绵羊KRTAP6-1基因生物信息学分析

发布时间：2021-11-08 08:24

　　为探究绵羊KRTAP6-1基因潜在的生物学功能,以生物基因组学数据库中KRTAP6-1基因序列为研究对象,采用生物信息学的预测相关软件,进行生物信息学的预测分析。结果表明,KRTAP6-1基因总共编码83个氨基酸,分子量8 427.18 Da,是稳定的亲水性蛋白,主要在细胞质中起作用,没有明显的信号肽切割位点,其二级结构主要以无规卷曲和β螺旋的形式存在;绵羊KRTAP6-1基因编码蛋白的氨基酸组成与普通牛和山羊的同源性最高,分别为95.0%和91.7%。通过对绵羊KRTAP6-1基因编码产物的生物学分析,挖掘其潜在功能,结果为丰富绵羊基因组内容及该基因的后续利用提供基础信息。 

【文章来源】：中国草食动物科学. 2020,40(05)

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

绵羊KRTAP6-1基因编码蛋白质疏水性/亲水性预测分析

基因编码蛋白的跨膜结构的分析预测采用TMHMM 2.0在线软件。结果显示，该基因编码的蛋白有2个明显的跨膜螺旋区，分别在氨基酸位点的第7～34和第64～83的位置（见图4）。由此推测，绵羊KRTAP6-1基因编码的蛋白质是跨膜蛋白质，有可能在细胞中起一定的运输作用。图3 HMM模型分析KRTAP6-1基因编码产物信号肽的曲线图

HMM模型分析KRTAP6-1基因编码产物信号肽的曲线图

【参考文献】：
期刊论文
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[2]绵羊ADRA1B基因生物信息学分析[J]. 李娜,王维民,张德印,张小雪.  甘肃农业科技. 2019(09)
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博士论文
[1]绵羊角蛋白关联蛋白家族基因新成员鉴定及其与羊毛性状的相关性分析[D]. 李少斌.甘肃农业大学 2017

硕士论文
[1]猪JARID1C基因的克隆、生物信息学及组织表达谱分析[D]. 伊璐.南京农业大学 2007



本文编号：3483361