2018年昆明市手足口病病原谱及柯萨奇病毒A组6型病毒基因特征分析

发布时间：2023-05-08 01:58

　　目的了解2018年云南省昆明市手足口病病原谱,并对柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6, CV-A6)完整VP1区基因特征进行分析。方法收集2018年云南省昆明市手足口病实验室监测系统采集的儿童病例粪便标本757份,对标本中肠道病毒(enterovirus, EV)VP1区基因进行逆转录-聚合酶链式反应和测序。用MEGA 5.2软件构建CV-A6系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果 2018年云南省昆明市手足口病病例中的EV核酸检测阳性率为11.62%(88/757),其中CV-A4、CV-A6、CV-A10、CV-A16和EV-A71的阳性率依次为0.66%(5/757)、4.89%(37/757)、2.51%(19/757)、0.92%(7/757)和2.38%(18/757),CV-A9和E11的阳性率均为0.13%(1/757)。CV-A6基因进化分析表明,37株CV-A6均为D3亚型,与国内报道的结果一致。结论 2018年昆明市发生了以CV-A6为主的手足口病暴发,同时存在CV-A10、CV-A16和EV-A71的共同流行。CV-A6毒株在昆明市...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 标本来源
    1.2 方法
        1.2.1 标本处理
        1.2.2 病毒RNA提取
        1.2.3 逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)和病毒型别鉴定
        1.2.4 CV-A6病毒VP1区基因参考序列的选择
        1.2.5 病毒遗传系统进化树分析
2 结 果
    2.1 病毒血清型的基因鉴定结果
    2.2 CV-A6云南分离株完整VP1区基因特征
    2.3 CV-A6各基因型之间的核苷酸和氨基酸差异率
    2.4 昆明CV-A6各分支之间的核苷酸和氨基酸差异率
3 讨 论



本文编号：3811752