胃癌相关差异性信号通路与关键基因筛选及FBN1基因在胃癌中的生物学功能研究
发布时间：2021-10-05 12:38
背景:胃癌作为一种上消化道恶性肿瘤,具有较高的发病率和死亡率。由于胃癌发病初期无明显症状,很多患者确诊时疾病已发展到进展期,给后续治疗加大了难度。目前,针对胃癌的主要治疗手段仍是手术和化疗,然而大部分进展期胃癌患者经过治疗后仍会发生复发和转移,导致进展期胃癌患者的预后较差,全球范围内整体5年生存率仅为29%。虽然在传统治疗策略的基础上,许多新的治疗方法已被发现,并应用于胃癌治疗,然而这些治疗策略在进展期胃癌患者中的治疗效果并不理想。改善胃癌患者的预后生存,明确胃癌转移机制是当今胃癌研究的重点。随着对胃癌研究的不断深入,人们开始从基因层面探究胃癌的发生及发展并发现了许多胃癌相关的突变基因及信号通路,这些发现促进了分子靶向治疗的兴起。靶向EGFR的西妥昔单抗及靶向VEGFR-2的阿帕替尼在改善进展期胃癌患者的预后生存方面的成功应用,彰显了分子靶向治疗的重要性。分子靶向治疗的成功有赖于靶向胃癌的高敏感度药物的研究及新的药物靶点的筛选。针对胃癌相关差异基因的分析可以筛选出胃癌关键基因,进一步对关键基因表达及生物学功能的研究将为靶点的搜寻提供强大的助力。过表达的FBN1在细胞增殖、细胞凋亡和肿瘤...
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：155 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
各数据集的差异表达基因火山图，其中上调差异表达基因(红色)，下调差异表达基因(绿色)，不显著的差异表达基因(黑色)
图 2.3 四个 GEO 数据集之间的重叠差异表达基因 Venn 图，差异表达基因上调（A）,差异表达基因下调（B）。在 GSE28700 微阵列数据集中共识别出 26 个差异表达 miRNA，其中上调差异表达 miRNA 22 个，包括：hsa-miR-133a-3p，hsa-miR-133a-5p，hsa-miR-133a，hsa-miR-204-5p，hsa-miR-18a-3p，hsa-miR-381-3p，hsa-miR-196a-5p，hsa-miR-99a-5p，hsa-miR-30e-5p，hsa-miR-148a-3p，hsa-miR-143-3p，hsa-miR-154-5p，hsa-miR-1-3p，hsa-miR-376a-3p ， hsa-miR-497-5p ， hsa-miR-363-3p ， hsa-miR-125b-5p ，hsa-miR-100-5p，hsa-miR-604，hsa-miR-139-5p，hsa-miR-218-5p，hsa-miR-767-3p；下调差异表达 miRNA 4 个，包括：hsa-miR-145-5p，hsa-miR-29c-3p，hsa-miR-195-5p，hsa-miR-523-3p。
吉林大学博士学位论文2.3.3 差异表达 miRNA 靶标基因预测利用 miRWalk 3.0 数据库对差异表达 miRNA 的靶标基因进行预测。26 个差异表达 miRNA 一共靶向 630 个靶标基因，根据 miRWalk 3.0 预测工具绘制出 miRNA与靶标基因的互作网络关系图（图 2.4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]SERPINE1基因在胃癌中的表达及临床意义[J]. 沈苗,钟兴伟. 世界华人消化杂志. 2018(31)
[2]Emerging molecular classifications and therapeutic implications for gastric cancer[J]. Tao Chen,Xiao-Yue Xu,Ping-Hong Zhou. Chinese Journal of Cancer. 2016(08)
[3]Emerging molecular basis of hematogenous metastasis in gastric cancer[J]. Jing Zhong,Yan Chen,Liang-Jing Wang. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[4]Anti program death-1/anti program death-ligand 1 in digestive cancers[J]. Eléonore de Guillebon,Pauline Roussille,Eric Frouin,David Tougeron. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2015(08)
[5]Role of the Wnt/β-catenin pathway in gastric cancer: An indepth literature review[J]. Miguel Angel Chiurillo. World Journal of Experimental Medicine. 2015(02)
[6]Causes and consequences of microsatellite instability in gastric carcinogenesis[J]. Sérgia Velho,Maria Sofia Fernandes,Marina Leite,Ceu Figueiredo,Raquel Seruca. World Journal of Gastroenterology. 2014(44)
[7]Targeting receptor tyrosine kinases in gastric cancer[J]. Asahiro Morishita,Jian Gong,Tsutomu Masaki. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[8]Cancer bioinformatics:detection of chromatin states, SNP-containing motifs, and functional enrichment modules[J]. Xiaobo Zhou. Chinese Journal of Cancer. 2013(04)
