苦豆子抗盐相关基因的筛选及功能分析
本文关键词:苦豆子抗盐相关基因的筛选及功能分析,,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:土壤盐渍化是目前制约农业生产的一个全球性问题,全球约有20%的耕地受到盐害威胁,43%的耕地为干旱、半干旱地区。盐害严重影响植物的生长发育,造成作物减产,并使生态环境日益恶化。在自然条件下,由于环境胁迫而严重影响了作物生长发育,其遗传潜力难以发挥,盐渍不仅影响了作物的产量,而且限制了植物的广泛分布,因此,提高作物的耐盐能力已成为抗逆育种急需解决的关键问题之一。随着分子生物学的发展和转基因技术的成熟,利用转基因技术提高植物的耐盐碱性,已在盐碱土壤改良方面得到广泛的应用。同时,以旱生、耐盐碱植物为研究材料,从中分离克隆得到耐盐碱性显著的基因,是获得抗性基因资源的有效方法。苦豆子(Sophora alopecuroides)为豆科槐属植物,别名、苦豆草、欧苦参等,为多年生草本、根茎地下芽旱生耐盐植物。其耐旱、耐盐性显著,是一个抗性基因丰富的基因资源库。本研究利用苦豆子c DNA酵母表达文库对苦豆子抗盐相关基因进行筛选,并筛选到了2个抗盐相关基因,苦豆子肌醇甲基转移酶基因(Sa IMT)和苦豆子水通道蛋白基因(Sa AQP),同时对其结构初步分析,并利用豆科模式转化系统进一步验证了该基因的抗盐性。为后续抗逆育种奠定理论依据与物质和技术基础。主要研究结果如下1以苦豆子在Na Cl盐胁迫下的根为实验材料,利用SMART法构建全长c DNA文库,构建完成的c DNA酵母表达文库得到的总克隆数为2.3×107Cfu,文库滴度为7.7×106Cfu/ml,插入片段长度约在1.2kb-2.0kb之间,相关参数均符合表达文库质量标准。2利用酵母植物抗逆筛选体系对苦豆子苗期根的c DNA酵母表达文库进行筛选,共筛选到16个抗盐克隆,对这16个基因进行测序及序列比对后,最终得到了2个抗盐相关基因,分别是苦豆子肌醇甲基转移酶基因(Sa IMT)和苦豆子水通道蛋白基因(Sa AQP)。Sa IMT开放阅读框为1095bp,编码364个氨基酸;Sa AQP开放阅读框为753bp,编码250个氨基酸。3对筛选得到的Sa IMT和Sa AQP进行生物信息学分析,发现Sa IMT与其他物种的IMTs蛋白、Sa AQP与其他物种的AQPs蛋白均有较高的同源性和较近的亲缘关系,同时Sa IMT与大豆Gm IMT、Sa AQP和拟南芥At AQP在蛋白序列结构域上均很保守,而二者的蛋白质三级结构都非常相似,预示Sa IMT、Sa AQP与其同源基因有着相似的功能。4对Sa IMT和Sa AQP在苦豆子不同组织中的表达情况进行分析,发现Sa IMT和Sa AQP在根中的表达量都显著高于叶片和茎;对苦豆子幼苗进行Na Cl盐胁迫处理后,Sa IMT和Sa AQP基因的在胁迫初期表达都有明显的升高。5将Sa IMT和Sa AQP利用豆科模式转化系统转化发根农杆菌K599,侵染大豆诱导发状根,对转基因大豆发状根和转基因大豆发状根植物复合体进行Na Cl盐胁迫处理,鉴定Sa IMT和Sa AQP的抗盐性。结果表明,转Sa IMT和Sa AQP的大豆发状根和大豆发状根植物复合体的耐盐性均明显提高,说明Sa IMT和Sa AQP能提高转基因大豆的耐盐性。
【关键词】:苦豆子 cDNA文库 发根农杆菌 抗盐性 功能分析
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:Q943.2
【目录】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-13
- 中英文做略语表13-14
- 第1章 绪论14-25
- 1.1 盐害及植物耐盐生理14-15
- 1.1.1 盐对植物的危害14
- 1.1.2 植物耐盐生理14-15
- 1.2 耐盐基因的研究进展15-18
- 1.2.1 植物根部在盐胁迫下的基因调控15
- 1.2.2 Na+和K+的转运网络15-16
- 1.2.3 Na+/H+转运蛋白NHX和SOS16-17
- 1.2.4 高亲和K +转运载体17
- 1.2.5 渗透调节物质17-18
- 1.3 肌醇甲基转移酶的研究进展18-19
- 1.3.1 松醇的生理作用18-19
- 1.3.2 松醇的合成途径19
- 1.4 水通道蛋白的研究进展19-21
