甘草DNA甲基转移酶基因在高压静电场胁迫下的表达及其系统发育分析
发布时间：2021-10-09 23:28
DNA甲基化是表观遗传修饰重要方式之一,参与调节植物生长发育及进化等一系列生命过程。DNA甲基化的建立和维持依靠DNA甲基转移酶的参与。本论文以乌拉尔甘草为材料,通过PCR技术分离到甘草中疑似甲基转移酶基因部分序列,通过相关生物信息学分析,得到初步确认。构建了其与苜蓿、拟南芥等20个物种相关基因的系统进化树;采用实时荧光定量技术（RT-qPCR）研究了甘草幼苗中三类甲基转移酶基因经过高压静电场处理的表达情况。主要结果如下:1、采用简并引物PCR扩增的方法,从甘草基因组中分离出了MET1类、DRM类和CMT类甲基转移酶基因片段各一条。MET1类甲基转移酶目的片段长度为951bp,与豌豆MET1基因核酸序列相似性为92.63%;DRM类甲基转移酶目的片段长度为357bp,与苜蓿DRM2基因核酸序列相似性为92.37%;CMT类甲基转移酶目的片段长度为692bp,与苜蓿CMT1基因核酸序列相似性为83.97%。2、采用系统进化分析法构建了甘草MET1类、DRM类和CMT类甲基转移酶基因和其它20余物种的进化树,甘草的MET1类甲基转移酶和鹰嘴豆距离很近,与DRM类甲基转移酶距离最近的是苜蓿,...
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甘草基因组DNA电泳图
内蒙古大学硕士学位论文13图2-3以甘草DNA为模板的PCR电泳图M:2000bpDNAMaker;1：CMT类基因片段扩增结果；2：DRM类基因片段扩增结果；3，4：MET1类基因片段扩增结果Fig.2-3TheelectrophoresisofPCRusinglicoricegenomicDNAasatemplateM:2000bpDNAMaker;1:AmplifiedresultofCMT-like;2:AmplifiedresultofDRM-like;3,4:AmplifiedresultofMET1-like2.3.4基因特异片段序列分析2.3.4.1MET1基因特异片段序列分析测序结果表明，引物对M1/M2扩增片段长度951bp，与预期大小一致。进入NCBI进行BLAST，结果显示，引物对M1/M2扩增出的951bp片段Gu-M1与豌豆MET1基因(AF034419)的核酸序列相似性为92.63%，E-value:3e-177;氨基酸序列相似性为96.08%，E-value:5e-30。可确认Gu-M1为甘草MET1基因特异性片段。
内蒙古大学硕士学位论文14图2-4MET1类基因片段核酸序列与豌豆序列在BLAST中比对Query:所测甘草序列;Subject:豌豆序列AlignmentScores>=20080-200Figure2-4MET1genefragmentnucleicacidsequenceandpeasequencealignmentinBLASTQuery:measuredlicoricesequence;Subject:peasequenceAlignmentScores>=20080-200
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘草主要化学成分及药效活性与环境关系研究进展[J]. 李倩,高海荣,郭九峰. 黑龙江农业科学. 2019(09)
[2]Expectation: Advances and Entropy Analysis of Plant Epigenetics under Stress[J]. Qian LI,Hairong GAO,Jiufeng GUO,Mengyu MA,Zhuoya ZHAO. Agricultural Science & Technology. 2017(10)
[3]福州宦溪野生蕉CBF7的cDNA与启动子克隆及在不同温度下的表达特性[J]. 刘炜婳,林玉玲,赖钟雄. 应用与环境生物学报. 2017(02)
[4]电场处理后柠条（Caragana korshinskii）种子对干旱胁迫的敏感性[J]. 王文星,杨体强,王共义,刘翔宇,赵清春,李伟. 中国沙漠. 2016(05)
[5]灵芝DNA甲基转移酶（GlMET1）基因克隆及原核表达诱导分析[J]. 查良平,王亚君,刘爽,赵玉洋,袁媛,黄璐琦. 中国中药杂志. 2016(06)
[6]高压静电场对羽衣甘蓝自交不亲和系种子基因组DNA甲基化的影响[J]. 张旸,胡中影,李娜,丁兵,王江,解莉楠. 华北农学报. 2015(S1)
[7]甘草组培与栽培主要成分的提取及活性比较[J]. 满淑丽,刘延涛,张咪,郭松波,高文远. 天津科技大学学报. 2015(04)
[8]甘蓝型油菜及其亲本物种甲基化酶I基因的克隆及表达模式[J]. 谭河林,许欣颖,付立曼,向小娥,李剑桥,郭昊伦,叶文雪. 作物学报. 2015(03)
[9]逆境胁迫下植物DNA甲基化变异的研究进展[J]. 徐妍,张海玲,徐香玲,张会新,姚琳,张必弦,王全伟. 中国生物工程杂志. 2014(10)
[10]高压静电场对大豆幼苗生长的影响[J]. 黄洪云. 大豆科学. 2012(06)
博士论文
[1]草莓和苹果DNA甲基转移酶基因分离及表达分析[D]. 常琳琳.沈阳农业大学 2009
[2]高压脉冲电场对蔬菜种子生物学效应的研究[D]. 迟燕平.吉林大学 2008
硕士论文
[1]半膜覆盖下玉米主要农艺性状变化及基因差异表达的研究[D]. 高海荣.内蒙古大学 2018
[2]高压静电场处理甘草三年生植株DNA甲基化多态性分析[D]. 王斯靓.内蒙古大学 2018
[3]蒙古口蘑菌丝体生长发育及其漆酶表达特性研究[D]. 刘晓婷.内蒙古大学 2017
[4]负高压静电场对甘草种子萌发及几项生理指标的影响[D]. 李亚娇.内蒙古大学 2016
[5]高压静电场对采后绿芦笋生理特性影响的研究[D]. 陈庆.江西农业大学 2015
