鱼类抗病毒基因TRIM和IFN基因克隆及功能研究
发布时间：2021-08-05 10:29
TRIM（tripartite motifs）蛋白是一类数目庞大的蛋白家族,其结构包括RING（really interesting new gene）结构域,1个或2个B-box结构域和Coiled-coil结构域,以及紧接其后的不同C端结构域。TRIM蛋白在不同的细胞过程中扮演多种重要角色,例如细胞的生长、分化、细胞凋亡和抗病毒免疫。finTRIM（fish novel large multigene TRIM genes）只在硬骨鱼类中出现,并且发挥重要的抗病毒免疫功能。干扰素（interferon,IFN）在机体抗病毒免疫反应中发挥重要的作用,能够刺激下游的多种IFN刺激基因蛋白表达进而发挥功能。TRIM蛋白属于IFN刺激基因家族的一个成员,研究TRIM和IFN的功能能够为鱼类抗病毒的防治措施提供理论基础。本研究通过系统进化分析,发现草鱼中存在鱼类TRIM14（finTRIM14/ftr14）基因、ftr51、ftr67、ftr72、ftr82、ftr83和ftr99基因,表明TRIM基因的特定谱系多样化事件的发生。因此,finTRIM基因的数量在不同的物种之间有较大差异。草鱼...
【文章来源】：长江大学湖北省
【文章页数】：118 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TRIM蛋白家族分类结构示意图
图 1-2 TRIM5α的结构模型[53]Fig. 1-2 Structure model of TRIM5α1.3 TRIM 蛋白在先天免疫中的功能在先天免疫反应中，细胞内的信号调控主要由一些翻译后修饰介导化作用，乙酰化作用和泛素化作用[54]。TRIM 蛋白家族与先天免疫的在 TRIM5α中发现具有抗一些病毒的作用，如逆转录病毒和慢病毒，体免受感染，但是在人体 TRIM5α不能够干扰 HIV 的感染[55]。TRIM5构域直接与病毒核外衣壳结合，或许接着摧毁病毒核心；TRIM5α也活 NF-κB 信号通路中的 TAK1 来抑制病毒的感染[56]。相反，一些 T先天免疫中能够帮助一些病毒逃避免疫系统的识别。甲型流感病毒非Influenza A virus nonstructural protein 1，NS1）与 TRIM25 相互作IM25 介导的 RIG-I 通路中 K63 链接的泛素化，从而抑制 RIG-I 介导[57, 58]。黄热病病毒（yellow fever virus）的非结构型 NS5 蛋白能够通过互作用抑制 IFN 信号通路[59]。TRIM19 是核体（nuclear body）的必
图 1-3 TRIM 蛋白在先天免疫系统和干扰素信号通路中的调节[65]Fig. 1-3 Regulation of TRIM in innate immunity and IFN signaling哺乳动物细胞拥有多种多样的模式识别受体来识别不同的病原，如图 1-3 所示，这些 PRRs 有些在细胞外（TLR1/2/4/5/6），有些在核内体内腔（TLR3/7/8/9）或细胞溶质部分（RIG-I/MDA5/DDX41）。TRIM5 通过 K63 交联磷酸化链的合成，这 种 磷 酸 化 链 能 够 激 活 TAK1 变 形 生 长 因 子 β 激 活 酶 1 结 合 蛋 白 1（TAK1-transfoming growth factor-β-activated kinase 1-bingding protein 1，TBK1）-TAB2 复合体，从而激活 NF-κB 信号通路[66]。TRIM38 与 TRAF6 和 TRIF 相互作用，然后介导 TRAF6 的 K48 交联多泛素化作用和 TRIF 蛋白酶体的降解，以及与 TAB2/TAB3 溶酶体降解[67, 68]。人的巨细胞病毒（human cytomagalovirus，HCMV）基因产生的 UL144 通过激活 TRAF6 依赖的方式来激活 NF-κB。TRIM23和TRAF6的相互作用是UL144介导的NF-κB产生活性的必要条件，但是TRIM23不能通过TNF或者双链RNA（dsRNA）来影响传统的NF-κB信号通路[69]。TRIM62正向调节 TLR4 信号通路中的 TRIF[70]。TRIM22 可以减少 TRAF6 的自我泛素化
