9个玉米DOF基因对逆境胁迫的响应模式分析

发布时间：2024-12-01 06:13

　　 植物DOF (DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育及代谢途径中发挥着重要作用。该研究采用qRT-PCR方法分析了玉米应答逆境(盐、干旱、硝态氮缺乏和铵态氮缺乏)胁迫条件下9个ZmDOFs基因的表达模式。结果表明:(1)生物信息学分析显示,9个ZmDOF基因散布于5个染色体上,聚类为一个基因亚家族,且9个基因还可以细分为4个小亚家族。(2)9个ZmDOFs基因的表达具有组织特异性,且主要在玉米的穗和雄花中表达,其中ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11和ZmDOF12在穗部的表达量分别是根部的18倍、60倍、11倍和75倍以上,ZmDOF19、ZmDOF26、ZmDOF27和ZmDOF42在雄花中的表达量分别是根部的360倍、28倍、13倍和44倍以上,推测这些基因在玉米的雄花和穗的生长发育进程中具有重要的作用。(3)实时定量qRT-PCR方法显示,在硝态氮胁迫下有7个ZmDOFs基因强烈诱导表达(>5倍),其中ZmDOF12、ZmDOF27和ZmDOF42基因的表达超过10倍,表明这些基因参与调控硝...

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图2 玉米9个ZmDOFs的进化树分析

表2玉米9个ZmDOFs的生物信息Table2Bioinformationof9ZmDOFs基因名称Genename基因位点Genelocus大小Size/aa分子量MW/kDa等电点pI染色体位置Chromosomeposition可变剪切Spl....

图1 玉米9个ZmDOF基因的基本信息

图2玉米9个ZmDOFs的进化树分析利用在线软件MEME来预测这9个蛋白主要的功能基序,检测到6个功能基序(图3,A),其中Motif1和Motif3分布于所有的9个蛋白中。Motif1主要包含有锌指结构CX2CX21CX2C,是植物DOF蛋白典型的功能基序,可能参与基因顺式....

图3 玉米9个ZmDOF保守蛋白基序分布示意图

相比之下,在铵态氮胁迫下,这些基因的表达量变化幅度要小很多。图8结果显示,有7个基因(ZmDOF1、ZmDOF4、ZmDOF11、ZmDOF12、ZmDOF19、ZmDOF27和ZmDOF42)受铵态氮胁迫的强烈诱导(>2倍)。ZmDOF4受铵态氮胁迫诱导的幅度最大,其表达量....

图4 玉米9个ZmDOF基因在玉米不同器官中的表达分析

图3玉米9个ZmDOF保守蛋白基序分布示意图图5NaCl溶液胁迫处理下9个ZmDOFs的表达模式分析

本文编号：4013663