生物炭处理下玛瑙红樱桃根系基因的差异表达

发布时间：2022-02-20 18:09

　　生物炭是由农林废弃物在低氧或厌氧条件下高温热解产生的一种不溶性固态物质。一方面,生物炭自身含有一定量的矿质元素（如N、P、K和一些微量元素）,可为植物生长发育提供良好的元素供应;另一方面,生物炭具有特殊孔径结构可为土壤微生物提供良好的栖息环境,改变土壤微生物活性和群落结构组成,进而影响植物生长。玛瑙红樱桃（Cerasus pseudocerasus Lindl.‘Manaohong’）是贵州选育的耐贮运优良樱桃品种,在贵州省的种植面积已超过25万亩,表现出巨大的经济效益。课题组前期从生理水平上研究发现,土壤中添加秸秆生物炭可改善玛瑙红樱桃幼苗的生长生理特性,促进其生长,提高其抗性。本研究从分子水平探讨生物炭对玛瑙红樱桃根系的影响;同时,引入“无营养”生物炭,探究生物炭结构特性与营养成分特性对其在发挥作用过程中的贡献差异。主要研究内容如下:1.对玛瑙红樱桃幼苗地上部生长快速期（6月份）和根系生长快速期（9月份）的根系进行转录组测序,共获得154,724个unigene,并在NR、Swiss-proft、Pfam、GO、COG、KEGG等6大数据库中,注释得到这些unigene主要富集的代... 

【文章来源】：贵州大学贵州省211工程院校

【文章页数】：71 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
前言
第一章 文献综述
    1.1 生物炭的性质
    1.2 生物炭对作物生长及土壤的影响
        1.2.1 生物炭对作物生产力的影响
        1.2.2 生物炭对土壤影响的机理
        1.2.3 生物炭对植物抗病性的影响
        1.2.4 生物炭对植物病害控制的机制
        1.2.5 生物炭对植物转录影响的研究现状
    1.3 转录组测序在植物研究中的应用
        1.3.1 转录组及RNA-Seq概述
        1.3.2 RNA-Seq在果树上的应用
    1.4 研究目的及意义
第二章 生物炭对玛瑙红樱桃根系基因表达的影响
    2.1 材料及方法
        2.1.1 试验材料及处理
        2.1.2 无营养生物炭的制备
        2.1.3 生物炭营养成分的测定
        2.1.4 试验处理
        2.1.5 根系总RNA的提取
        2.1.6 Illumina cDNA文库构建及测序
        2.1.7 数据预处理及Denovo拼接
        2.1.8 SSR位点搜索及分析
        2.1.9 unigene的功能注释及分类
        2.1.10 基因表达量的计算及差异表达基因分析
        2.1.11 qRT-PCR引物设计
        2.1.12 qRT-PCR反应
        2.1.13 差异表达基因的功能注释
        2.1.14 关键差异表达基因的分析
    2.2 结果分析
        2.2.1 “无营养”生物炭的显微结构
        2.2.2 “无营养”生物炭的营养成分
        2.2.3 测序结果及从头组装
        2.2.4 转录组功能注释相关结果
        2.2.5 q RT-PCR验证结果
        2.2.6 差异基因的筛选
        2.2.7 差异基因表达概况
        2.2.8 调控类黄酮合成代谢途径相关基因
        2.2.9 调控激素信号转导通路的差异表达基因
    2.3 讨论
        2.3.1 测序结果及从头组装分析
        2.3.2 转录组功能注释相关结果分析
        2.3.3 差异基因概况分析
        2.3.4 类黄酮合成代谢途径相关基因
        2.3.5 调控激素信号转导通路的差异表达基因分析
第三章 玛瑙红樱桃查尔酮合酶基因CpCHS2的克隆与基因表达量分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 总RNA提取
        3.1.2 目的基因克隆及检测
        3.1.3 氨基酸序列生物信息学分析
        3.1.4 基因表达量分析
    3.2 结果与分析
        3.2.1 蛋白结构域与氨基酸序列比对
        3.2.2 CpCHS2蛋白结构及理化特性预测
        3.2.3 CpCHS2蛋白疏水性预测
        3.2.4 CpCHS2蛋白跨膜预测
        3.2.5 CpCHS2蛋白磷酸化修饰预测
        3.2.6 CpCHS2蛋白信号肽预测
        3.2.7 CpCHS2亚细胞定位预测
        3.2.8 CpCHS2蛋白二级结构预测
        3.2.9 CpCHS2蛋白三级结构预测
        3.2.10 CpCHS2基因的表达量分析
    3.3 讨论
第四章 结论与展望
    4.1 结论
    4.2 展望
参考文献
致谢
附录



本文编号：3635564