miR-223基因家族的分子进化与靶基因预测

发布时间：2017-06-22 07:06

  本文关键词：miR-223基因家族的分子进化与靶基因预测，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:分析所有miR-223基因家族成员的序列特征,并对miR-223靶基因进行预测,然后分析miR-223靶基因的生物学功能。方法:利用Clustal X 1.83软件分析miR-223基因序列特征,MEGA 5.0软件分析进化关系,再运用TargetScan、PicTar和miRDB进行靶基因预测,最后GO和KEGG进行功能分析。结果:在miRBase数据中获得miRNA-223基因家族成员的序列27条,绝大部分位于基因间隔区,少数成员的基因位置未知。大部分定位于X染色体,部分成员位于常染色体。miRNA-223成熟序列长度在20-23nt之间,同源性较高。系统进化树分析表明,miRNA-223基因家族成员分为三支。预测获得人类miRNA-223的可能具有27个靶基因,它们主要与信号转导、转录调控以及细胞生长发育等密切相关。结论:本研究结果不仅有利于理解miR-223基因家族的生物学功能,也可为后续研究提供理论依据。
【作者单位】： 川北医学院附属医院检验科;川北医学院附属医院医学研究中心;川北医学院附属医院风湿免疫科;
【关键词】： miRNA- 分子进化 靶基因 功能分析
【基金】：国家自然科学基金(81272047) 四川省教育厅科研项目(15ZB0197) 南充市科技支撑项目(14A0061) 川北医学院科研发展计划博士科研启动基金(CBY14-QD-07,CBY13-QD-03)
【分类号】：R3416
【正文快照】： miRNAs是一类大小约20~25个核苷酸的内源性非编码小分子,广泛存在于病毒,植物,人类等真核生物[1]。早在1993年,Lee等[2]从线虫中发现了第一个小RNA—lin-4。之后,Reinhart等[3]发现了第二个小RNA—let-7,它们参与线虫发育的时序调控。2001年,三个不同的研究小组同时鉴定了多个

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本文编号：470975