基于红系终末期单细胞表达谱构建珠蛋白基因共表达网络

发布时间：2021-12-30 04:37

　　研究背景:人类红系分化终末期是红细胞发育成熟的关键阶段,红细胞主要在该阶段启动珠蛋白表达,对该阶段红细胞转录活动的研究有助于深入理解红细胞成熟过程的转录组动态变化以及珠蛋白基因的依赖调控关系。近几年快速发展的单细胞转录组研究技术取得了很大的进展,使得研究者可以深度描述并解析异质性组织的细胞组成和基因特征表达,从而有机会从单个细胞水平探索基因之间的调控关系。然而目前还没有体内来源的骨髓终末期单细胞测序来揭示细胞的异质性组成和珠蛋白基因的依赖调控关系。研究目的:本研究以3例成人骨髓CD235a+细胞为基本材料,实施单细胞RNA测序（scRNA-seq）,以探究红系分化终末期的细胞组成和基因表达情况,并在单细胞水平围绕珠蛋白基因构建局部的基因共表达网络以发掘潜在的红系调控因子。结果:经单细胞测序一共获得了 8,668个有效的CD235a+细胞,涵盖了约15,000个转录本。细胞的类型鉴定和拟时间分析表明红细胞终末期分化过程呈连续状态,各个细胞类型的数量为:85个proE细胞,446个basoE细胞,2,185个polyE细胞,5,952 个 orthoE细胞,其中polyE被细分为 tran... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－２．红系发生过程以及细胞变化??Ｆｉｇｕｒｅ?１－２．?Ｅｒｙｔｈｒｏｐｏｉｅｓｉｓ?ａｎｄ?ｃｈａｎｇｅｓ?ａｌｏｎｇ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ??

图１－３．晚幼红细胞在巨噬细胞的帮助下进行脱核??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３．?Ｅｒｙｔｈｒｏｂｌａｓｔ?ｅｎｕｃｌｅａｔｉｏｎ?ｗｉｔｈ?ｈｅｌｐ?ｏｆ?ｍａｃｒｏｐｈａｇｅｓ??

图１－５．人体不同发育时期的珠蛋白表达转换??Ｆｉｇｕｒｅｌ－５．?Ｈｅｍｏｇｌｏｂｉｎ?ｓｗｉｔｃｈｉｎｇ?ｉｎ?ｈｕｍａｎ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ?ｓｔａｇｅ??


本文编号：3557490