水稻温敏核不育系HD9802S不育基因的定位
发布时间：2021-08-28 00:41
粮食的增产方向有种质资源的发掘、新的基因和杂种优势的利用。水稻的自花授粉给水稻杂交带来了难题,而水稻雄性不育很好地解决了这个问题。两系法很好地利用了杂种优势,它的优点在于:一、一系两用。二、充分利用遗传资源,更易于筛选出优势组合。三、不育性状易于转育。四、核不育系简化了繁殖程序。湖北大学遗传学研究室的HD9802S为本研究中所用到的温敏核不育系,其不育基因在之前的研究中被命名为HDtms。本研究采用两种不同的方法对不育基因HDtms进行定位:第一种方法是以HD9802S/（HD9802S/R287）BC1群体为材料结合SSR标记法进行遗传图谱的构建,并且筛选出与不育基因紧密连锁可以运用于分子标记辅助选择的SSR标记。第二种方法是以HD9802S/R287F2群体为材料结合BSA重测序法,对候选区间内可以引起功能突变的SNP或者InDel进行筛选与分析。具体的研究结果有以下几点:1、对HD9802S/（HD9802S/R287）BC1群体进行花粉育性鉴定,采用了两种标准划分不育株与可育株,经卡方检验,不育株与可育株的分离均符合1:l的理论比例,表明HD9802S的不育性由一对主效隐性核基...
【文章来源】：湖北大学湖北省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?ＨＤ９８０２Ｓ／?（ＨＤ９８０２Ｓ／Ｒ２８７）?ＢＣ！群体花粉可染率分布??注：横坐标为花粉可染率，纵坐标为每个花粉可染区间分布的植株数量
２．２结果与分析??２．２．１育性分离模式分析??根据ＢＣ！群体中５８９个单株的花粉镜检结果，以花粉可染率来划分区间。由图２－１??可以明显看到出现了两个育性峰值，其中“０”和“＜５％”区间组成第一峰，“７０％－８０％”和??“?＞?８０％”区间组成第二峰，表示主效基因发挥重要作用；“５％－１０％”、“?１０％－２０％”、??“２０％－３０％”、“３０％－４０％”、“４０％－５０％”、“５０％－６０％”、“６０％－７０％”七个区间组成峰谷，??每个区间均有植株分布，表示ＨＤ９８０２Ｓ的不育性受到微效基因的影响。??本研究采取两种不同划分方法来分析：１．以花粉可染率＜５％区间分布的植株作为??不育株，以花粉可染率＞５％区间分布的植株作为可育株；２．仍以花粉可染率＜５％区间??分布的植株作为不育株，以花粉可染率＞４０％区间分布的植株作为可育株，花粉可染率??５％？４０％区间分布的植株作为过渡带不整合入统计。将以上两种划分方法的统计结果列??于表２－１，当ｘ２＜Ｘ２〇．〇５时，则：６（：１花粉育性分离比例符合１：?１，当Ｐ值为０．０５时，对??应的Ｘ２ｇ．〇５山＝３．８４。通过卡方检验发现两种划分方法的卡方值分别为０．８９０和２．２５０
？?－??图２－２农业部水稻品种鉴定推荐的４８个位点的ＳＳＲ标记在ＨＤ９８０２Ｓ和Ｒ２８７间的多态??性??注：泳道卜９６为以农业部水稻品种鉴定推荐的４８个位点的ＳＳＲ标记为引物分别对ＨＤ９８０２Ｓ和Ｒ２８７的ＤＮＡ进行??扩增的条带？，１－４８为４８对ＳＳＲ标记的编号，红色编号及蓝色划线标注对应的是有明显多态性的ＳＳＲ标记。??为了得到涵盖水稻１２条染色体长臂短臂上的ＳＳＲ标记，从ＧＲＡＭＥＮＥ数据库??（ｈｔｔｐ：?／／ｗｗｗ．ｇｒａｍｅｎｅ．ｏｒｇ／）和?ＲＡＰ?数据库（ｈｔｔｐ：?／／ｒａｐｄｂ．ｄｎａ．ａｆｆｒｃ．ｇｏ．ｊｐ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍＬ）补??充７个ＳＳＲ标记：位于第２号染色体上的ＲＭ５７０７、ＲＭ５８９７，位于第３号染色体上的??ＲＭ２３１、ＲＭ１６８，位于第７号染色体上的ＲＭ４８１，位于第８号染色体上的ＲＭ１５２，位??于第９号染色体上ＲＭ１０５。结果如
【参考文献】：
期刊论文
[1]高通量转录组测序技术在植物雄性不育研究中的应用[J]. 刘永明,张玲,邱涛,赵卓凡,曹墨菊. 遗传. 2016(08)
[2]测序技术的研究进展及三代测序的应用[J]. 乌日拉嘎,徐海燕,冯淑贞,孙志宏,孟和毕力格,张和平. 中国乳品工业. 2016(04)
[3]小麦生理型雄性不育系中反式烯脂酰-CoA还原酶基因（TaECR）的克隆及表达分析[J]. 巴青松,张改生,车会学,刘红占,张龙雨,王书平. 农业生物技术学报. 2013(07)
[4]第三代测序基本原理[J]. 李明爽,赵敏. 现代生物医学进展. 2012(10)
