杉木磷转运蛋白ClPht1;2基因克隆与表达特性分析
发布时间：2021-09-11 10:25
磷酸转运蛋白PHT1家族是介导植物磷素吸收与转运分配的重要基因家族。从第3代杉木优良无性系洋061中克隆获得1个杉木磷转运蛋白ClPht1;2,并对不同程度磷胁迫下ClPht1;2的时空表达进行分析,为了解杉木磷转运蛋白基因结构和功能表达奠定基础。以转录组测序获得的ClPht1;2核心序列为基础,以杉木洋061无性系根系cDNA克隆为模板,利用cDNA末端快速扩增技术（RACE）克隆目的基因的全长,采用实时荧光定量PCR技术,检测了杉木洋061无性系在不同组织中ClPht1;2的表达,以及磷饥饿诱导3、10、25 d下ClPht1;2在根中的表达量变化。克隆得到1个杉木PHT1家族基因ClPht1;2（GeneBank登录号:MK450598）。ClPht1;2编码氨基酸序列与日本柳杉磷转运蛋白家族基因编码氨基酸序列相似性为93%,与马尾松、油茶、毛果杨等植物磷转运蛋白家族基因的编码氨基酸序列比对,结果相似性均>72%。ClPht1;2基因序列编码区长1 565 bp,编码511个氨基酸,蛋白理论分子量60.024 ku,为疏水蛋白,不具有信号肽,潜在磷酸化位点42个。ClPht...
【文章来源】：西北林学院学报. 2020,35(05)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
ClPht1;2及部分植物PHT基因编码蛋白的氨基酸序列多重比对
ClPht1;2最长开放阅读框1 565 bp,该基因的预测编码蛋白的分子式为C2757H4217N697O746S30,分子量60.024 ku,不稳定系数为36.69,预测是稳定蛋白分子,蛋白脂肪系数89.35,预测理论等电点8.70。ClPHT1;2的预测编码蛋白有511个氨基酸,其中Ala(A)12.7%,Gly(G)8.9%,Ile(I)6.5%,Leu(L)8.5%,Phe(F)8.0%,Ser(S) 5.6%,Thr(T)6.2%,Val(V)6.2%,其他氨基酸含量都<5%,Pyl(O)和Sec(U)为0。编码氨基酸中酸性氨基酸39个,碱性氨基酸54个,负电荷残基总数39,正电荷残基总数45。ClPht1;2编码蛋白总平均亲水性系数0.350,含有亲水性和疏水性氨基酸,亲水性系数最小值在第397位(-2.900),最大值在第496位处(3.333),且疏水区域多于亲水区域,表明其为疏水性蛋白(图2)。使用SignalP 4.1预测ClPht1;2蛋白信号肽,图3可见该蛋白第1-36位氨基酸的平均S值为0.105,D值为0.120,远小于默认D-cutoff值0.5,表明该编码蛋白不具有信号肽,不是分泌型蛋白。
使用SignalP 4.1预测ClPht1;2蛋白信号肽,图3可见该蛋白第1-36位氨基酸的平均S值为0.105,D值为0.120,远小于默认D-cutoff值0.5,表明该编码蛋白不具有信号肽,不是分泌型蛋白。使用NetPhos 3.1预测ClPht1;2的潜在磷酸化位点,图4表明该蛋白拥有可能的17个丝氨酸(Ser)、19个苏氨酸(Thr)、6个酪氨酸(Tyr)磷酸修饰位点。
【参考文献】：
期刊论文
[1]连栽杉木林地土壤对其无性系幼苗土壤酶活性和酚酸类物质含量的影响[J]. 罗红艳,陈潇潇,曹光球,陈爱玲,魏晓骁,叶义全. 西北林学院学报. 2019(01)
[2]植物营养元素运输载体的功能及其调控机制研究进展[J]. 陈迪,潘伟槐,周哉材,严旭,潘建伟. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018(03)
[3]杉木磷转运蛋白基因ClPht1;1的克隆及表达分析[J]. 苏烁烁,李明,吴鹏飞,张颖,马祥庆. 林业科学. 2017(05)
[4]Pht1家族在几种植物中的研究进展[J]. 关淑艳,孙国旭,徐丹丹,魏晓禹,孙苏,马义勇. 吉林农业大学学报. 2017(04)
[5]植物磷转运子PHT1家族研究进展[J]. 董旭,王雪,石磊,蔡红梅,徐芳森,丁广大. 植物营养与肥料学报. 2017(03)
[6]不同发育阶段杉木人工林土壤有机质特征及团聚体稳定性[J]. 张芸,李惠通,魏志超,刘春华,蒋宗垲,马祥庆. 生态学杂志. 2016(08)