[6]优质甘草组培快繁及遗传稳定性分析[D]. 苏姗.河北科技大学 2015
[7]茶树冷驯化过程中DNA甲基化的变化分析及DNA甲基转移酶基因CsDRM2的克隆[D]. 周艳华.中国农业科学院 2015
[8]马铃薯甲基转移酶和去甲基化酶预测及表达研究[D]. 毛锐涛.内蒙古大学 2014
[9]高压静电场对羽衣甘蓝种子萌发过程DNA甲基化的影响[D]. 李娜.东北林业大学 2013
[10]非生物胁迫下SIBADH基因在辽宁碱蓬和转pB-BADH烟草中的表达特性分析[D]. 张寅寅.辽宁师范大学 2013
本文编号：3427193
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甘草基因组DNA电泳图
内蒙古大学硕士学位论文13图2-3以甘草DNA为模板的PCR电泳图M:2000bpDNAMaker;1：CMT类基因片段扩增结果；2：DRM类基因片段扩增结果；3，4：MET1类基因片段扩增结果Fig.2-3TheelectrophoresisofPCRusinglicoricegenomicDNAasatemplateM:2000bpDNAMaker;1:AmplifiedresultofCMT-like;2:AmplifiedresultofDRM-like;3,4:AmplifiedresultofMET1-like2.3.4基因特异片段序列分析2.3.4.1MET1基因特异片段序列分析测序结果表明，引物对M1/M2扩增片段长度951bp，与预期大小一致。进入NCBI进行BLAST，结果显示，引物对M1/M2扩增出的951bp片段Gu-M1与豌豆MET1基因(AF034419)的核酸序列相似性为92.63%，E-value:3e-177;氨基酸序列相似性为96.08%，E-value:5e-30。可确认Gu-M1为甘草MET1基因特异性片段。
内蒙古大学硕士学位论文14图2-4MET1类基因片段核酸序列与豌豆序列在BLAST中比对Query:所测甘草序列;Subject:豌豆序列AlignmentScores>=20080-200Figure2-4MET1genefragmentnucleicacidsequenceandpeasequencealignmentinBLASTQuery:measuredlicoricesequence;Subject:peasequenceAlignmentScores>=20080-200
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘草主要化学成分及药效活性与环境关系研究进展[J]. 李倩,高海荣,郭九峰. 黑龙江农业科学. 2019(09)
[2]Expectation: Advances and Entropy Analysis of Plant Epigenetics under Stress[J]. Qian LI,Hairong GAO,Jiufeng GUO,Mengyu MA,Zhuoya ZHAO. Agricultural Science & Technology. 2017(10)
[3]福州宦溪野生蕉CBF7的cDNA与启动子克隆及在不同温度下的表达特性[J]. 刘炜婳,林玉玲,赖钟雄. 应用与环境生物学报. 2017(02)
[4]电场处理后柠条（Caragana korshinskii）种子对干旱胁迫的敏感性[J]. 王文星,杨体强,王共义,刘翔宇,赵清春,李伟. 中国沙漠. 2016(05)
[5]灵芝DNA甲基转移酶（GlMET1）基因克隆及原核表达诱导分析[J]. 查良平,王亚君,刘爽,赵玉洋,袁媛,黄璐琦. 中国中药杂志. 2016(06)
[6]高压静电场对羽衣甘蓝自交不亲和系种子基因组DNA甲基化的影响[J]. 张旸,胡中影,李娜,丁兵,王江,解莉楠. 华北农学报. 2015(S1)
[7]甘草组培与栽培主要成分的提取及活性比较[J]. 满淑丽,刘延涛,张咪,郭松波,高文远. 天津科技大学学报. 2015(04)
[8]甘蓝型油菜及其亲本物种甲基化酶I基因的克隆及表达模式[J]. 谭河林,许欣颖,付立曼,向小娥,李剑桥,郭昊伦,叶文雪. 作物学报. 2015(03)
[9]逆境胁迫下植物DNA甲基化变异的研究进展[J]. 徐妍,张海玲,徐香玲,张会新,姚琳,张必弦,王全伟. 中国生物工程杂志. 2014(10)
[10]高压静电场对大豆幼苗生长的影响[J]. 黄洪云. 大豆科学. 2012(06)
博士论文
[1]草莓和苹果DNA甲基转移酶基因分离及表达分析[D]. 常琳琳.沈阳农业大学 2009
[2]高压脉冲电场对蔬菜种子生物学效应的研究[D]. 迟燕平.吉林大学 2008
硕士论文
[1]半膜覆盖下玉米主要农艺性状变化及基因差异表达的研究[D]. 高海荣.内蒙古大学 2018
[2]高压静电场处理甘草三年生植株DNA甲基化多态性分析[D]. 王斯靓.内蒙古大学 2018
[3]蒙古口蘑菌丝体生长发育及其漆酶表达特性研究[D]. 刘晓婷.内蒙古大学 2017
[4]负高压静电场对甘草种子萌发及几项生理指标的影响[D]. 李亚娇.内蒙古大学 2016
[5]高压静电场对采后绿芦笋生理特性影响的研究[D]. 陈庆.江西农业大学 2015
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[8]马铃薯甲基转移酶和去甲基化酶预测及表达研究[D]. 毛锐涛.内蒙古大学 2014
[9]高压静电场对羽衣甘蓝种子萌发过程DNA甲基化的影响[D]. 李娜.东北林业大学 2013
[10]非生物胁迫下SIBADH基因在辽宁碱蓬和转pB-BADH烟草中的表达特性分析[D]. 张寅寅.辽宁师范大学 2013
本文编号：3427193
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