西洋梨水孔蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析

发布时间：2017-08-28 12:44

  本文关键词：西洋梨水孔蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析

  更多相关文章： 西洋梨 水孔蛋白 全基因组分析 表达分析

【摘要】：水孔蛋白(AQPs,aquaporins)是高效转运水分子的膜内在蛋白,具有丰富的多样性,在调控植物的水分关系中有重要作用。本研究利用西洋梨(Pyrus communis L.‘Bartlett’)基因组数据库,通过生物信息学手段鉴定西洋梨PcAQPs基因家族成员;并利用MEGA 6.0.5软件,采用邻接法构建系统发育树;利用GSDS 2.0软件进行基因结构分析,MEME程序进行Motif分析,AgBase v2.00程序进行GO分析;采用半定量RT-PCR技术研究PcAQPs基因组织表达情况。结果表明,西洋梨基因组中共有54个PcAQPs家族成员,均含有AQP特征结构域和保守的Motif基序,根据基因结构及系统进化分析可分为PIP、TIP、NIP和SIP等4个亚家族。不同基因间结构差别较大,但聚类关系较近的基因其结构类似。GO分析发现,多数PcAQPs基因具有转运蛋白活性,参与物质转运、应激反应、发育和代谢等生物学过程,但不同亚家族成员构成的细胞组分及参与的生物学过程具有明显差异。半定量结果表明,大多数PcAQPs基因在根、茎、叶和果实中均有表达,而且不同基因家族、不同基因间的组织表达模式存在差异。该研究为今后西洋梨PcAQPs基因的克隆和功能分析奠定了基础。
【作者单位】： 山东省果树研究所;
【关键词】： 西洋梨 水孔蛋白 全基因组分析 表达分析
【基金】：山东省农业科学院青年科研基金(2015YQN41) 山东省良种工程项目(梨优质矮化、多抗功能基因挖掘与种质创新利用2014) 现代农业(梨)产业技术体系(CARS-29) “十二五”农村领域国家科技计划(2014BAD16B034) 山东省自然科学基金(ZR2015YL075)
【分类号】：S661.2
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1520.010.html跨膜运输途径,即水分跨过液泡膜和质膜的运输途径,是水分在植物组织内运输的主要方式之一。水分跨膜运输以两种方式进行:通过脂双层的自由扩散运输和水孔蛋白的跨膜运输[1]。水孔蛋白,又称水通道蛋白(AQ

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 曹玉芬,李树玲;德国的2个早熟西洋梨品种[J];中国果树;2001年02期

2 安广池;极早熟优质西洋梨品种——早佳梨[J];农业科技通讯;2003年12期

3 高华君;红色西洋梨品种选择及栽培技术[J];现代种业;2003年06期

4 刘军,魏钦平,王小伟,鲁韧强;适合北方发展的西洋梨品种[J];农业新技术;2005年03期

5 刘军,魏钦平,王小伟,鲁韧强;适合北方发展的西洋梨品种[J];果农之友;2005年08期

6 刘军;魏钦平;王小伟;鲁韧强;;适合北方发展的西洋梨品种[J];北京农业;2006年03期

7 丁菊凤;鲁军熙;;几个西洋梨品种简介[J];山西果树;2006年03期

8 冯月秀;王琨;李丛玺;;红皮西洋梨红星在陕西的表现及栽培要点[J];中国南方果树;2007年06期

9 曹玉芬;德国的两个早熟西洋梨品种[J];柑桔与亚热带果树信息;2001年07期

10 王林军 ,鞠巍 ,王佳强;西洋梨新优品种简介[J];中国果菜;2001年06期

中国重要会议论文全文数据库 前6条

1 方成泉;林盛华;李连文;王斐;;西洋梨优良品种[A];全国第四届梨科研、生产与产业化学术研讨会论文集[C];2005年

2 王志刚;方成泉;李天忠;;红皮西洋梨果实成色机理研究进展[A];梨科研与生产进展（五）[C];2011年

3 张建光;张晓峰;;世界西洋梨生产现状及栽培技术特点[A];梨科研与生产进展（五）[C];2011年

4 孙清荣;孙洪雁;刘庆忠;;西洋梨组培快繁及其叶片不定梢诱导研究[A];中国青年农业科学学术年报[C];2002年

5 李树玲;穆瑞维;魏新;张桂霞;阎国荣;;西洋梨品种染色体数目鉴定[A];全国第四届梨科研、生产与产业化学术研讨会论文集[C];2005年

6 方成泉;蒲富慎;陈欣业;徐汉英;贾敬贤;;梨种间杂交与育种[A];中国园艺学会首届青年学术讨论会论文集[C];1994年

中国重要报纸全文数据库 前6条

1 记者 付亚萍;美国西洋梨 首度进入中国市场[N];中国食品报;2013年

2 赵金忠;西洋梨变身“摇钱树”[N];中国质量报;2012年

3 张绍玲;国际梨产业发展走势[N];农民日报;2009年

4 本报记者 顾磊;多种好看好吃的水果亮相科技兴农展[N];江苏农业科技报;2011年

5 本报记者 贾婧邋通讯员 李珊 孙昊;大兴梨产业优化升级技术项目产出巨大效益[N];科技日报;2008年

6 山西省农科院农产品贮藏保鲜研究所 石建新 李建华;梨的贮藏保鲜技术[N];河北科技报;2004年

中国硕士学位论文全文数据库 前3条

1 孙启兰;红色西洋梨新品种引进及利用研究[D];山东农业大学;2009年

2 李学伟;西洋梨后熟和1-甲基环丙烯延缓后熟衰老机理的研究[D];新疆农业大学;2010年

3 王斐;梨新品种及其亲本的AFLP分析[D];中国农业科学院;2006年

，

本文编号：747984