甘蓝黄绿叶色基因BoYgl-1和BoYgl-2的精细定位及候选基因分析

发布时间：2022-08-09 16:21

　　结球甘蓝（Brassica oleracea L.var.capitata）简称甘蓝,是一种重要的十字花科芸薹属蔬菜。甘蓝叶色通常为绿色,YL-1和4036Y是本课题组发现的两个黄绿叶色突变体。本研究对两个突变体进行了遗传规律分析及基因精细定位,完成了两个候选基因的变异分析,为揭示黄绿叶色形成机理、促进甘蓝叶色育种奠定了基础。主要研究结果如下:1.在YL-1的C01染色体重组抑制区段精细定位了BoYgl-1基因,揭示了该区段发生一个6.3 Mb的倒位,候选基因Bo1g078470和Bo1g078800在YL-1中启动子区域或编码区存在变异。以黄绿叶色甘蓝突变体YL-1和正常绿叶芥蓝自交系11-192为亲本,构建BC3-BC5分离群体,最终将BoYgl-1黄绿叶色基因定位于C01染色体392 Kb的区间。同时发现YL-1在标记B4-4和T1-49之间发生了一个6.3 Mb的染色体倒位,导致该区段严重的重组抑制。定位区间内共包含32个基因,其中Bo1g078470编码CLPC2/HSP93-Ⅲ蛋白,调控叶绿体蛋白转运;Bo1g078800编码一种PPR五肽重复蛋白,参与线粒体和叶绿体的RN... 

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
主要符号对照表
第一章 绪论
    1.1 叶色突变体研究进展
        1.1.1 叶色突变体的来源
        1.1.2 叶色突变体的分类
        1.1.3 叶色突变体的遗传规律
        1.1.4 叶色基因的定位及克隆
        1.1.5 叶色突变体的分子机制
    1.2 图位克隆技术
        1.2.1 图位克隆的原理
        1.2.2 图位克隆的应用及不足
    1.3 BSA-seq技术
        1.3.1 BSA-seq的原理
        1.3.2 BSA-seq技术的应用
    1.4 目的意义
第二章 甘蓝黄绿叶色基因BoYgl-1的精细定位及候选基因分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 试验材料
        2.1.2 InDel标记开发筛选
        2.1.3 DNA提取
        2.1.4 PCR扩增及电泳
        2.1.5 构建遗传图谱
        2.1.6 RNA提取及cDNA的合成
        2.1.7 荧光定量PCR测定基因表达量
    2.2 结果与分析
        2.2.1 BoYgl-1基因的精细定位
        2.2.2 YL-1在定位区间内染色体倒位的确定
        2.2.3 候选基因预测
        2.2.4 候选基因表达水平分析
        2.2.5 候选基因序列分析
    2.3 讨论
        2.3.1 BoYgl-1基因精细定位分析
        2.3.2 染色体倒位导致严重的重组抑制
        2.3.3 YL-1染色体倒位边界位置分析
第三章 甘蓝黄绿叶色基因BoYgl-2的遗传分析及精细定位
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试验材料
        3.1.2 表型调查及集群分离分析法(BSA)混池测序
        3.1.3 InDel标记开发筛选
        3.1.4 DNA提取、PCR扩增及电泳
        3.1.5 遗传图谱的构建
    3.2 结果与分析
        3.2.1 突变体4036Y叶色遗传规律分析
        3.2.2 两个不同基因控制4036Y与YL-1叶色黄绿突变的遗传学验证
        3.2.3 利用BSA-seq初步定位BoYgl-2基因
        3.2.4 BoYgl-2基因的精细定位
        3.2.5 候选基因预测
        3.2.6 候选基因分析
    3.3 讨论
        3.3.1 BoYgl-2与BoYgl-1编码不同的PPR蛋白
        3.3.2 RNA-seq分析4036Y染色体片段缺失
第四章 结论
    4.1 甘蓝黄绿叶色基因BoYgl-1的精细定位及候选基因分析
    4.2 甘蓝黄绿叶色基因BoYgl-2的遗传分析及精细定位
参考文献
附录A
附录B
致谢
作者简历



本文编号：3672885