【参考文献】：
期刊论文
[1]鲟细菌性败血综合征致病菌的初步研究[J]. 曹海鹏,杨先乐,高鹏,李怡,张书俊,邓璐. 淡水渔业. 2007(02)
[2]鲟鱼病毒性疾病研究进展(英文)[J]. 华育平,王荻. Journal of Forestry Research. 2005(01)
博士论文
[1]鱼类TRIM基因系统进化分析及免疫功能研究[D]. 张新尚.中国农业科学院 2015
本文编号：3323593
【文章来源】：长江大学湖北省
【文章页数】：118 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TRIM蛋白家族分类结构示意图
图 1-2 TRIM5α的结构模型[53]Fig. 1-2 Structure model of TRIM5α1.3 TRIM 蛋白在先天免疫中的功能在先天免疫反应中，细胞内的信号调控主要由一些翻译后修饰介导化作用，乙酰化作用和泛素化作用[54]。TRIM 蛋白家族与先天免疫的在 TRIM5α中发现具有抗一些病毒的作用，如逆转录病毒和慢病毒，体免受感染，但是在人体 TRIM5α不能够干扰 HIV 的感染[55]。TRIM5构域直接与病毒核外衣壳结合，或许接着摧毁病毒核心；TRIM5α也活 NF-κB 信号通路中的 TAK1 来抑制病毒的感染[56]。相反，一些 T先天免疫中能够帮助一些病毒逃避免疫系统的识别。甲型流感病毒非Influenza A virus nonstructural protein 1，NS1）与 TRIM25 相互作IM25 介导的 RIG-I 通路中 K63 链接的泛素化，从而抑制 RIG-I 介导[57, 58]。黄热病病毒（yellow fever virus）的非结构型 NS5 蛋白能够通过互作用抑制 IFN 信号通路[59]。TRIM19 是核体（nuclear body）的必
图 1-3 TRIM 蛋白在先天免疫系统和干扰素信号通路中的调节[65]Fig. 1-3 Regulation of TRIM in innate immunity and IFN signaling哺乳动物细胞拥有多种多样的模式识别受体来识别不同的病原，如图 1-3 所示，这些 PRRs 有些在细胞外（TLR1/2/4/5/6），有些在核内体内腔（TLR3/7/8/9）或细胞溶质部分（RIG-I/MDA5/DDX41）。TRIM5 通过 K63 交联磷酸化链的合成，这 种 磷 酸 化 链 能 够 激 活 TAK1 变 形 生 长 因 子 β 激 活 酶 1 结 合 蛋 白 1（TAK1-transfoming growth factor-β-activated kinase 1-bingding protein 1，TBK1）-TAB2 复合体，从而激活 NF-κB 信号通路[66]。TRIM38 与 TRAF6 和 TRIF 相互作用，然后介导 TRAF6 的 K48 交联多泛素化作用和 TRIF 蛋白酶体的降解，以及与 TAB2/TAB3 溶酶体降解[67, 68]。人的巨细胞病毒（human cytomagalovirus，HCMV）基因产生的 UL144 通过激活 TRAF6 依赖的方式来激活 NF-κB。TRIM23和TRAF6的相互作用是UL144介导的NF-κB产生活性的必要条件，但是TRIM23不能通过TNF或者双链RNA（dsRNA）来影响传统的NF-κB信号通路[69]。TRIM62正向调节 TLR4 信号通路中的 TRIF[70]。TRIM22 可以减少 TRAF6 的自我泛素化
【参考文献】：
期刊论文
[1]鲟细菌性败血综合征致病菌的初步研究[J]. 曹海鹏,杨先乐,高鹏,李怡,张书俊,邓璐. 淡水渔业. 2007(02)
[2]鲟鱼病毒性疾病研究进展(英文)[J]. 华育平,王荻. Journal of Forestry Research. 2005(01)
博士论文
[1]鱼类TRIM基因系统进化分析及免疫功能研究[D]. 张新尚.中国农业科学院 2015
本文编号：3323593
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3323593.html
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