杂交石斑鱼及其母本褐点石斑鱼免疫相关基因的筛选及功能分析

发布时间：2023-03-18 19:55

　　石斑鱼(Epinephelus spp.)以其味道鲜美、营养丰富、肉质细嫩成为热带和亚热带地区最受欢迎的养殖品种之一。本课题组前期开展了褐点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus,♀)×清水石斑鱼(E.polyphekadion,♂)杂交育种研究,并成功完成杂交石斑鱼子一代的培育。该杂交石斑鱼在免疫应答、抗病力等方面的表现尚不清晰,本研究围绕杂交石斑鱼及其母本褐点石斑鱼在免疫应答方面的差异开展了以下研究:1、杂交石斑鱼和褐点石斑鱼免疫相关组织的转录组测序采用Illumina/Hiseq-2000 RNA-Seq技术对杂交石斑鱼[褐点石斑鱼(E.fuscoguttatus,♀)×清水石斑鱼(E.polyphekadion,♂)]和褐点石斑鱼注射polyI:C 24h后的脾脏和头肾进行RNA-seq测序。共得到62,238条高质量unigenes,平均长度为1,150bp,N50为2,499bp。功能注释结果显示,至少有27,305(43.94%)个unigenes在一个数据库中被注释,有11,622(23.07%)个unigenes在4个数据库中都被注释。根据差异基因...

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 杂交机制研究进展
        1.1.1 显性假说
        1.1.2 超显性假说
        1.1.3 上位性假说
    1.2 杂交石斑鱼的研究进展
        1.2.1 石斑鱼的介绍
        1.2.2 石斑鱼杂交优势的初步探究
    1.3 转录组技术及其在硬骨鱼类中的应用
        1.3.1 转录组的概念
        1.3.2 转录组技术的建立
        1.3.3 转录组技术在鱼类中的研究
    1.4 研究目的与意义
2 杂交石斑鱼和褐点石斑鱼的转录组分析
    2.1 实验材料
    2.2 实验方法
        2.2.1 杂交石斑鱼和褐点石斑鱼组织的收集
        2.2.2 RNA提取和文库的构建
        2.2.3 测序和从头组装de novo
        2.2.4 Unigenes的功能注释
        2.2.5 差异表达基因(DEGs)的筛选和富集分析
        2.2.6 qRT-PCR验证
    2.3 实验结果与分析
        2.3.1 转录组测序和de novo
        2.3.2 Unigenes的功能注释
        2.3.3 差异表达基因的鉴定和富集分析
        2.3.4 转录组qRT-PCR验证
    2.4 讨论
        2.4.1 JAK信号转导子和转录激活因子(STAT)通路
        2.4.2 Toll样受体信号通路
        2.4.3 Wnt信号通路
3 模式受体基因的表达特性分析及IRF3 基因的克隆
    3.1 外周血淋巴细胞的分离和模式受体基因的表达分析
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 实验方法
        3.1.3 实验结果
        3.1.4 讨论
    3.2 IRF3基因的克隆
        3.2.1 实验材料
        3.2.2 实验方法
        3.2.3 实验结果
        3.2.4 讨论
4 PolyI:C和LPS刺激对杂交石斑鱼外周血淋巴中三种酶活力的影响
    4.1 实验材料
    4.2 实验方法
    4.3 实验结果
    4.4 讨论
5 结论
参考文献
致谢
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导师简介



本文编号：3763765