苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选
本文关键词:苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选
更多相关文章: CodY 靶基因 Avi-tag技术 苏云金芽胞杆菌 生物素 调控
【摘要】:【目的】利用Avi-tag和Pulldown技术建立体外靶基因筛选的新方法,在苏云金芽胞杆菌YBT-1520基因组范围内进行体外高通量筛选转录调控因子CodY的靶基因,为深入研究CodY在苏云金芽胞杆菌中的功能及调控网络打下基础。【方法】用Avi-tag技术对CodY蛋白进行体外生物素标记,酶切苏云金芽胞杆菌YBT-1520总DNA并在两端加上便于测序的adapter序列,用链霉亲和素树脂筛选与CodY蛋白相互作用的靶基因。【结果】在苏云金芽胞杆菌中得到了46条CodY可以直接作用的靶序列,分析发现CodY在苏云金芽胞杆菌中主要调控氨基酸代谢、糖代谢、脂肪酸代谢、转运、调控、DNA修复、双组份调控等的转录。【结论】本研究采用的Avi-tag技术具有特异性强、操作简单、成本低等优势,为转录因子体外靶序列的高通量筛选提供新的方法;苏云金芽胞杆菌中CodY靶基因的筛选为其他微生物中CodY的功能研究打下基础。
【作者单位】: 华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室;
【关键词】: CodY 靶基因 Avi-tag技术 苏云金芽胞杆菌 生物素 调控
【基金】:国家自然科学基金(30900016) 湖北省自然科学基金(2014CFB931)~~
【分类号】:Q933
【正文快照】: 苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称转录调控因子3 4][。研究发现苏云金芽胞杆菌Bt)是杆状、革兰氏阳性菌,在细胞稳定期产芽胞cod Y突变株不能形成完整的芽胞和伴胞晶体,和杀虫晶体蛋白(Insecticidal crystal proteins,Cod Y蛋白作为全局性转录调控因子在Bt中主要调
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