药用植物金银花Dof基因家族的筛选及表达分析

发布时间：2022-09-24 18:45

　　Dof（DNA-binding one zinc finger）蛋白是一类植物所特有的转录因子,N-末端具有高度保守的C₂-C₂单锌指结构域,C-末端的转录调控区的氨基酸具有高度多样性,其在植物光合、细胞周期及逆境响应等过程中发挥着重要的作用。本研究基于金银花测序数据,利用生物信息学的方法筛选了候选的LjDof基因,并对其理化性质、亚细胞定位、同源序列比对、保守基序、系统进化发育和表达模式进行了深入分析。结果表明,金银花Dof转录因子家族包含11个基因,编码的氨基酸的个数为157～492,理论等电点为5.45～9.48,均为不稳定亲水性蛋白。亚细胞定位显示,LjDof基因都在细胞核中有定位,个别在其他部位也有定位。同源比对和Motif分析发现,11个LjDof基因都含有完整的C₂-C₂单锌指结构。系统进化发育分析表明,金银花Dof蛋白分为五个亚类。实时荧光定量PCR及表达模式分析表明,LjDof基因在金银花低温胁迫不同时间下有着不同的表达规律。本研究结果为进一步研究金银花Dof基因在逆境胁迫下的功能... 

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 金银花Dof基因家族的筛选及序列分析
    1.2 金银花Dof家族蛋白亚细胞定位预测
    1.3 金银花Dof家族蛋白同源比对及保守结构域(Motif)分析
    1.4 金银花Dof家族蛋白的系统进化分析
    1.5 金银花Dof基因在低温下的表达特征分析
2 结果与分析
    2.1 金银花Dof基因家族蛋白理化性质分析
    2.2 金银花Dof蛋白家族基因亚细胞定位预测
    2.3 金银花Dof蛋白保守结构域分析
    2.4 金银花Dof蛋白Motif分析
    2.5 Dof家族蛋白的系统进化分析
    2.6 金银花Dof基因家族在低温胁迫下的表达分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]茶树两个Dof转录因子的分离及其在温度胁迫中的响应分析[J]. 李辉,黄蔚,刘志薇,王永鑫,吴致君,庄静.  茶叶科学. 2016(03)
[2]植物Dof转录因子的结构特点及功能研究进展[J]. 张雪,尹悦佳,范贝,李慧杰,费小钰,崔喜艳.  作物杂志. 2016(02)
[3]转GmDof11基因高油转基因大豆的鉴定及主要农艺性状调查[J]. 王志坤,Arun Sebastian,常健敏,李丹丹,邱波,张大勇,李文滨.  作物杂志. 2014(02)
[4]植物Dof基因家族功能研究进展[J]. 蔡晓锋,张余洋,张俊红,李汉霞,叶志彪.  植物生理学报. 2013(01)



本文编号：3680671