浙江省宁波市2015年麻疹野毒株核蛋白和血凝素蛋白基因分析

发布时间：2017-06-30 02:01

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【摘要】：目的了解宁波市2015年麻疹野毒株核蛋白(N)基因及血凝素蛋白(H)基因特征。方法对宁波市2015年分离的麻疹野毒株进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增N基因,随机选取20株扩增H基因,序列测定后与基因库中麻疹病毒各基因型参考株比对分析。结果宁波2015年分离麻疹病毒38株,均为H1a基因亚型,核苷酸和氨基酸的同源性分别为98.2%~100%和98%~100%,与H1a亚型参考株china93-7的同源性分别为98.0%~98.9%和97.3%~99.3%;与H1b亚型参考株china94-7的同源性分别为96.6%~96.8%和96%~98%;与中国疫苗株S191的同源性为90.6%~91.7%和87%~89.3%。H基因核苷酸和氨基酸之间的同源性分别为97.9%~99.9%和98.9%~100%;与疫苗株S191的同源性分别为93.7%~94.1%和94.7%~95.4%。H蛋白240位和397位氨基酸分别发生从Ser到Asn、从Pro到Leu的变化。结论宁波市2015年流行的麻疹野毒株主要为H1a基因亚型。与S191相比有较大变异,H基因有较大差异,应加强对H、N基因的常规监测。
【作者单位】： 宁波市疾病预防控制中心;
【关键词】： 麻疹病毒 基因型 序列分析 血凝素蛋白 核蛋白
【基金】：宁波市科技创新团队项目(编号:2012B82018) 浙江省医学重点学科(编号:07-013)
【分类号】：R373
【正文快照】： 麻疹病毒为单股负链核糖核酸(RNA),基因组全长16 kb,共包含6个结构基因,编码8个蛋白。6个结构蛋白由结构基因编码,从3'到5'端依次为核蛋白(N)、磷酸化蛋白(P)、基质蛋白(M)、融合蛋白(F)、血凝素蛋白(H)和依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白(L)。6个结构基因中,H基因和N基因变异较大,含

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本文编号：500109