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基于MHC-DRB基因的塔里木马鹿遗传多样性及适应性进化研究

发布时间:2024-05-10 00:33
  主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)是脊椎动物免疫系统的一个多基因家族,是有高度多态性基因座组成的、与免疫应答和抗病性密切相关的多基家族。MHC基因已被认为是研究脊椎动物适应性进化机制的最佳候选标记,这一观点已经被大量的研究认定。目前,进化遗传学和分子生态学最为热点就研究MHC基因多态性及其进化机制。到目前为止,在鹿科动物MHC-DRB基因的进化机制方面的研究一直缺乏来自塔里木马鹿的研究证据。塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)是新疆马鹿之中高度适应荒漠生境而形成的特殊亚种,是国家Ⅱ级保护动物,又是重要的经济动物。本研究MHC-DRB基因作为分子标记,研究塔里木马鹿MHC-DRB的多态性及适应性进化机制。主要研究结果如下:1.本研究通过PCR-SSCP和克隆测序技术,利用牛DRB3特异性引物,从51个塔里木马鹿样本中检测出13个DRB等位基因,该13个等位基因序列包含76个核苷酸变异(24个单突变位点和52个简约信息位点),总位点数中变异位点数占30.5%。本研究所得的13条等位基因序列中G、C...

【文章页数】:61 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1-1野生塔里木马鹿Fig1-1WildCervuselaphusyarkandensis

图1-1野生塔里木马鹿Fig1-1WildCervuselaphusyarkandensis

其数量减少到100头左右[37],其目前情况相当危险;2006年结果表塔里木河中游马鹿种群数量为21-71头左右(采用截线抽样法调查)[27];最近道的研究结果为:塔里木河下游马鹿种群数量为50-102头,种群总数量降低451头处于极濒危状态[38,39]。1.....


图1-2MHCI类和II类分子的结构示意图(HughesandYeager,1998)

图1-2MHCI类和II类分子的结构示意图(HughesandYeager,1998)

键作用的多基因家族之一,通常具有高度多态性以抵御各种病原体。基于结构和功能上,MHC一般分为I、II和III类。mhcI和II类分子都作为体发挥作用。MHCI分子类异二聚体由MHC蛋白和非MHCβ2微球蛋白成[60]。相比之下,MHCⅡ类蛋白作为....


图2-1基因组DNA的电泳检测结果

图2-1基因组DNA的电泳检测结果

新疆大学硕士研究生学位论文后续分析。用DnaSPVersion6[140]软件来计算种群内的核苷酸多样度(Nucleotidediversity,π)单倍型多样性(Haplotypediversity,H)。2.5实验结果2.5.1基因组DNA的检测从血液和肌肉样....


图2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白检测仪检测样品的基因组DNA浓度和纯度Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotometer

图2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白检测仪检测样品的基因组DNA浓度和纯度Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotometer

2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白检测仪检测样品的基因组DNA浓度和Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotomet.5.3塔里木马鹿MHC-DRB的PCR产物....



本文编号:3968589

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