miR-320在骨髓增生异常综合征中的表达分析及其靶基因预测

发布时间：2017-06-04 09:18

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【摘要】：1、研究目的为了探究mi R-320在骨髓增生异常综合征(Myelodysplastic syndrome,MDS)中可能的作用机制,本研究拟以前期利用micro RNA芯片技术在MDS患者中筛选出的特异性micro RNA为基础,筛选出具有显著表达差异的mi R-320进行其表达水平的检测。由于mi R-320a在肿瘤表达中更为常见,具有研究意义,利用生物信息学预测其直接靶基因,并进行GO分析及Pathway分析了解潜在的作用通路,为MDS患者的诊断和治疗提供新的理论基础。2、研究方法在前期研究的micro RNA芯片检测结果中筛选出具有表达差异的mi R-320等7个具有表达差异的基因。利用Real-time PCR检测技术在10例MDS初治患者、5例初治MDS转白患者及5例正常对照组中检测筛选出的micro RNA表达水平的验证。挑选出具有明显表达差异及统计学意义的micro RNA进行扩大样本量的Real-time PCR检测,检测样本包括52例初治MDS患者标本(31例低危+中危1,21例中危2+高危)、16例初治MDS转白患者标本及19例正常对照者标本,并分析它们的表达量与MDS患者临床病理特征的相关性。通过生物信息学技术预测具有差异表达的mi R-320a在MDS中的直接靶基因,以及靶基因所富集的基因功能注释和信号转导通路。结合文献报道筛选出差异表达的mi R-320a在MDS中的潜在靶基因。3、研究结果⑴、从前期研究的micro RNA芯片检测结果中筛选出包括mi R-320a和mi R-320d在内的7个具有表达差异的micro RNA。其中,mi R-320a和mi R-320d在MDS中的表达上调。利用Real-time PCR实验在10例MDS患者、5例MDS转白患者及5例正常对照组中检测mi R-320a和mi R-320d的表达水平,结果显示mi R-320a和mi R-320d的表达量在MDS各组中均高于在正常对照组(P0.05),且在中危2+高危组和MDS转白组中的表达量均比在低危+中危1组中的表达量高。⑵、利用Real-time PCR实验在52例MDS患者、16例MDS转白患者及19例正常对照者中检测mi R-320a/d的表达水平,结果显示mi R-320a/d在总的MDS样本中mi R-320a/d的表达量比正常对照组的表达量高,是正常对照组的3.18倍(P=1.35×10-6),并且在所有MDS亚组中的表达均比正常对照组的升高。mi R-320a/d在低危+中危1组中的表达量是正常对照组的1.87倍(P=1.00×10-4),在中危2+高危组中的表达量是正常对照组的3.78倍(P=6.65×10-9),在MDS转白组中的表达量是正常对照组的4.74倍(P=5.22×10-11)。⑶、将MDS患者的骨髓原始细胞比例与mi R-320a/d在MDS中的表达量进行相关分析得出,MDS患者骨髓原始细胞比例与mi R-320a/d在MDS中的表达量呈正相关(r=0.76,P=8.40×10-10)。⑷、利用生物信息学技术,预测mi R-320a的潜在靶基因,得到81个交集靶基因,结合文献报道预测mi R-320a的靶基因为PCDH9。GO分析结果显示,mi R-320a主要富集于缩短核转录m RNA poly(A)尾、m RNA分解代谢过程、蛋白结合作用、核孔复核体等基因功能注释(P0.05)。Pathway分析结果显示mi R-320a主要富集于轴突导向生长、RNA降解、结直肠癌形成、病毒介导的癌症形成、溶酶体通路等信号转导通路(P0.05)。GO分析及Pathway分析结果表明mi R-320a主要通过与m RNA相互作用参与了基因表达水平的调控,并在肿瘤的病理机制中起到重要的作用。4、研究结论⑴、mi R-320a/d在MDS患者中表达量明显增高,且根据MDS危险度的增加,其表达水平明显递增,并且MDS患者骨髓原始细胞比例与mi R-320a/d在MDS中的表达量呈正相关,提示它可能参与了MDS的发病机制和疾病进展。⑵、通过生物信息学分析mi R-320a在MDS中潜在的作用靶基因为PCDH9,提示mi R-320a在MDS中可能通过下调PCDH9来行使其生物学功能。
【关键词】：microRNA 骨髓增生异常综合征 miR-320a miR-320d 靶基因
【学位授予单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R551.3
【目录】：

• 个人简历3-5
• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 前言11-14
• 材料与方法14-26
• 实验结果26-37
• 讨论37-44
• 结论44-45
• 参考文献45-53
• 附录 缩略词表53-54
• 综述54-66
• 参考文献61-66
• 致谢66-67
• 攻读硕士期间发表的文章67-68

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1 黄莹;miR-320在骨髓增生异常综合征中的表达分析及其靶基因预测[D];广西医科大学;2016年

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本文编号：420568