青海湖裸鲤AP-1基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-09-06 22:00

　　AP-1是细胞增殖和分化的重要转录因子,在动物免疫、发育等方面发挥着重要作用。本研究采用RACE方法克隆了青海湖裸鲤AP-1基因的c DNA全长序列,通过实时荧光定量PCR探究了其在不同组织中的表达情况。结果显示,青海湖裸鲤AP-1的cDNA序列全长为1 832 bp,CDS区918 bp,共编码305个氨基酸,预测该蛋白的分子量为33.69 kD,等电点9.20。系统进化结果显示青海湖裸鲤与犀角金线鲃有较高的同源性。蛋白结构预测显示该基因编码的蛋白C端具有一个典型的碱性区和一个高度保守的亮氨酸拉链结构,该结构能与DNA相结合。qRT-PCR结果表明,AP-1基因在肌肉、肝脏、鳃、心、肾、脑、肠和脾脏中均有表达。在肌肉中具有最高表达量（p<0.01）,其次为肝脏和鳃（p<0.01）,在脾脏中表达量最低。本研究为进一步了解青海湖裸鲤AP-1基因的功能提供了数据基础。 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(07)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

AP-1蛋白的三级结构

实时定量PCR结果显示，该基因在肌肉、肝脏、鳃、心、脑、肠、肾和脾脏中都有表达，表达具有普遍性。吴冰等(2014)在对凡纳滨对虾进行研究时，得出结论AP-1表达于多种组织中，不存在组织表达的特异性，且具有普遍的表达性。但在不同的组织中其表达量不同，在肌肉中表达量最高，脾脏中表达量最低。Baresic等(2014)研究表明，AP-1含有的JUN和ATF蛋白复合物在肌肉细胞中的表达量是最高的，激活蛋白1复合物(AP-1)在肌肉中的高表达对于过氧化物酶体增殖激活受体辅激活因子1 (PGC-1)调控缺氧反应基因起到重要作用，AP-1与PGC-1的相互作用对缺氧反应起到协同作用，该基因缺失会降低PGC-1对靶基因的正向调控能力。因此，表明AP-1基因在肌肉中表达量较高，这与本实验得出的AP-1基因在肌肉中的表达量是最高的结论一致。也有研究表明，AP-1基因在青蛤5个组织中的表达时，得出在闭壳肌中该基因的表达量排第二，是比较高的，与本实验结果也有相似之处(丁丹等,2018)。Zoysa等(2010)在研究鲍鱼免疫相关基因的表达时，检测出AP-1在肌肉和鳃中有高表达量，这与本实验结果相一致。AP-1是与免疫相关的基因，本研究中AP-1基因在鳃中的表达量比较高，而在脾脏中的表达量相对较低。因此，推测AP-1在青海湖裸鲤中可能只参与了部分免疫过程。图5 基于青海湖裸鲤AP-1氨基酸序列的系统进化树

基于青海湖裸鲤AP-1氨基酸序列的系统进化树

【参考文献】：
期刊论文
[1]《转录因子JunB/AP-1调节多发性骨髓瘤在骨髓微环境中的细胞增殖与耐药》解读[J]. 范凤娟,江沁月,孙春艳,胡豫.  临床血液学杂志. 2018(04)
[2]中华蜜蜂转录因子AP-1基因的克隆及特性分析[J]. 郗学鹏,魏伟,张卫星,王红芳,胥保华.  昆虫学报. 2018(04)
[3]青蛤（Cyclina sinensis）AP-1基因的克隆及在鳗弧菌（Vibrio anguillarum）侵染下的表达分析[J]. 丁丹,潘宝平,王玉梅,侯梓园,闫春财.  海洋与湖沼. 2018(01)
[4]AP-1的研究进展[J]. 伍培,赵建美.  南通大学学报(医学版). 2018(01)
[5]凡纳滨对虾AP-1基因的克隆和表达特征分析[J]. 吴冰,刘逸尘,张亦陈,耿绪云,孙金生.  水产学报. 2014(09)
[6]青海湖裸鲤与花斑裸鲤肌肉理化特性比较[J]. 孙万成,申志新,罗毅皓,王国杰.  食品研究与开发. 2013(14)



本文编号：3388250