清水江斑鳜COI基因序列分析

发布时间：2023-05-14 19:13

　　为了解清水江斑鳜的遗传多样性,试验采集清水江凯里江段和天柱江段2个站点的斑鳜种群个体51尾,利用PCR扩增技术进行细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因测序分析。结果:51个斑鳜样品中,COI基因序列长度为962 bp,共检测到9个多态位点,保守位点952个。其中转换、颠换的位点数分别有7个和2个,不存在转换与颠换共存的基因位点;碱基A+T和C+G的平均含量分别为53.3%和46.7%。清水江斑鳜单倍型多样度为0.650 20,平均遗传距离为0.002 6。凯里江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.001 09,平均核苷酸差异数为1.049 23;天柱江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.001 31,平均核苷酸差异数为1.260 00。51尾个体中包含9个单倍型,2个江段群体间存在共有同一单倍型的情况。在构建的邻接系统进化树中,51个斑鳜样品聚为1支,且置信度高,亲缘关系很接近;与另外8支参照斑鳜归为1支,亲缘关系较近。结论:清水江斑鳜的遗传多样性较为丰富,且2个群体的遗传谱系更接近于洞庭湖和鄱阳湖的斑鳜群体;其中天柱江段斑鳜的遗传多样性比凯里江段斑鳜高,遗传资源更为丰富。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品来源
    1.2 主要仪器
    1.3 主要试剂
    1.4 DNA提取
    1.5 引物设计、PCR扩增及测序
    1.6 数据分析
2 结果与分析
    2.1 PCR扩增
    2.2 碱基组成及变异位点
    2.3 核苷酸变异位点
    2.4 单倍型组成
    2.5 遗传多样性
    2.6 NJ系统进化树及其遗传距离
    2.7 单倍型之间的遗传距离
3 讨论
    3.1 碱基组成及多样性
    3.2 遗传距离与系统进化树
    3.3 清水江斑鳜资源的保护
4 结论



本文编号：3817596