玉米EREBP-like转录因子基因ZmELF的序列变异分析

发布时间：2021-07-26 20:42

　　玉米ZmELF基因编码一个EREBP-like转录因子,含有一个AP2结构域,属于转录因子AP2/EREBP家族,对干旱响应明显。本研究对103份供试自交系的ZmELF基因进行目标序列捕获并测序,获得了1 789bp的全长序列。核苷酸多态性分析发现43个变异位点,包括42个SNPs和1个Indel。对ZmELF基因进行中性检验分析,表明该基因没有明显的人工选择痕迹。该基因的编码区共有7个变异位点,均为SNP,4个为同义位点,其余3个为非同义位点,蛋白质序列按非同义位点分为4种类型。 

【文章来源】：青岛农业大学学报(自然科学版). 2020,37(04)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

ZmELF基因序列核苷酸多样性

在编码区有7个SNPs,4个为同义位点，其他3个为非同义位点。非同义位点将导致蛋白质序列的变化。将7种编码区单倍型的核苷酸序列转为氨基酸序列发现，103个玉米自交系中的ZmHM1基因共编码了4种蛋白质序列（图4），蛋白质全长为276aa。图3 供试玉米自交系中ZmELF基因编码区单倍型分布

供试玉米自交系中ZmELF基因编码区单倍型分布

【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米ZmLBD7基因的序列变异分析[J]. 滕青,尹双义.  科技风. 2019(16)



本文编号：3304335