[7]低磷胁迫下杉木幼苗生长特性与内源激素的关系[J]. 陈智裕,吴鹏飞,邹显花,汪攀,马静,马祥庆. 林业科学. 2016(02)
[8]豆科植物Pht1磷转运蛋白家族基因的研究进展[J]. 陈丽玉,秦璐,赵静,廖红. 大豆科学. 2015(06)
[9]小麦磷转运蛋白基因TaPT4的克隆和表达分析[J]. 刘芳朋,张立军,谷俊涛,李小娟,郭程谨,路文静,肖凯. 河北农业大学学报. 2012(03)
[10]杉木无性系测定林磷素利用效率的比较[J]. 吴鹏飞,马祥庆,陈友力,林文奖,黄诗云,刘露奇. 福建农林大学学报(自然科学版). 2012(01)
本文编号：3392833
【文章来源】：西北林学院学报. 2020,35(05)北大核心CSCD
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
ClPht1;2及部分植物PHT基因编码蛋白的氨基酸序列多重比对
ClPht1;2最长开放阅读框1 565 bp,该基因的预测编码蛋白的分子式为C2757H4217N697O746S30,分子量60.024 ku,不稳定系数为36.69,预测是稳定蛋白分子,蛋白脂肪系数89.35,预测理论等电点8.70。ClPHT1;2的预测编码蛋白有511个氨基酸,其中Ala(A)12.7%,Gly(G)8.9%,Ile(I)6.5%,Leu(L)8.5%,Phe(F)8.0%,Ser(S) 5.6%,Thr(T)6.2%,Val(V)6.2%,其他氨基酸含量都<5%,Pyl(O)和Sec(U)为0。编码氨基酸中酸性氨基酸39个,碱性氨基酸54个,负电荷残基总数39,正电荷残基总数45。ClPht1;2编码蛋白总平均亲水性系数0.350,含有亲水性和疏水性氨基酸,亲水性系数最小值在第397位(-2.900),最大值在第496位处(3.333),且疏水区域多于亲水区域,表明其为疏水性蛋白(图2)。使用SignalP 4.1预测ClPht1;2蛋白信号肽,图3可见该蛋白第1-36位氨基酸的平均S值为0.105,D值为0.120,远小于默认D-cutoff值0.5,表明该编码蛋白不具有信号肽,不是分泌型蛋白。
使用SignalP 4.1预测ClPht1;2蛋白信号肽,图3可见该蛋白第1-36位氨基酸的平均S值为0.105,D值为0.120,远小于默认D-cutoff值0.5,表明该编码蛋白不具有信号肽,不是分泌型蛋白。使用NetPhos 3.1预测ClPht1;2的潜在磷酸化位点,图4表明该蛋白拥有可能的17个丝氨酸(Ser)、19个苏氨酸(Thr)、6个酪氨酸(Tyr)磷酸修饰位点。
【参考文献】：
期刊论文
[1]连栽杉木林地土壤对其无性系幼苗土壤酶活性和酚酸类物质含量的影响[J]. 罗红艳,陈潇潇,曹光球,陈爱玲,魏晓骁,叶义全. 西北林学院学报. 2019(01)
[2]植物营养元素运输载体的功能及其调控机制研究进展[J]. 陈迪,潘伟槐,周哉材,严旭,潘建伟. 浙江大学学报(农业与生命科学版). 2018(03)
[3]杉木磷转运蛋白基因ClPht1;1的克隆及表达分析[J]. 苏烁烁,李明,吴鹏飞,张颖,马祥庆. 林业科学. 2017(05)
[4]Pht1家族在几种植物中的研究进展[J]. 关淑艳,孙国旭,徐丹丹,魏晓禹,孙苏,马义勇. 吉林农业大学学报. 2017(04)
[5]植物磷转运子PHT1家族研究进展[J]. 董旭,王雪,石磊,蔡红梅,徐芳森,丁广大. 植物营养与肥料学报. 2017(03)
[6]不同发育阶段杉木人工林土壤有机质特征及团聚体稳定性[J]. 张芸,李惠通,魏志超,刘春华,蒋宗垲,马祥庆. 生态学杂志. 2016(08)
[7]低磷胁迫下杉木幼苗生长特性与内源激素的关系[J]. 陈智裕,吴鹏飞,邹显花,汪攀,马静,马祥庆. 林业科学. 2016(02)
[8]豆科植物Pht1磷转运蛋白家族基因的研究进展[J]. 陈丽玉,秦璐,赵静,廖红. 大豆科学. 2015(06)
[9]小麦磷转运蛋白基因TaPT4的克隆和表达分析[J]. 刘芳朋,张立军,谷俊涛,李小娟,郭程谨,路文静,肖凯. 河北农业大学学报. 2012(03)
[10]杉木无性系测定林磷素利用效率的比较[J]. 吴鹏飞,马祥庆,陈友力,林文奖,黄诗云,刘露奇. 福建农林大学学报(自然科学版). 2012(01)
本文编号：3392833
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