基于TCGA数据库的肾癌自噬相关基因预后模型的建立与应用

发布时间：2023-08-06 18:42

　　目的利用TCGA数据库建立预测肾透明细胞癌预后的自噬相关基因预后模型,分析自噬相关基因预后模型与肾透明细胞癌各临床病理特征之间的关系。方法通过R语言软件筛选出TCGA数据库中肾透明细胞癌样本及正常样本中差异表达的自噬相关基因,Cox比例风险回归模型从中筛选和建立多基因预后模型,计算预后评分。根据预后评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组。利用Kaplan-Meier生存曲线分析高风险组及低风险组生存差异。将临床病理因素和预后评分因素纳入Cox回归模型分析肾透明细胞癌患者的生存影响因素。根据临床病理因素与肾癌自噬相关基因预后模型预后评分的相关性,验证多基因模型对肾透明细胞癌患者中的预后价值。结果共筛选出8个差异基因(BNIP3、ATG16L2、CASP4、RGS19、EIF4EBP1、CX3CL1、SPHK1、BID)建立肾癌自噬相关基因预后模型。预后风险评分(RS)公式为:RS=0.274×ATG16L2的表达量-0.294×BNIP3的表达量+0.415×CASP4的表达量-0.424×RGS19的表达量+0.238×EIF4EBP1的表达量-0.199×CX3CL1的表达量+0....

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 一般资料
    1.2 研究方法
    1.3 统计学方法
2 结果
    2.1 自噬相关差异基因的筛选
    2.2 自噬相关差异基因多基因预后模型的建立
    2.3 TCGA数据库中选取的肾透明细胞癌患者的临床特征
    2.4 肾透明细胞癌患者生存影响因素的Cox回归分析及多指标ROC曲线
    2.5 肾癌自噬相关基因预后模型临床相关性分析
3 讨论



本文编号：3839849