基于生物信息学分析肝细胞癌的核心基因

发布时间：2022-10-05 19:05

　　目的采用生物信息学方法筛选在肝细胞癌中的异常表达基因,并分析其在肝癌中的临床意义及其可能的机制。方法通过GEO数据库获取GSE101728基因芯片数据集,筛选差异基因;通过STRING和Cytoscape筛选出核心基因;利用GEPIA验证核心基因在肝癌组织中的表达及其临床意义,进一步利用DAVID进行GO分析及KEGG通路分析;通过STRING构建核心基因的PPI网络;运用GEPIA分析核心基因之间的相关性。结果在分析GSE101728数据集后共得到1 082个差异基因,其中354个基因上调,728个基因下调。10个基因被鉴定为差异基因网络中的核心基因,分别为周期素依赖性激酶1（CDK1）、细胞周期蛋白B1（CCNB1）、细胞周期蛋白A2（CCNA2）、polo样激酶1（PLK1）、激光激酶B（AURKB）、细胞分裂周期蛋白20（CDC20）、着丝粒蛋白A（CENPA）、有丝分裂阻滞缺陷蛋白2（MAD2L1）、细胞周期蛋白B2（CCNB2）和驱动蛋白家族2C（KIF2C）。GO及KEGG通路分析表明,该10个核心基因与细胞分裂和细胞周期具有密切关系。AURKB、CCNB1和MAD2L1... 

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【参考文献】：
期刊论文
[1]中国肝癌一级预防专家共识（2018）[J]. 陈万青,崔富强,樊春笋,李霓,曲春枫,舒为群,王宇婷,殷建华,邹怀宾.  中国肿瘤. 2018(09)



本文编号：3686333