金针菇细胞色素c过氧化物酶基因（ffccp）及其在菌柄伸长的差异表达初步分析

发布时间：2024-02-24 19:22

　　细胞色素c过氧化物酶(cytochrome C peroxidase,Cc P)是细胞内H2O2的主要降解酶,参与真菌的氧化应答过程。本研究基于基因组数据获得一个金针菇细胞色素c过氧化物酶编码基因,命名为ffccp。该基因全长1 913bp,包含一个1 098bp的完整开放阅读框,编码365个氨基酸。生物信息学分析结果显示,该基因编码的蛋白质(Ff Cc P)无跨膜结构和信号肽,不形成二硫键结构,亚细胞定位于线粒体上,具备血红素结合蛋白的保守位点。序列比对和进化分析结果显示,金针菇与糙皮侧耳Pleurotus ostreatus等大型真菌的Cc P序列高度相似(相似度均超过70%),属于Cc P家族蛋白。RT-q PCR的检测结果显示,氧化胁迫和损伤胁迫均能诱导ffccp基因上调表达,但两种胁迫对ffccp表达的调控机制可能并不相同。进一步检测ffccp在子实体发育过程中的差异表达情况,发现ffccp在伸长期菌柄出现显著上调表达,且表达量与菌柄伸长速度的相关性达到0.998,为极强正相关。推测ffccp的上调表达可能有利于菌柄的伸长。

【文章页数】：13 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试菌株
    1.2 基因组及转录组数据
    1.3 金针菇I类血红素过氧化物酶注释与基因序列分析
    1.4 氨基酸序列特征分析
    1.5 多序列比对与进化树构建
    1.6 样品的处理与收集
        1.6.1 损伤胁迫处理：
        1.6.2 过氧化氢胁迫处理：
        1.6.3 子实体培养与取样标准：
    1.7 RNA提取及定量PCR检测基因相对表达量
    1.8 数据统计
2 结果与分析
    2.1 金针菇I类血红素过氧化物酶注释与基因序列结构
    2.2 金针菇Ff Cc P氨基酸序列及其生物信息学分析
    2.3 FfCcP的系统进化与序列保守性分析
    2.4 金针菇ffccp基因在胁迫应答过程中的差异表达
    2.5 金针菇ffccp基因在子实体发育过程的差异表达
3 讨论



本文编号：3909502