基于新疆紫草转录组的对羟基苯甲酸香叶基转移酶（PGT）基因的挖掘及生物信息学分析

发布时间：2022-07-15 18:38

　　对羟基苯甲酸香叶基转移酶（PGT）在紫草素类化合物的生物合成途径中起重要作用。该文主要通过生物信息学的方法从新疆紫草转录组中获得6个PGT基因,并预测其编码蛋白的理化性质,进行相关基因的表达分析。结构域预测结果显示,6个PGT蛋白序列均包含Ubi A异戊烯基转移酶家族保守结构域及异戊烯焦磷酸结合位点NDxx Dxxx D和可能的芳环的结合位点GX（K/Y）ST AL;系统进化树分析显示PGT与同源的对羟基苯甲酸多异戊烯转移酶（PPT）属于2个不同的进化枝;基因表达分析表明在紫草素类化合物产量较高的新疆紫草红色高产系悬浮细胞及植株的地下部分,其PGT基因的表达量明显高于白色低产系及植株的地上部分,说明新疆紫草PGT基因的表达量与紫草素类化合物的合成呈正相关。该研究为进一步了解对羟基苯甲酸香叶基转移酶（PGT）的功能及特性奠定了基础,并为紫草素类化合物生物合成及代谢调控提供依据。 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料
2 方法
    2.1 新疆紫草PGT基因的获得
    2.2 生物信息学分析
    2.3 荧光定量PCR检测基因表达量
        2.3.1 RNA提取和c DNA合成
        2.3.2 Real-time PCR
3 结果与分析
    3.1 新疆紫草6个Ae PGTs基因的核苷酸特性分析
    3.2 新疆紫草6个Ae PGTs基因编码蛋白特性分析
    3.3 新疆紫草6个Ae PGTs基因编码蛋白的二级结构分析
    3.4 系统进化树分析
    3.5 基因表达分析
4讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]两种新疆紫草细胞系紫草素生物合成关键酶基因的表达差异分析[J]. 王升,谢腾,周良云,吴志刚,张燕,陈美兰,黄璐琦,郭兰萍.  中华中医药杂志. 2014(05)
[2]新疆紫草2种悬浮细胞生长及紫草素类化合物积累的动力学研究[J]. 王升,谢腾,叶和春,林淑芳,张燕,陈美兰,黄璐琦,郭兰萍.  中国中药杂志. 2013(08)
[3]紫草素及其衍生物的调控策略[J]. 黄文虎,葛锋,刘迪秋,陈朝银.  中国生物工程杂志. 2010(11)
[4]芳香族异戊烯转移酶的研究进展[J]. 高娟,曾英,卢山.  植物学报. 2010(06)
[5]新疆紫草提取物对小鼠免疫性肝损伤的保护作用[J]. 刘燕,买尔旦·马合木提,尼加提·热合木.  新疆医科大学学报. 2006(06)
[6]现代发酵工程技术在食品领域的应用研究进展[J]. 史先振.  中国酿造. 2005(12)
[7]紫草素的全合成研究进展[J]. 徐德锋,管鹏健,毛志强,李绍顺.  有机化学. 2005(07)
[8]滇紫草愈伤组织培养与紫草素产生[J]. 周立刚,郑光植,王世林.  云南植物研究. 1991(03)
[9]离体培养的新疆紫草萘醌色素的诱导形成[J]. 李国凤,伍正容,叶和春,卢馥荪,向桂琼.  植物学通报. 1988(02)

硕士论文
[1]新疆紫草的化学成分研究[D]. 徐新刚.北京中医药大学 2009



本文编号：3662628