马尾松GGPPS基因克隆及序列分析

发布时间：2017-09-14 08:38

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【摘要】：r{牛儿基r{牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)是萜烯类物质合成的关键酶之一,本研究通过同源序列检索分析设计引物,从马尾松幼苗针叶组织中克隆到其GGPPS基因,命名为Pma GGPPS,该基因c DNA长1 143bp,开放阅读区编码380个氨基酸。Pma GGPPS编码的蛋白质序列分析显示具有Trans IPPS结构域及FARM、SARM两个富含天冬氨酸区域,序列特点与GGPPS蛋白的酶学功能相符。同源性分析结果显示Pma GGPPS核酸序列与其他两种松属植物GGPPS基因同源性达到99%以上,Pma GGPPS编码蛋白与挪威云杉等植物中GGPPS蛋白同源性也在69%以上。对Pma GGPPS编码蛋白进行理化性质及结构的生物信息学分析,结果显示该蛋白为一种无信号肽、无跨膜区的碱性蛋白质,二级结构由16段α-螺旋组成,三级结构同源建模显示与欧薄荷的异聚r{牛儿基焦磷酸合酶大亚基同源性最高。系统进化树分析显示该蛋白与红豆杉、银杏亲缘关系较近。本研究中克隆得到Pma GGPPS基因为深入研究其在松脂合成的影响奠定了基础,同时根据GGPPS基因设计荧光定量引物并优化反应条件,为下一步研究基因表达水平与产脂力关系提供了理论依据和技术参考。
【作者单位】： 广西林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室;
【关键词】： 马尾松 r{牛儿基r{牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS) 基因克隆 荧光定量PCR
【基金】：广西自然科学基金项目(2014GXNSFBA118106) 广西林科院基本科研业务费项目(201419)
【分类号】：S791.248
【正文快照】： 针叶树可分泌大量有特殊气味的树脂,也称之为松脂,是松树生理代谢的次生产物,也是重要的工业原料,长期以来为人们所研究和开发利用[1]。全世界约有20种产脂力较高的松树被用作主要采脂树种,马尾松(Pinus massoniana)是中国最主要的采脂树种,有90%以上的松脂采自马尾松[2~3]。

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3 刘羽;赵传志;李长生;李翠;王兴军;;花生HIR基因的克隆表达与进化分析[J];山东农业科学;2014年05期

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5 刘文荣;张木清;;抑制性消减杂交技术在植物基因克隆中的应用[J];亚热带农业研究;2006年02期

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本文编号：849015