- 1.4.1 水通道蛋白的分类19-20
- 1.4.2 水通道蛋白的生物学功能20
- 1.4.3 AQPs参与植物盐胁迫应答的途径20-21
- 1.5 苦豆子研究进展21-22
- 1.6 分子生物学研究方法22-23
- 1.6.1 cDNA文库22-23
- 1.6.2 豆科模式转化系统23
- 1.7 本研究的目的和意义23-25
- 第2章 苦豆子苗期酵母表达文库的构建及抗盐基因的筛选25-41
- 2.1 材料25-26
- 2.1.1 植物材料25
- 2.1.2 菌株25
- 2.1.3 酶及试剂25
- 2.1.4 引物25
- 2.1.5 主要仪器设备25-26
- 2.1.6 试剂配制26
- 2.2 方法26-33
- 2.2.1 植物材料的处理26-27
- 2.2.2 苦豆子叶片丙二醛(MDA)含量测定27
- 2.2.3 苦豆子叶片相对含水量(RWC)测定27-28
- 2.2.4 苦豆子总RNA的提取28
- 2.2.5 苦豆子苗期E.colicDNA文库的质量检测28-29
- 2.2.6 苦豆子苗期cDNA文库质粒提取29-30
- 2.2.7 酿酒酵母INVSC1感受态的制备30
- 2.2.8 文库质粒大规模转化酿酒酵母INVSC1感受态细胞30-31
- 2.2.9 苦豆子苗期酵母表达cDNA文库的构建31
- 2.2.10 酵母植物抗逆基因筛选体系筛选苦豆子抗盐相关基因31-33
- 2.2.11 候选基因的生物信息学分析33
- 2.3 结果与分析33-39
- 2.3.1 苦豆子叶片丙二醛(MDA)含量测定33-34
- 2.3.2 苦豆子叶片相对含水量(RWC)测定34-35
- 2.3.3 苦豆子苗期E.colicDNA文库重组率及插入片段长度鉴定35-36
- 2.3.4 苦豆子苗期酵母表达cDNA文库重组率及插入片段长度鉴定36-37
- 2.3.5 筛选到苦豆子抗盐相关基因的生物信息学分析37-39
- 2.4 讨论39-40
- 2.5 小结40-41
- 第3章 SaIMT和SaAQP基因的生物信息学分析及表达模式分析41-57
- 3.1 材料41
- 3.1.1 植物材料41
- 3.1.2 酶及试剂41
- 3.1.3 引物41
- 3.1.4 主要仪器设备41
- 3.2 方法41-44
- 3.2.1 材料处理及取样41-42
- 3.2.2 植物总RNA的提取42
- 3.2.3 cDNA的合成42-43
- 3.2.4 生物信息学分析43
- 3.2.5 实时荧光定量PCR43-44
- 3.3 结果44-55
- 3.3.1 SaIMT基因的生物信息学分析44-48
- 3.3.2 SaAQP基因的生物信息学分析48-52
- 3.3.3 SaIMT和SaAQP基因在苦豆子不同组织中的表达52-53
- 3.3.4 NaCl胁迫处理下苦豆子中SaIMT和SaAQP基因的表达53-55
- 3.4 讨论55-56
- 3.5 小结56-57
- 第4章 SaIMT基因和SaAQP基因在大豆发状根中的抗盐性分析57-75
- 4.1 材料57-59
- 4.1.1 植物材料57
- 4.1.2 菌株及质粒57
- 4.1.3 酶及试剂57-58
- 4.1.4 引物58
- 4.1.5 主要仪器设备58
- 4.1.6 试剂及培养基配制58-59
- 4.2 方法59-66
- 4.2.1 植物表达载体pCHF1301SaIMT和pCHF1301SaAQp的构建59-62
- 4.2.2 K599发根农杆菌感受态细胞的制备62
- 4.2.3 电击法转化K599感受态细胞62-63
- 4.2.4 发根农杆菌的遗传转化63-64
- 4.2.5 转基因大豆发状根的筛选及鉴定64-65
- 4.2.6 转基因大豆发状根的耐盐性分析65-66
- 4.3 结果66-73
- 4.3.1 植物表达载体pCHF1301SaIMT和pCHF1301SaAQp的构建与鉴定66
- 4.3.2 转基因的大豆发状根的筛选及鉴定66-67
- 4.3.3 转SaIMT和SaAQP基因大豆发状根的耐盐性分析67-73
- 4.4 讨论73-74
- 4.5 小结74-75
- 结论75-77
- 参考文献77-90
- 作者简介及科研成果90-91
- 致谢91
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