Fmr1基因敲除型小鼠肠道菌群结构分析

发布时间：2023-04-09 23:10

　　目的探讨Fmr1基因敲除型小鼠粪便肠道细菌群落的结构及多样性。方法利用16S rRNA高通量测序技术对10份小鼠粪便样本进行测序分析并进行生物学分析。结果两组样本测序共获得高质量序列325 280条,核心菌门为拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门。Anosim分析表明基因敲除(KO)组与正常野生型(WT)组小鼠两组间具有显著差异,组内样品重复性满足数据分析要求,Adonis分析表明本次检验可信度高(P<0.05)。LDA值展现KO组与WT组小鼠肠道微生态菌群有明显差异,基于Unifrac距离,Amova分析表明KO和WT组组间差异显著(P<0.05)。结论 KO组与WT组小鼠肠道微生物群落的结构及多样性存在显著差异且具有统计学意义,提示孤独症与肠道微生态系统密切相关,肠道微生态系统可能通过微生物代谢的间接作用影响孤独症的发生发展,但具体的作用机制仍需进一步的研究。

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
材料与方法
    1.实验动物
    2.试剂与仪器
    3.方法
        (1) 实验动物基因型鉴定[7]:
        (2) 样本采集
        (3)生物信息学及统计学分析
结 果
    1.实验小鼠鉴定型结果
    2.样本序列及OTUs
    3.Alpha多样性分析
    4.Beta多样性分析
    5.肠道菌群整体结构分析
        (1)共有及特有OTU统计分析
        (2)肠道菌群在门水平的结构分析
        (3)肠道菌群在科水平的结构分析
        (4)肠道菌群在属水平的结构分析
    6.样本组间统计分析
        (1)组间群落结构差异显著性分析
        (2)组间物种差异显著性分析
讨 论



本文编号：3787898