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盾叶薯蓣转录组数据库构建及薯蓣皂苷合成相关基因挖掘

发布时间:2022-01-05 06:28
  薯蓣皂苷为甾体皂苷类化合物中的一种,具有抗肿瘤、消炎止痛等活性。同时,薯蓣皂素作为薯蓣皂苷合成途径的上游物质,在药物工业生产中,薯蓣皂素是合成300多种甾醇类激素的前体物质,药品制造产业每年对它的消耗量都很大,因此薯蓣皂素具有“药用黄金”的称号。然而,薯蓣皂苷合成途径至今未被完全解析,其合成路径中的相关基因很多都未被分离。盾叶薯蓣为我国特有种,其是目前薯蓣皂苷元含量最高的植物。本研究以其为研究材料,构建了同一时期不同组织或同一组织不同时期的转录组文库,经过对转录组数据库的分析,我们挖掘到了一些与薯蓣皂苷(元)合成途径的候选基因密切相关的功能基因。主要研究成果如下:(1)通过对三个盾叶薯蓣的样本(AugR、AugL、NovR)的cDNA文库进行测序,分别得到45367360、55798190、42564054条RawReads,对RawReads过滤后,又分别得到43234636、40686226、53330426条Clean Reads。Clean Read拼接后共得到176406条Transcripts,143245条... 

【文章来源】:中国科学院大学(中国科学院武汉植物园)湖北省

【文章页数】:65 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

盾叶薯蓣转录组数据库构建及薯蓣皂苷合成相关基因挖掘


几种三萜皂苷物质的结构图

盾叶薯蓣,主要化学成分,植物名称,薯蓣属植物


图 1.4 盾叶薯蓣主要化学成分组成及含量Figure 1.4 The main chemical composition and content of D. zingiberensis表 1.1 部分薯蓣属植物中薯蓣皂苷元含量Table 1.1 The content of diosgenin in some plants Dioscorea植物名称 薯蓣皂苷元含量(%)D. zingiberensis 1.05~16.15D. parviflora 3.40~3.90D. niponica 2%~2.4%D. niponica.subsp.rostthornii 0.30~2.55D. gracillima 0.44~2.90D. collettii 0.50~2.70

薯蓣皂苷,薯蓣皂苷元,盾叶薯蓣


图 3.1 盾叶薯蓣及其薯蓣皂苷元和薯蓣皂苷含量图igure3.1 The content of diosgenin and diosgenin in D.zingibereniberensis in November; B. D.zingiberensis in August; C, The conteiosgenin in D.zingiberensist letters on the bar indicate a significant difference at p < 0.05 basedr models with Bonferroni multicomparison tests. 年 5 月采集的盾叶薯蓣叶片材料标记为 Aug_L(图 3. Aug_R(图 3.1B),2015 年 11 月采集的盾叶薯蓣根状8 A)。高效液相色谱法(HPLC)检测植物材料的薯蓣,发现 Aug_R 薯蓣皂苷元及薯蓣皂苷含量都是最高的:


本文编号:3569916

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