西瓜GAPDH基因家族的鉴定与功能的初步分析
发布时间:2021-08-08 13:00
西瓜是我国重要的经济作物,其栽培面积和产量均居世界第一位。近年来,随着设施栽培面积的扩大,选育高抗、广适和优质的西瓜品种已成为现在亟待解决的问题之一。目前,西瓜的全基因组测序已经完成,但后续关于基因功能的研究相对落后,尤其是针对西瓜抗逆相关基因功能的研究仍不明了。此外,西瓜遗传背景相对狭窄。因此,研究和利用抗性相关基因,不但可以指导西瓜抗逆新品种的选育,并能为抗性机制的解析提供理论基础。3-磷酸甘油醛脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)是细胞内糖代谢过程中一个组成性表达蛋白,参与细胞中糖酵解途径,与ATP的合成密切相关。通常GAPDH在生物体内的含量较为丰富,它也通常被看作是一种内参蛋白。本文通过筛选和鉴定葫芦科主要作物西瓜、甜瓜、黄瓜和南瓜的GAPDH基因家族成员,比较了不同物种间的家族进化关系;同时针对西瓜GAPDH基因家族在非生物胁迫和生物胁迫等方面的非糖酵解功能进行了初步验证,并克隆了西瓜GAPDH家族中的逆境响应基因ClaGAPDH3、ClaGAPDH4和ClaGAPDH5;为了进一步验证其功能,初步构建了GA...
【文章来源】:河南农业大学河南省
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
植物中的GAPDH(①GAPC;②GAPAIB;③NP-GAPDH;④GAPCp)(引自张秀红,2010)
图 1-2 植物中的 GAPCs 的代谢调控模式图Figure 1-2 the metabolic regulation pattern chart of GAPCs gene in pl脱氢酶(GAPDH)曾被认为是一个简单的管家基因。近年来环境中能够特异性表达,通过改变细胞膜的状态来抵抗外
图 2-4 葫芦科主要作物 GAPDH 基因结构图Figure 2-4 GAPDH genetic structure不同物种名称的对应缩写如下:At 代表拟南芥;Cla 代表西瓜;Cme 代表甜瓜;Csa 代表黄瓜;Cmo 代表南瓜;黄色代表 CDS,蓝色代表上下游,一代表内含子。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦UROS基因的可变剪接[J]. 郎丹莹,吕庚寅,梁广旺,李瑞航,郭晓光,徐虹,郭蔼光. 麦类作物学报. 2016(12)
[2]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析[J]. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 热带作物学报. 2016(09)
[3]太子参GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 龙登凯,丁铃,李军,周涛,江维克,肖承鸿. 河南农业科学. 2016(07)
[4]西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析[J]. 何洁,顾秀容,魏春华,杨小振,李好,马建祥,张勇,杨建强,张显. 园艺学报. 2016(02)
[5]我国西瓜品种选育研究进展[J]. 刘文革,何楠,赵胜杰,路绪强. 中国瓜菜. 2016(01)
[6]羊蹄GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 任聪,黄五星,张翔,邵惠芳,许自成. 河南农业科学. 2015(02)
[7]香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析[J]. 史后蕊,冯仁军,王静毅,柴娟,任梦云,卢利方,张银东. 热带作物学报. 2014(06)
[8]黄瓜、甜瓜和西瓜MLO基因家族的比较基因组学分析[J]. 徐坚,陈先知,王燕,史建磊,朱隆静,王克磊. 核农学报. 2014(06)
[9]刺五加GAPDH基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析[J]. 修乐山,柴丽花,周秘,邢朝斌. 广东农业科学. 2013(16)
[10]植物甘油醛-3-磷酸脱氢酶作用机制的研究进展[J]. 卢倩,弭晓菊,崔继哲. 生物技术通报. 2013(08)
博士论文
[1]水稻胞质3-磷酸甘油醛脱氢酶基因家族的分离和功能分析[D]. 张秀红.武汉大学 2011
硕士论文
[1]生长素相关转录因子家族基因在西瓜果实膨大过程中的调控作用分析[D]. 袁静贤.华中农业大学 2015
[2]长武134小麦GAPDH基因过表达载体的构建及拟南芥的遗传转化[D]. 张阳璞.西北农林科技大学 2014
[3]玉米苗期干旱胁迫下可变剪接及其调控因子的研究[D]. 李娇.郑州大学 2013
[4]抗旱小麦长武134 GAPDH基因的表达及克隆[D]. 崔丽荣.西北农林科技大学 2010
本文编号:3330002
【文章来源】:河南农业大学河南省
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
植物中的GAPDH(①GAPC;②GAPAIB;③NP-GAPDH;④GAPCp)(引自张秀红,2010)
图 1-2 植物中的 GAPCs 的代谢调控模式图Figure 1-2 the metabolic regulation pattern chart of GAPCs gene in pl脱氢酶(GAPDH)曾被认为是一个简单的管家基因。近年来环境中能够特异性表达,通过改变细胞膜的状态来抵抗外
图 2-4 葫芦科主要作物 GAPDH 基因结构图Figure 2-4 GAPDH genetic structure不同物种名称的对应缩写如下:At 代表拟南芥;Cla 代表西瓜;Cme 代表甜瓜;Csa 代表黄瓜;Cmo 代表南瓜;黄色代表 CDS,蓝色代表上下游,一代表内含子。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小麦UROS基因的可变剪接[J]. 郎丹莹,吕庚寅,梁广旺,李瑞航,郭晓光,徐虹,郭蔼光. 麦类作物学报. 2016(12)
[2]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析[J]. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 热带作物学报. 2016(09)
[3]太子参GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 龙登凯,丁铃,李军,周涛,江维克,肖承鸿. 河南农业科学. 2016(07)
[4]西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析[J]. 何洁,顾秀容,魏春华,杨小振,李好,马建祥,张勇,杨建强,张显. 园艺学报. 2016(02)
[5]我国西瓜品种选育研究进展[J]. 刘文革,何楠,赵胜杰,路绪强. 中国瓜菜. 2016(01)
[6]羊蹄GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 任聪,黄五星,张翔,邵惠芳,许自成. 河南农业科学. 2015(02)
[7]香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析[J]. 史后蕊,冯仁军,王静毅,柴娟,任梦云,卢利方,张银东. 热带作物学报. 2014(06)
[8]黄瓜、甜瓜和西瓜MLO基因家族的比较基因组学分析[J]. 徐坚,陈先知,王燕,史建磊,朱隆静,王克磊. 核农学报. 2014(06)
[9]刺五加GAPDH基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析[J]. 修乐山,柴丽花,周秘,邢朝斌. 广东农业科学. 2013(16)
[10]植物甘油醛-3-磷酸脱氢酶作用机制的研究进展[J]. 卢倩,弭晓菊,崔继哲. 生物技术通报. 2013(08)
博士论文
[1]水稻胞质3-磷酸甘油醛脱氢酶基因家族的分离和功能分析[D]. 张秀红.武汉大学 2011
硕士论文
[1]生长素相关转录因子家族基因在西瓜果实膨大过程中的调控作用分析[D]. 袁静贤.华中农业大学 2015
[2]长武134小麦GAPDH基因过表达载体的构建及拟南芥的遗传转化[D]. 张阳璞.西北农林科技大学 2014
[3]玉米苗期干旱胁迫下可变剪接及其调控因子的研究[D]. 李娇.郑州大学 2013
[4]抗旱小麦长武134 GAPDH基因的表达及克隆[D]. 崔丽荣.西北农林科技大学 2010
本文编号:3330002
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