[5]Fine mapping and candidate gene prediction of the photoperiod and thermo-sensitive genic male sterile gene pms1（t） in rice[J]. Yuan-fei ZHOU,Xian-yin ZHANG,Qing-zhong XUE (Department of Agronomy,College of Agriculture and Biotechnology,Zhejiang University,Hangzhou 310029,China). Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2011(06)
[6]光温敏核不育水稻的研究进展[J]. 陈云风. 宜春学院学报. 2010(08)
[7]水稻光温敏雄性核不育系广占63S不育基因PTGMS2-1的遗传分析与分子定位[J]. 王宝和,徐建军,吴银慧,朱金燕,李生强,周勇,程小涛,梁国华. 中国水稻科学. 2010(04)
[8]SNP标记技术及其在农作物育种中的应用[J]. 李兆波,吴禹,王岩,汪由,王光霞. 辽宁农业职业技术学院学报. 2010(03)
[9]水稻光温敏核不育机理设想及光温敏核不育系选育策略[J]. 陈立云,肖应辉. 中国水稻科学. 2010(02)
[10]ISSR分子标记技术在植物种质资源研究中的应用[J]. 朱岩芳,祝水金,李永平,马文广,郑昀晔,胡晋. 种子. 2010(02)
博士论文
[1]白背飞虱基因组测序及其受南方水稻黑条矮缩病毒侵染的转录组分析[D]. 唐楠.中国科学技术大学 2017
[2]水稻光敏感雄性核不育基因pms1的克隆与功能分析[D]. 范优荣.华中农业大学 2016
[3]水稻温敏雄性不育基因tms9-1的定位及单糖转运体基因对育性和灌浆的影响[D]. 祁永斌.浙江大学 2014
[4]利用高通量测序技术研究基因组复制与关系以及可变剪切[D]. 王海峰.复旦大学 2014
[5]水稻光温敏核雄性不育遗传及基因定位研究[D]. 周元飞.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于HRM技术的水稻全基因组SNP标记开发及其初步应用[D]. 郭海洋.华南农业大学 2016
[2]水稻光温敏核不育绵9S的遗传分析与基因定位[D]. 赵敏会.四川农业大学 2012
[3]水稻野栽远源杂交来源的温敏核雄性不育基因tms7的精细定位[D]. 邹丹妮.海南大学 2011
[4]利用SSR分子标记定位水稻短光敏雄性不育基因[D]. 马栋.华中农业大学 2010
[5]水稻雄性不育系和保持系花培的比较研究[D]. 张保兰.西南农业大学 2003
[6]光敏核不育水稻基因pms1物理图谱的构建及候选基因的确定[D]. 刘南.华中农业大学 2000
本文编号：3367432
【文章来源】：湖北大学湖北省
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－１?ＨＤ９８０２Ｓ／?（ＨＤ９８０２Ｓ／Ｒ２８７）?ＢＣ！群体花粉可染率分布??注：横坐标为花粉可染率，纵坐标为每个花粉可染区间分布的植株数量
２．２结果与分析??２．２．１育性分离模式分析??根据ＢＣ！群体中５８９个单株的花粉镜检结果，以花粉可染率来划分区间。由图２－１??可以明显看到出现了两个育性峰值，其中“０”和“＜５％”区间组成第一峰，“７０％－８０％”和??“?＞?８０％”区间组成第二峰，表示主效基因发挥重要作用；“５％－１０％”、“?１０％－２０％”、??“２０％－３０％”、“３０％－４０％”、“４０％－５０％”、“５０％－６０％”、“６０％－７０％”七个区间组成峰谷，??每个区间均有植株分布，表示ＨＤ９８０２Ｓ的不育性受到微效基因的影响。??本研究采取两种不同划分方法来分析：１．以花粉可染率＜５％区间分布的植株作为??不育株，以花粉可染率＞５％区间分布的植株作为可育株；２．仍以花粉可染率＜５％区间??分布的植株作为不育株，以花粉可染率＞４０％区间分布的植株作为可育株，花粉可染率??５％？４０％区间分布的植株作为过渡带不整合入统计。将以上两种划分方法的统计结果列??于表２－１，当ｘ２＜Ｘ２〇．〇５时，则：６（：１花粉育性分离比例符合１：?１，当Ｐ值为０．０５时，对??应的Ｘ２ｇ．〇５山＝３．８４。通过卡方检验发现两种划分方法的卡方值分别为０．８９０和２．２５０
