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基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析

发布时间:2022-02-20 19:05
  【目的】葱斑潜蝇Liriomyza chinensis是葱蒜类蔬菜上的重要经济害虫,在我国广泛分布。本研究旨在阐析中国葱斑潜蝇的地理种群遗传分化。【方法】以中国8省12个不同地理种群的253头葱斑潜蝇为样本,测定其mtCOI基因序列;依据获得的mtCOI基因序列,利用MEGA7.0, DnaSP 6.1和Arlequin 3.5等软件对葱斑潜蝇地理种群的遗传多样性、基因流水平和遗传变异等进行分析。【结果】在253头个体的759 bp mtCOI基因片段中,获得13个单倍型,各单倍型间K2P遗传距离均小于0.02;其中单倍型Hap1为12个地理种群所共享,总发生频率高达81.82%。总群体单倍型多样性较低(Hd=0.327),核苷酸多样性(Pi)为0.00159,核苷酸平均差异数(K)为1.21011;葱斑潜蝇总群体遗传分化程度中等(FST=0.06971),基因交流较充分(Nm=3.33629)。分子方差分析(AMOVA)结果表明,遗传变异来源为群体内;总群体Tajima’s D检验值为显著负值;Mantel检测结果说明种群间的遗传距离与地理距离没有相关性。【结论... 

【文章来源】:昆虫学报. 2020,63(06)北大核心CSCD

【文章页数】:10 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 供试虫源
    1.2 基因组DNA提取
    1.3 mtCOI基因序列的扩增
    1.4 PCR产物的纯化及克隆测序
    1.5 序列整理及数据分析
2 结果
    2.1 葱斑潜蝇线粒体COI基因的碱基组成及单倍型分布
    2.2 葱斑潜蝇种群的遗传多样性及中性检验
    2.3 葱斑潜蝇mtCOI基因单倍型遗传距离及系统进化分析
    2.4 不同地理种群间的遗传分化、基因交流和分子方差分析
3 讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]葱斑潜蝇在大葱上的发生与防治[J]. 梁超峰,蒙星,巨亚绒,胡作栋.  西北园艺(综合). 2018(06)
[2]大葱种植与机械化收获分析[J]. 彭帅,杨勇,陈龙,江志鹏.  中国农机化学报. 2017(09)
[3]分子标记技术在昆虫种群遗传学研究中的应用[J]. 何恒果.  西华师范大学学报(自然科学版). 2008(04)
[4]不同地理种群美洲斑潜蝇及近缘种的rDNA-ITS1序列分析和比较[J]. 王莉萍,杜予州,何娅婷,陆亚娟,陆自强.  昆虫学报. 2007(06)
[5]美洲斑潜蝇在不同温度下的飞行能力[J]. 雷仲仁,王音,黄冬如,程登发.  昆虫学报. 2002(03)
[6]葱斑潜蝇发生危害与防治[J]. 魏国先,王忠武,李文羽.  植物保护. 2001(05)
[7]葱斑潜蝇生物学特性研究[J]. 潘秀美,姜官恒.  昆虫知识. 2001(05)
[8]葱斑潜蝇的生物学特性[J]. 王立霞,张永军,蒋玉文.  昆虫知识. 2000(04)
[9]分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J]. 成新跃,周红章,张广学.  动物分类学报. 2000(02)
[10]我国斑潜蝇的发生危害及其防治对策[J]. 王进忠,孙淑玲,苏红田.  北京农学院学报. 2000(01)



本文编号:3635641

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