Farghama,许跃语,陈平华,张卓,王恒波,高三基,许莉萍,张华. 热带作物学报. 2017(07)
[2]茉莉酸诱导橡胶树体细胞胚花青素的累积[J]. 畅姣,陈涛,黄天带,黄华孙,华玉伟. 基因组学与应用生物学. 2016(11)
[3]苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析[J]. 姚攀锋,赵学荣,李茂菲,王安虎,吴琦. 基因组学与应用生物学. 2016(02)
[4]水稻种皮花青素和原花青素合成相关研究进展[J]. 廖金花,刘泽厚,朱建清. 种子. 2015(09)
[5]利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点[J]. 张云辉,张所兵,林静,汪迎节,方先文. 华北农学报. 2014(02)
[6]玉米R2R3型MYB转录因子家族生物学功能综述[J]. 戴毅,高莹莹,黄泽峰,陈云,高勇. 江苏农业科学. 2013(03)
[7]黑大麦与白大麦营养成分对比分析[J]. 申晓蓉,樊梦原,陈莉,李方敏,任丽,叶永丽,韦紫玉. 西北民族大学学报(自然科学版). 2012(01)
[8]ATMYB123和ATKOR1基因参与拟南芥根发育的调控[J]. 刘忠丽,丛悦玺,苟维超,王响,陈坤明. 西北植物学报. 2012(01)
[9]植物花青素生物代谢调控[J]. 郭凤丹,王效忠,刘学英,夏晗,王兴军. 生命科学. 2011(10)
[10]黑糯大麦的品种特性及营养品质分析[J]. 张想平,雷耀湖,何庆祥,毋玲玲. 种子. 2011(09)
博士论文
[1]甘蓝类蔬菜抗根肿病基因定位、克隆及抗感材料比较转录组分析[D]. 张小丽.中国农业科学院 2017
[2]转录因子AtMYB11和AtMYB12在茄科作物上调控多酚类物质合成的研究[D]. 李洋.山东农业大学 2016
[3]ABA介导的PacMYBA调控红肉甜樱桃果实花色苷合成的研究[D]. 沈欣杰.中国农业大学 2014
[4]基于高通量测序的瓜叶菊花青素苷合成途径研究[D]. 金雪花.北京林业大学 2013
[5]类黄酮调控基因AtMYB12的异源表达及其对植物抗病性的贡献[D]. 李明.山东农业大学 2012
硕士论文
[1]青稞蓝粒性状的遗传分析及主效基因分离[D]. 赵鑫.青海师范大学 2018
[2]玉米雄穗穗颈长QTL初步定位[D]. 李晓娜.沈阳农业大学 2016
[3]水稻苗期耐旱性基因位点的发掘[D]. 姜雪.华中农业大学 2015
[4]棉花bHLH蛋白基因的克隆、表达及生物信息学分析[D]. 刘厚生.西南大学 2014
[5]拟南芥干旱诱导型启动子的克隆及功能分析[D]. 吴宪.吉林大学 2013
本文编号：3301635
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