盐胁迫下棉花根系的转录组分析及耐盐基因筛选

发布时间：2024-06-11 23:08

　　为揭示棉花耐盐分子机制,筛选出棉花盐胁迫应答相关基因.文章从4个新疆主栽棉花品种中筛选得到一个对盐胁迫具有强耐受性的‘新陆中69号’,并在盐胁迫下对棉花根系进行了转录组分析.结果表明:有891个基因表达量上调,666个基因表达量下调; GO富集分析结果表明:差异表达基因数量较多的主要集中在分子功能、细胞组分、生物学过程中; KEGG分析结果表明:差异表达基因主要参与木质素生物合成和植物MAPK信号通路.

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【部分图文】：

图1棉花品种间耐盐性比较

选择经0.50%NaCl处理的新陆中69号品种根系提取RNA，进行转录组分析．IlluminaHiseq平台测序结果表明:CK1、CK2、NaCl1、NaCl2获得的原始Reads分别是49841082、41348682、42165466、45793106....

图2棉花根系差异表达基因的火山图

与对照材料相比(图2)，经过0.50%NaCl处理6d后的棉花植株中有1557个基因表达量发生显著变化．其中，在盐胁迫条件下，有891个基因表达量增加，而666个基因表达量出现下调．2.4差异表达基因GO和KEGG注释分析

图3棉花根系差异表达基因的GO和KEGG注释分析

利用qRT-PCR检测棉花盐胁迫处理后上述基因的表达变化，结果表明:编号为Cot-AD05721和Cot-AD49287的基因上调表达;编号为Cot-AD54195、Cot-AD56209、Cot-AD17346、Cot-AD34390、Cot-AD50458、Cot....

图4qRT-PCR检测在棉花盐胁迫时差异基因的表达

图3棉花根系差异表达基因的GO和KEGG注释分析3讨论

本文编号：3992851