甘薯查尔酮异构酶基因IbCHI的克隆和表达特性

发布时间：2023-11-04 08:43

　　根据甘薯[Ipomoea batatas(Linn.) Lam.]转录组数据,从甘薯品种‘福菜薯7-6’(‘Fucaishu 7-6’)中克隆获得1个编码查尔酮异构酶的基因,命名为IbCHI;IbCHI基因全长732 bp,GC含量为55.19%,共编码243个氨基酸。生物信息学分析结果表明:在IbCHI基因编码的氨基酸序列第12至第214位包含1个Chalcone结构域;IbCHI蛋白分子式为C₁₁₅₆H₁₈₃₁N₂₉₁O₃₅₁S₇,理论相对分子质量为25 646.41,理论等电点为pI 5.25,并可能具有1个跨膜螺旋区,定位于细胞核和细胞膜上;其氨基酸序列中包含24个带正电荷和27个带负电荷的氨基酸残基,丙氨酸、丝氨酸、缬氨酸和甘氨酸所占比例较高,半胱氨酸所占比例最低;IbCHI蛋白的不稳定指数和总亲水性平均系数分别为38.49和0.074,表明IbCHI蛋白是一种稳定的亲水性蛋白质;IbCHI蛋白二级结构中,α螺旋、随机卷曲、延伸链和β转角所占比例分别为39.51%、3...

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 总RNA提取和IbCHI基因克隆
        1.2.2 生物信息学分析
        1.2.3 qRT-PCR分析
        1.2.4 重组载体构建及亚细胞定位
    1.3 数据处理和分析
2 结果和分析
    2.1 IbCHI基因的克隆和生物信息学分析
        2.1.1 IbCHI基因克隆分析
        2.1.2 氨基酸序列的多重比对和同源性分析
        2.1.3 IbCHI蛋白的结构和理化性质
        2.1.4 IbCHI基因启动子区功能分析
    2.2 IbCHI基因的相对表达量分析
        2.2.1 IbCHI基因表达的组织特异性
        2.2.2 干旱和盐胁迫对IbCHI基因相对表达量的影响
    2.3 IbCHI基因的亚细胞定位
3 讨论和结论



本文编号：3859964