？?－??图２－２农业部水稻品种鉴定推荐的４８个位点的ＳＳＲ标记在ＨＤ９８０２Ｓ和Ｒ２８７间的多态??性??注：泳道卜９６为以农业部水稻品种鉴定推荐的４８个位点的ＳＳＲ标记为引物分别对ＨＤ９８０２Ｓ和Ｒ２８７的ＤＮＡ进行??扩增的条带？，１－４８为４８对ＳＳＲ标记的编号，红色编号及蓝色划线标注对应的是有明显多态性的ＳＳＲ标记。??为了得到涵盖水稻１２条染色体长臂短臂上的ＳＳＲ标记，从ＧＲＡＭＥＮＥ数据库??（ｈｔｔｐ：?／／ｗｗｗ．ｇｒａｍｅｎｅ．ｏｒｇ／）和?ＲＡＰ?数据库（ｈｔｔｐ：?／／ｒａｐｄｂ．ｄｎａ．ａｆｆｒｃ．ｇｏ．ｊｐ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍＬ）补??充７个ＳＳＲ标记：位于第２号染色体上的ＲＭ５７０７、ＲＭ５８９７，位于第３号染色体上的??ＲＭ２３１、ＲＭ１６８，位于第７号染色体上的ＲＭ４８１，位于第８号染色体上的ＲＭ１５２，位??于第９号染色体上ＲＭ１０５。结果如
【参考文献】：
期刊论文
[1]高通量转录组测序技术在植物雄性不育研究中的应用[J]. 刘永明,张玲,邱涛,赵卓凡,曹墨菊. 遗传. 2016(08)
[2]测序技术的研究进展及三代测序的应用[J]. 乌日拉嘎,徐海燕,冯淑贞,孙志宏,孟和毕力格,张和平. 中国乳品工业. 2016(04)
[3]小麦生理型雄性不育系中反式烯脂酰-CoA还原酶基因（TaECR）的克隆及表达分析[J]. 巴青松,张改生,车会学,刘红占,张龙雨,王书平. 农业生物技术学报. 2013(07)
[4]第三代测序基本原理[J]. 李明爽,赵敏. 现代生物医学进展. 2012(10)
[5]Fine mapping and candidate gene prediction of the photoperiod and thermo-sensitive genic male sterile gene pms1（t） in rice[J]. Yuan-fei ZHOU,Xian-yin ZHANG,Qing-zhong XUE (Department of Agronomy,College of Agriculture and Biotechnology,Zhejiang University,Hangzhou 310029,China). Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2011(06)
[6]光温敏核不育水稻的研究进展[J]. 陈云风. 宜春学院学报. 2010(08)
[7]水稻光温敏雄性核不育系广占63S不育基因PTGMS2-1的遗传分析与分子定位[J]. 王宝和,徐建军,吴银慧,朱金燕,李生强,周勇,程小涛,梁国华. 中国水稻科学. 2010(04)
[8]SNP标记技术及其在农作物育种中的应用[J]. 李兆波,吴禹,王岩,汪由,王光霞. 辽宁农业职业技术学院学报. 2010(03)
[9]水稻光温敏核不育机理设想及光温敏核不育系选育策略[J]. 陈立云,肖应辉. 中国水稻科学. 2010(02)
[10]ISSR分子标记技术在植物种质资源研究中的应用[J]. 朱岩芳,祝水金,李永平,马文广,郑昀晔,胡晋. 种子. 2010(02)
博士论文
[1]白背飞虱基因组测序及其受南方水稻黑条矮缩病毒侵染的转录组分析[D]. 唐楠.中国科学技术大学 2017
[2]水稻光敏感雄性核不育基因pms1的克隆与功能分析[D]. 范优荣.华中农业大学 2016
[3]水稻温敏雄性不育基因tms9-1的定位及单糖转运体基因对育性和灌浆的影响[D]. 祁永斌.浙江大学 2014
[4]利用高通量测序技术研究基因组复制与关系以及可变剪切[D]. 王海峰.复旦大学 2014
[5]水稻光温敏核雄性不育遗传及基因定位研究[D]. 周元飞.浙江大学 2007
硕士论文
[1]基于HRM技术的水稻全基因组SNP标记开发及其初步应用[D]. 郭海洋.华南农业大学 2016
[2]水稻光温敏核不育绵9S的遗传分析与基因定位[D]. 赵敏会.四川农业大学 2012
[3]水稻野栽远源杂交来源的温敏核雄性不育基因tms7的精细定位[D]. 邹丹妮.海南大学 2011
[4]利用SSR分子标记定位水稻短光敏雄性不育基因[D]. 马栋.华中农业大学 2010
[5]水稻雄性不育系和保持系花培的比较研究[D]. 张保兰.西南农业大学 2003
[6]光敏核不育水稻基因pms1物理图谱的构建及候选基因的确定[D]. 刘南.华中农业大学 2000
本文编号：3367432
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