[9]Carcinoma of the stomach: A review of epidemiology, pathogenesis, molecular genetics and chemoprevention[J]. Siddavaram Nagini. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2012(07)
[10]microRNA-29s对胃癌细胞增殖和侵袭的作用（英文）[J]. 郎楠,刘明,唐秋琳. 癌症. 2010(06)
本文编号：3419756
【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：155 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
各数据集的差异表达基因火山图，其中上调差异表达基因(红色)，下调差异表达基因(绿色)，不显著的差异表达基因(黑色)
图 2.3 四个 GEO 数据集之间的重叠差异表达基因 Venn 图，差异表达基因上调（A）,差异表达基因下调（B）。在 GSE28700 微阵列数据集中共识别出 26 个差异表达 miRNA，其中上调差异表达 miRNA 22 个，包括：hsa-miR-133a-3p，hsa-miR-133a-5p，hsa-miR-133a，hsa-miR-204-5p，hsa-miR-18a-3p，hsa-miR-381-3p，hsa-miR-196a-5p，hsa-miR-99a-5p，hsa-miR-30e-5p，hsa-miR-148a-3p，hsa-miR-143-3p，hsa-miR-154-5p，hsa-miR-1-3p，hsa-miR-376a-3p ， hsa-miR-497-5p ， hsa-miR-363-3p ， hsa-miR-125b-5p ，hsa-miR-100-5p，hsa-miR-604，hsa-miR-139-5p，hsa-miR-218-5p，hsa-miR-767-3p；下调差异表达 miRNA 4 个，包括：hsa-miR-145-5p，hsa-miR-29c-3p，hsa-miR-195-5p，hsa-miR-523-3p。
吉林大学博士学位论文2.3.3 差异表达 miRNA 靶标基因预测利用 miRWalk 3.0 数据库对差异表达 miRNA 的靶标基因进行预测。26 个差异表达 miRNA 一共靶向 630 个靶标基因，根据 miRWalk 3.0 预测工具绘制出 miRNA与靶标基因的互作网络关系图（图 2.4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]SERPINE1基因在胃癌中的表达及临床意义[J]. 沈苗,钟兴伟. 世界华人消化杂志. 2018(31)
[2]Emerging molecular classifications and therapeutic implications for gastric cancer[J]. Tao Chen,Xiao-Yue Xu,Ping-Hong Zhou. Chinese Journal of Cancer. 2016(08)
[3]Emerging molecular basis of hematogenous metastasis in gastric cancer[J]. Jing Zhong,Yan Chen,Liang-Jing Wang. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[4]Anti program death-1/anti program death-ligand 1 in digestive cancers[J]. Eléonore de Guillebon,Pauline Roussille,Eric Frouin,David Tougeron. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2015(08)
[5]Role of the Wnt/β-catenin pathway in gastric cancer: An indepth literature review[J]. Miguel Angel Chiurillo. World Journal of Experimental Medicine. 2015(02)
[6]Causes and consequences of microsatellite instability in gastric carcinogenesis[J]. Sérgia Velho,Maria Sofia Fernandes,Marina Leite,Ceu Figueiredo,Raquel Seruca. World Journal of Gastroenterology. 2014(44)
[7]Targeting receptor tyrosine kinases in gastric cancer[J]. Asahiro Morishita,Jian Gong,Tsutomu Masaki. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[8]Cancer bioinformatics:detection of chromatin states, SNP-containing motifs, and functional enrichment modules[J]. Xiaobo Zhou. Chinese Journal of Cancer. 2013(04)
[9]Carcinoma of the stomach: A review of epidemiology, pathogenesis, molecular genetics and chemoprevention[J]. Siddavaram Nagini. World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2012(07)
[10]microRNA-29s对胃癌细胞增殖和侵袭的作用（英文）[J]. 郎楠,刘明,唐秋琳. 癌症. 2010(06)
本文编号：3419756
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3419756.html
最近更新
教材专著
