巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析

发布时间：2017-09-30 21:25

  本文关键词：巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析

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【摘要】：钙/钙调素依赖型蛋白激酶(CCa MK,calcium-and calmodulin-dependent protein kinase)是一种钙离子结合蛋白,在钙信号传导过程中起重要作用。本研究以已发表的CCa MK序列作为检索序列,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,鉴定得到6个CCa MK基因,其中包括一个橡胶树CCa MK基因,命名为Hb CCa MK1。序列分析发现:5种植物的CCa MK氨基酸序列同源性较高,为73%~94%。基因结构分析发现,Hb CCa MK1和所分析的其他植物CCa MK一样均,含有6个内含子、1个蛋白激酶结构域和3个EF-hand结构域;从结构和进化上看,Hb CCa MK1和蓖麻、木薯2种植物的CCa MK具有较近的亲缘关系;在表达方面,Hb CCa MK1在橡胶树根中表达丰度最高,其次为树叶和花;另外,Hb CCa MK1的表达还与叶片发育、真菌侵染和低温胁迫有关。
【作者单位】： 中国热带农业科学院橡胶研究所;海南大学农学院;
【关键词】： 巴西橡胶树 CCaMK 基因家族 结构与进化 表达分析
【基金】：国家自然科学基金项目(No.31400565)
【分类号】：S794.1
【正文快照】： 所有生物都依赖于复杂的信号传递网络来调控自身代谢和对环境的适应性。在众多信号传递途径中,钙离子作为细胞内第二信使发挥着重要作用[1-3]。一些钙离子感受器或钙离子结合蛋白能够识别瞬间2肖小虎(1982~),男,博士,主要研究方向为植物分子生物学。3通讯作者,E-mail:chaorong

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本文编号：950493