多小穗小麦种质10-A穗部相关性状的基因定位
发布时间:2021-08-12 15:10
小麦是世界上重要的粮食作物之一。小麦穗部性状对小麦最终产量的形成具有重要贡献。其中,小穗数、千粒重和芒长是小麦穗部性状的重要组成。本研究采用集群分离分析(bulked segregant analysis,BSA)法,利用小麦660K SNP芯片,对多小穗种质10-A构建的10-A/BE89 F7 RIL群体的小穗数和芒长,10-A/B39 F6 RIL群体的千粒重和芒长进行了初步的基因定位,并结合qRT-PCR分析筛选候选基因,为相关性状的精细定位、基因克隆和分子标记辅助育种奠定基础。本研究主要研究结果如下:(1)田间性状调查表明,10-A与BE89和B39在小穗数、千粒重和芒长均存在显著差异。群体10-A/BE89 F7的平均小穗数和芒长分别为22.35和3.63cm,变异系数为10.55%和63.67%,群体10-A/B39 F6平均千粒重和芒长分别为47.3g和3.78cm,变异系数为21.47%和72.81%。选择群体中各性状30个极大值系和30个极小值系分别组成极值混合池。利用小麦660...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图13个亲本植株与穗子的表型比较
20图2目标性状频率分布直方图Fig.2Frequencydistributionoftrait注:a和b分别是10-A/BE89群体小穗数和芒长的频率分布直方图;c和d分别是10-A/B39群体千粒重和芒长的频率分布直方图。表2亲本间多态性SNP位点在基因组上的分布Table2DidtributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents同源染色体10-A/BE8910-A/B39ABD总计ABD总计143718813175621220514656324544659510143212237161533192761016962808656512104518341208791861271632952614104471515629824478617516731373149612523574001498863727718927493总计256419965105070158119683743923百分比(%)50.639.410.140.350.29.5
22图3亲本间多态性SNP位点在染色体上的分布Fig.3DistributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents注:a和b是10-A/BE89群体中,亲本间具有多态性的SNP位点在基因组上分布的直方图和折线图;c和d是10-A/B39群体中,亲本本具有多态性的SNP位点在基因组上分布的直方图和折线图。3.3BSA分析3.3.1候选区域的分析在10-A/BE89和10-A/B39群体中,亲本间具有多态性,且有染色体位置信息的SNP位点分别有5070个和3923个。在筛选出亲本间的多态性SNP的基础上,进一步分析目标性状混合池,得到混合池间具有差异SNP(表3)。(1)对于10-A/BE89群体,在小穗数的两个极端混合池之间有差异SNP位点有186个,已有相应的染色体信息有177个,在6B染色体上的差异SNP标记最多,为38个,在4D染色体上没有差异SNP位点,在7B和7D上仅有一个1个差异SNP位点;在芒长的两个极端混合池之间有差异的SNP位点有77个,已有相应的染色体信息的有76个,在7B染色体上有差异SNP标记最多,有15个,总共有4个染色体(1A,1D,3D和6D)上没有差异SNP标记,在4A和4D染色体上仅仅只有1个差异SNP位点。(2)对于10-A/B39群体,在千粒重的两个极端
本文编号:3338550
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图13个亲本植株与穗子的表型比较
20图2目标性状频率分布直方图Fig.2Frequencydistributionoftrait注:a和b分别是10-A/BE89群体小穗数和芒长的频率分布直方图;c和d分别是10-A/B39群体千粒重和芒长的频率分布直方图。表2亲本间多态性SNP位点在基因组上的分布Table2DidtributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents同源染色体10-A/BE8910-A/B39ABD总计ABD总计143718813175621220514656324544659510143212237161533192761016962808656512104518341208791861271632952614104471515629824478617516731373149612523574001498863727718927493总计256419965105070158119683743923百分比(%)50.639.410.140.350.29.5
22图3亲本间多态性SNP位点在染色体上的分布Fig.3DistributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents注:a和b是10-A/BE89群体中,亲本间具有多态性的SNP位点在基因组上分布的直方图和折线图;c和d是10-A/B39群体中,亲本本具有多态性的SNP位点在基因组上分布的直方图和折线图。3.3BSA分析3.3.1候选区域的分析在10-A/BE89和10-A/B39群体中,亲本间具有多态性,且有染色体位置信息的SNP位点分别有5070个和3923个。在筛选出亲本间的多态性SNP的基础上,进一步分析目标性状混合池,得到混合池间具有差异SNP(表3)。(1)对于10-A/BE89群体,在小穗数的两个极端混合池之间有差异SNP位点有186个,已有相应的染色体信息有177个,在6B染色体上的差异SNP标记最多,为38个,在4D染色体上没有差异SNP位点,在7B和7D上仅有一个1个差异SNP位点;在芒长的两个极端混合池之间有差异的SNP位点有77个,已有相应的染色体信息的有76个,在7B染色体上有差异SNP标记最多,有15个,总共有4个染色体(1A,1D,3D和6D)上没有差异SNP标记,在4A和4D染色体上仅仅只有1个差异SNP位点。(2)对于10-A/B39群体,在千粒重的两个极端
本文编号:3338550
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