异常寡核苷酸结合折叠域蛋白基因对肝细胞癌DNA复制起始的影响

发布时间：2023-02-15 08:26

　　目的关于异常寡核苷酸结合折叠域蛋白基因(OBGs)通过微小染色体维持(MCM)复合物影响肝细胞癌DNA复制起始的报道较少。文中旨在探讨逆转录相关基因(RTGs)在肝细胞癌中的作用及可变剪接和单核苷酸位点变异(SNV)与基因表达异常的相关性。方法选取150只洁净级昆明小鼠,采用随机数字表法取100只,双前肢腋下注射对数生长期肝细胞癌细胞株H22等渗盐水悬液作为H22组,余50只注射0.2 mL不含H22的等渗盐水作为对照组。从H22组小鼠中选出成瘤小鼠,解剖取出瘤体,从对照组小鼠中取健康肝组织。提取H22组和对照组总RNA,分析差异表达基因。筛选差异表达的逆转录相关DEGs(RDEGs),对RDEGs进行GO和KEGG分析。对RDEGs编码蛋白进行互作分析,对RDEGs多态性与基因表达进行相关性分析。结果肝细胞癌中有193个差异表达的RTGs,共参与2个生物学程序、3个细胞组分、1个分子功能、3个信号通路和3个功能部位;其功能主要集中在DNA复制,尤其复制起始中OBGs参与的MCM复合体及端粒复合体构建。可变剪接分析结果显示,4个RDEGs在基因的3个位点发生了差异表达的可变剪接,且可变...

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
0 引 言
1 材料与方法
    1.1 动物模型构建及样本获取
    1.2 RNA提取和测序
    1.3 差异表达基因分析
    1.4 RDEGs的筛选
    1.5 RDEGs的功能分析
    1.6 RDEGs编码蛋白的互作分析
    1.7 RDEGs多态性与基因表达的相关性分析
    1.8 RT-qPCR验证RDEGs
2 结 果
    2.1 测序数据
    2.2 RDEGs分析
    2.3 RDEGs的功能分析
    2.4 肝细胞癌及健康肝组织中的可变剪接和SNV/INDEL
3 讨 论



本文编号：3743161