微滴数字PCR分析肺癌患者外周血SHOX2基因甲基化的应用价值

发布时间：2025-01-13 23:08

　　肺癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤。由于肺癌早期起病隐匿,大部分患者被诊断时多处于中晚期,易错过最佳治疗时期,五年生存率较低,提高肺癌的诊断率至关重要。目前,临床诊断肺癌的方法主要有组织细胞学、影像学及血清肿瘤标志物检查。随着对肿瘤发病机制的研究深入,DNA甲基化在肿瘤发生发展中的作用机制备受关注,其中基因组低甲基化和CpG岛局部高甲基化可通过介导肿瘤相关基因功能改变诱发肿瘤。人矮小同源盒基因2（short stature homeobox 2,SHOX2）属于SHOX基因家族成员,主要编码蛋白转录因子,该基因表达异常或表观遗传学改变可引起某些疾病。许多研究表明SHOX2基因甲基化与肺癌有关。目前SHOX2基因甲基化检测主要借助组织活检,这种方法具有侵入性、风险较大且获取的肿瘤组织有异质性,而选用液体活检,对血液或其它体液标本进行SHOX2基因甲基化检测可弥补组织活检的缺陷。通常用于SHOX2基因甲基化检测的方法有甲基化特异性PCR、亚硫酸氢盐测序和荧光定量PCR。这些方法虽然有较好的灵敏性和特异性,但仍存在一些不足,例如不易从复杂样品中准确地定量微量的靶核酸。近年来,新型的微滴数字PC...

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图3.1.1ddPCR优化退火温度结果（一维图：蓝色信号代表SHOX2基因甲基化阳性，灰色信号代表阴性）

退火温度的结果显示（图3.1.1），在50℃⁶0℃之间，荧光信低先增强后减弱，当温度在56.3℃⁵8.3℃范围时，观察到阳较明显，为了提高结果特异性，选择58℃作为ddPCR检测S的最适退火温度。

图3.1.2.1PCR扩增产物电泳图谱

图3.1.2.1PCR扩增产物电泳图谱（m:600bpLadder，1-2:甲基化对照品，3-4:非甲基化对照，5:空白对照）Figure3.1.2.1ElectrophoreticpatternofPCRproductoftargetgenes(m:600....

图3.1.3标准品ddPCR检测结果：一维图显示在不同甲基化水平的标准品中SHOX2基因甲基化检测结果（A）和SHOX2基因甲基化水平（Ratio），误差线表示泊松95%置信区间（B）

.1.3标准品ddPCR检测结果：一维图显示在不同甲基化水平的标准品中SHOX2基检测结果（A）和SHOX2基因甲基化水平（Ratio），误差线表示泊松95%置信区间gure3.1.3ddPCRresults:1-Dgraphshowsresulto....

图3.3.1SHOX2基因甲基化诊断肺癌ROC曲线（肺癌组III/IV期vs正常组）

基因甲基化诊断肺癌ROC曲线（肺癌组III/ofthediagnosisoflungcancerbySHOX2methstageIII/IVlungcancerpatients)甲基化在肺癌中的临床应用价值疾病组中，肺癌组SHOX2基因甲病组....

本文编号：4026035